转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 112 / 149 下载 TSV

上一页 112 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G001027 Chr06 NC_080392.1:10180477-10180487promoter 内 885-895 bp - 3106 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 10183593-10190866(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAGA
SmilChr01G003659 Chr01 NC_080387.1:55023492-55023502promoter 内 868-878 bp - 3123 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 55019597-55020369(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTTAGCTGTCA
SmilChr03G000762 Chr03 NC_080389.1:8719179-8719189promoter 内 865-875 bp + 3126 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 8714701-8716053(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr01G001482 Chr01 NC_080387.1:28594267-28594277promoter 内 858-868 bp - 3133 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 28597410-28598474(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr02G004161 Chr02 NC_080388.1:63932421-63932431promoter 内 857-867 bp + 3134 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 63935565-63940700(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTTAGCTGTCA
SmilChr05G003916 Chr05 NC_080391.1:52883703-52883713promoter 内 839-849 bp - 3152 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 52878754-52880551(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTAAGCTGTCC
SmilChr05G000649 Chr05 NC_080391.1:4917531-4917541promoter 内 828-838 bp - 3163 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 4911563-4914368(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTTAGCTGTCA
SmilChr05G000130 Chr05 NC_080391.1:1059482-1059492promoter 内 807-817 bp + 3184 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 1053902-1056298(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr02G004292 Chr02 NC_080388.1:65274070-65274080promoter 内 752-762 bp + 3239 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 65269765-65270831(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr06G002639 Chr06 NC_080392.1:37997165-37997175promoter 内 733-743 bp - 3258 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 38000433-38001640(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr05G003186 Chr05 NC_080391.1:40764964-40764974promoter 内 730-740 bp - 3261 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 40768235-40775102(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAGA
SmilChr01G003019 Chr01 NC_080387.1:49213564-49213574promoter 内 689-699 bp + 3302 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 49208276-49210262(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTAC
SmilChr02G003009 Chr02 NC_080388.1:50725353-50725363promoter 内 633-643 bp - 3358 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 50718824-50721995(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTTAGCTGTCA
SmilChr02G001276 Chr02 NC_080388.1:23400561-23400571promoter 内 628-638 bp + 3363 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 23403934-23411765(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTAA
SmilChr07G001830 Chr07 NC_080393.1:15780923-15780933promoter 内 626-636 bp + 3365 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 15784298-15792016(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTAA
SmilChr01G000314 Chr01 NC_080387.1:6061620-6061630promoter 内 607-617 bp - 3384 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 6065014-6066013(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr04G002079 Chr04 NC_080390.1:33573967-33573977promoter 内 607-617 bp - 3384 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 33561589-33570583(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTTAGCTGTCA
SmilChr02G004247 Chr02 NC_080388.1:64655652-64655662promoter 内 586-596 bp + 3405 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 64659067-64663174(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTTAGCTGTCA
SmilChr01G000035 Chr01 NC_080387.1:568542-568552promoter 内 585-595 bp - 3406 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 571958-572815(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr07G003194 Chr07 NC_080393.1:34072671-34072681promoter 内 571-581 bp + 3420 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 34068249-34069251(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr02G000057 Chr02 NC_080388.1:742015-742025promoter 内 559-569 bp - 3432 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 745457-746379(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr03G001610 Chr03 NC_080389.1:20496547-20496557promoter 内 533-543 bp + 3458 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 20492099-20493089(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr03G002601 Chr03 NC_080389.1:41297807-41297817promoter 内 426-436 bp + 3565 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 41301382-41303904(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTAA
SmilChr05G000623 Chr05 NC_080391.1:4702648-4702658promoter 内 370-380 bp + 3621 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 4706279-4715947(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATGAGCTGTCG
SmilChr03G002075 Chr03 NC_080389.1:31722499-31722509promoter 内 323-333 bp - 3668 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 31726177-31727992(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr04G001815 Chr04 NC_080390.1:29642140-29642150promoter 内 316-326 bp + 3675 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 29645825-29649899(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATGAGCTGTCG
SmilChr01G002312 Chr01 NC_080387.1:40114864-40114874promoter 内 286-296 bp + 3705 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 40109167-40111159(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGAT
SmilChr07G002747 Chr07 NC_080393.1:26997376-26997386promoter 内 269-279 bp + 3722 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 26991908-26993654(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr03G004075 Chr03 NC_080389.1:59705883-59705893promoter 内 214-224 bp + 3777 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 59699018-59702106(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGAT
SmilChr02G004319 Chr02 NC_080388.1:65504167-65504177promoter 内 164-174 bp - 3827 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 65508004-65510566(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCAT
SmilChr04G003767 Chr04 NC_080390.1:53894721-53894731promoter 内 146-156 bp + 3845 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 53898576-53900830(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTAA
SmilChr06G000054 Chr06 NC_080392.1:432906-432916promoter 内 94-104 bp - 3897 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 436813-439893(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr04G001551 Chr04 NC_080390.1:25684801-25684811promoter 内 34-44 bp + 3957 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 25688768-25694071(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTAA
SmilChr03G001354 Chr03 NC_080389.1:15907345-15907355promoter 内 11-21 bp + 3980 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 15901754-15903365(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr02G002273 Chr02 NC_080388.1:40197141-40197151promoter 内 3630-3640 bp + 361 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 40197512-40198624(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGAT
SmilChr05G001365 Chr05 NC_080391.1:12133153-12133163promoter 内 3003-3013 bp - 988 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 12131198-12132165(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGAT
SmilChr03G004577 Chr03 NC_080389.1:63662585-63662595promoter 内 2973-2983 bp - 1018 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 63658036-63661567(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCT
SmilChr02G003332 Chr02 NC_080388.1:54562419-54562429promoter 内 2567-2577 bp + 1424 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 54563853-54572590(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAAAGCTGTCC
SmilChr03G000855 Chr03 NC_080389.1:9772805-9772815promoter 内 2276-2286 bp + 1715 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 9768373-9771090(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTT
SmilChr05G001917 Chr05 NC_080391.1:19429006-19429016promoter 内 2068-2078 bp + 1923 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 19430939-19433423(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGAT
SmilChr02G000586 Chr02 NC_080388.1:8428927-8428937promoter 内 1678-1688 bp - 2313 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 8431250-8434837(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTT
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SmilChr04G002071 Chr04 NC_080390.1:33465834-33465844promoter 内 1547-1557 bp + 2444 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 33459519-33463390(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTT
SmilChr03G002064 Chr03 NC_080389.1:31497950-31497960promoter 内 1272-1282 bp - 2719 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 31500679-31503818(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTT
SmilChr03G000661 Chr03 NC_080389.1:7402573-7402583promoter 内 1220-1230 bp + 2771 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 7396237-7399802(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTT
SmilChr07G002986 Chr07 NC_080393.1:30444054-30444064promoter 内 1138-1148 bp + 2853 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 30438147-30441201(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTT
SmilChr07G003080 Chr07 NC_080393.1:32443522-32443532promoter 内 1084-1094 bp + 2907 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 32437804-32440615(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTT
SmilChr05G003428 Chr05 NC_080391.1:45520280-45520290promoter 内 1052-1062 bp + 2939 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 45514433-45517341(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTT
SmilChr06G001623 Chr06 NC_080392.1:18086492-18086502promoter 内 1047-1057 bp + 2944 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 18080625-18083548(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTT
SmilChr06G002762 Chr06 NC_080392.1:40212721-40212731promoter 内 1039-1049 bp - 2952 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 40215683-40218540(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTT