靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。
下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。
| 转录因子 ID | Family | Motifs | 候选靶基因 | 候选位点 | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|
| C2H2 | 1MP00592 |
8519 | 9901 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00592 |
8519 | 9901 | 查靶基因 | |
| ARR-B | 1MP00010 |
8344 | 9778 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00059 |
8333 | 9940 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00296 |
8304 | 9873 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00114 |
8151 | 9897 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00408 |
8149 | 9902 | 查靶基因 | |
| Nin-like | 1MP00449 |
8096 | 9453 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00209 |
8083 | 9910 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00627 |
8075 | 9835 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00450 |
8044 | 9901 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00558 |
8044 | 9762 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00096 |
8019 | 9914 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00476 |
7981 | 9904 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00221 |
7965 | 9903 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00069 |
7882 | 9917 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00406 |
7839 | 9917 | 查靶基因 | |
| TALE | 1MP00670 |
7758 | 9906 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00555 |
7648 | 9805 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00021 |
7629 | 9812 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00132 |
7583 | 9926 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00609 |
7575 | 9941 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00529 |
7559 | 9247 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00510 |
7526 | 9799 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00058 |
7440 | 9855 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00303 |
7416 | 9868 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00565 |
7412 | 9785 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00026 |
7408 | 9854 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00071 |
7408 | 9764 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00033 |
7406 | 9827 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00074 |
7396 | 9969 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00216 |
7342 | 9832 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00539 |
7338 | 9848 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00574 |
7302 | 9846 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00464 |
7299 | 9864 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00315 |
7291 | 9567 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00525 |
7235 | 9838 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00171 |
7182 | 9833 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00506 |
7173 | 9818 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00272 |
7172 | 9889 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00184 |
7147 | 9840 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00647 |
7133 | 9953 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00485 |
7130 | 8059 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00134 |
7078 | 8676 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00312 |
7006 | 8490 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00564 |
6984 | 9893 | 查靶基因 | |
| G2-like | 1MP00022 |
6959 | 9720 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00040 |
6920 | 9919 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00151 |
6907 | 9976 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00455 |
6900 | 9792 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00482 |
6899 | 8940 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00291 |
6894 | 9321 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00307 |
6893 | 9755 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00195 |
6878 | 9832 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00388 |
6870 | 9774 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00318 |
6849 | 9413 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00633 |
6833 | 8026 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00308 |
6805 | 9826 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00082 |
6784 | 9435 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00080 |
6766 | 9850 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00028 |
6764 | 9024 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00191 |
6736 | 9690 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00081 |
6729 | 9942 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00500 |
6697 | 9681 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00452 |
6671 | 7783 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00531 |
6663 | 9784 | 查靶基因 | |
| HD-ZIP | 1MP00200 |
6661 | 9930 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00034 |
6653 | 9929 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00660 |
6653 | 9929 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00055 |
6638 | 9685 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00634 |
6619 | 7771 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00035 |
6618 | 9903 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00568 |
6611 | 9696 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00039 |
6610 | 9936 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00284 |
6552 | 9774 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00422 |
6535 | 9791 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00153 |
6534 | 9706 | 查靶基因 | |
| YABBY | 1MP00620 |
6504 | 9844 | 查靶基因 | |
| TCP | 1MP00169 |
6498 | 7295 | 查靶基因 | |
| G2-like | 1MP00252 |
6478 | 9780 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00108 |
6458 | 9810 | 查靶基因 | |
| TCP | 1MP00062 |
6454 | 7249 | 查靶基因 | |
| RAV | 1MP00024 |
6450 | 9853 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00167 |
6439 | 9756 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00416 |
6433 | 9716 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00608 |
6398 | 9817 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00240 |
6368 | 9978 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00607 |
6362 | 9718 | 查靶基因 | |
| Dof | 1MP00402 |
6278 | 9875 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00409 |
6252 | 8429 | 查靶基因 | |
| GRAS | 1MP00611 |
6232 | 9807 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00648 |
6170 | 9939 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00120 |
6144 | 7514 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00251 |
6140 | 9713 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00077 |
6125 | 9815 | 查靶基因 | |
| GATA | 1MP00130 |
6015 | 9821 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00508 |
5979 | 7481 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00260 |
5932 | 9706 | 查靶基因 | |
| HD-ZIP | 1MP00013 |
5927 | 9712 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00299 |
5919 | 9699 | 查靶基因 |
输入: SmilChr02G003399; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90
| TF ID | 新 Gene ID | 家族 | Protein | Motif | 共识序列 |
|---|---|---|---|---|---|
SMil_00009551-RA_Salv |
SmilChr02G003399 |
ERF | XP_057793859.1 |
MP00240 |
CCACCTCCACCGCCA |
9978 个结合位点 6368 个候选靶基因 第 116 / 128 下载 TSV
| 靶基因 | 染色体 | 最佳结合位点 | 链方向 | 靶基因上游距离 | 结合可能性 | 启动子命中位点 | 基因区间 | TF | Motif | 匹配序列 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SmilChr05G002050 |
Chr05 | NC_080391.1:21359716-21359730promoter 内 684-698 bp |
+ | 3303 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 21363033-21363104(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGTCCGTCACCGCCT |
SmilChr02G002356 |
Chr02 | NC_080388.1:41348307-41348321promoter 内 657-671 bp |
+ | 3330 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 41344284-41344977(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
GGGCGGTGGCCGGTG |
SmilChr02G002291 |
Chr02 | NC_080388.1:40432020-40432034promoter 内 645-659 bp |
- | 3342 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 40435376-40439292(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
AAACGGTGGAGATGG |
SmilChr07G002404 |
Chr07 | NC_080393.1:22388223-22388237promoter 内 622-636 bp |
- | 3365 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 22391602-22394105(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
TGCCGGTGGAGGGTG |
SmilChr02G000868 |
Chr02 | NC_080388.1:14902257-14902271promoter 内 561-575 bp |
+ | 3426 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 14905697-14905783(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CCTCCTCCACCATCA |
SmilChr08G003170 |
Chr08 | NC_080394.1:32377383-32377397promoter 内 530-544 bp |
+ | 3457 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 32371880-32373926(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
TGCCGGTGGAGGGTG |
SmilChr06G001093 |
Chr06 | NC_080392.1:10933298-10933312promoter 内 527-541 bp |
- | 3460 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 10936772-10939171(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
ACGCGGTGGCTGTGG |
SmilChr01G002564 |
Chr01 | NC_080387.1:43767821-43767835promoter 内 505-519 bp |
- | 3482 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 43760740-43764339(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
GCGCCAACACCGCCG |
SmilChr07G001790 |
Chr07 | NC_080393.1:15246010-15246024promoter 内 494-508 bp |
+ | 3493 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 15236520-15242517(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
AGGCGGTGGCTAGGC |
SmilChr05G004091 |
Chr05 | NC_080391.1:54744968-54744982promoter 内 493-507 bp |
- | 3494 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 54748476-54751564(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
TGATGGTGGAGGAGG |
SmilChr01G001705 |
Chr01 | NC_080387.1:31486898-31486912promoter 内 485-499 bp |
+ | 3502 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 31481695-31483396(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGGCGGTGGATCTGA |
SmilChr01G002997 |
Chr01 | NC_080387.1:48917805-48917819promoter 内 478-492 bp |
+ | 3509 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 48921328-48923133(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGCCAACCACCGCCT |
SmilChr02G004213 |
Chr02 | NC_080388.1:64385901-64385915promoter 内 438-452 bp |
- | 3549 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 64380776-64382352(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
TCACCATCACCGCCA |
SmilChr07G004474 |
Chr07 | NC_080393.1:57287439-57287453promoter 内 403-417 bp |
- | 3584 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 57291037-57297593(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
TGCCGGTGGAGGGTG |
SmilChr06G000759 |
Chr06 | NC_080392.1:7034189-7034203promoter 内 327-341 bp |
- | 3660 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 7029086-7030529(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CACCCTCCACCGGCA |
SmilChr05G001015 |
Chr05 | NC_080391.1:8319547-8319561promoter 内 317-331 bp |
- | 3670 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 8313665-8315877(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CCTGGGCCACCGCCC |
SmilChr01G003675 |
Chr01 | NC_080387.1:55183585-55183599promoter 内 273-287 bp |
- | 3714 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 55177429-55179871(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
ACGCCTCCACCACCT |
SmilChr01G003966 |
Chr01 | NC_080387.1:58096846-58096860promoter 内 208-222 bp |
+ | 3779 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 58100639-58105464(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGCCAACCACCGCCT |
SmilChr08G002764 |
Chr08 | NC_080394.1:27272711-27272725promoter 内 168-182 bp |
- | 3819 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 27267915-27268892(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CACCCTCCACCGGCA |
SmilChr07G001951 |
Chr07 | NC_080393.1:16988393-16988407promoter 内 129-143 bp |
- | 3858 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 16983713-16984535(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CTCTCTCCACCGCCC |
SmilChr03G001753 |
Chr03 | NC_080389.1:23805698-23805712promoter 内 100-114 bp |
+ | 3887 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 23809599-23813666(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CATCAGCCACCGCTA |
SmilChr01G004832 |
Chr01 | NC_080387.1:66451976-66451990promoter 内 74-88 bp |
+ | 3913 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 66455903-66457952(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CTCTCTCCACCGCCC |
SmilChr05G000655 |
Chr05 | NC_080391.1:4932666-4932680promoter 内 72-86 bp |
- | 3915 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 4936595-4938859(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
AACCGGCGGAGGTGG |
SmilChr01G004412 |
Chr01 | NC_080387.1:62239854-62239868promoter 内 48-62 bp |
- | 3939 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 62243807-62244992(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGGCGGTGGATCTGA |
SmilChr01G005353 |
Chr01 | NC_080387.1:70768549-70768563promoter 内 44-58 bp |
+ | 3943 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 70763380-70764606(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
GGGCGGTGGAGAGAG |
SmilChr02G000639 |
Chr02 | NC_080388.1:9682833-9682847promoter 内 36-50 bp |
+ | 3951 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 9674435-9678882(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGGCGGTGGATCTGA |
SmilChr01G004681 |
Chr01 | NC_080387.1:64883185-64883199promoter 内 24-38 bp |
+ | 3963 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 64887162-64888454(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
TCACCATCACCGCCA |
SmilChr04G003509 |
Chr04 | NC_080390.1:51469579-51469593promoter 内 13-27 bp |
+ | 3974 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 51460539-51465605(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
GGGCGGTGGAGAGAG |
SmilChr05G000734 |
Chr05 | NC_080391.1:5597838-5597852promoter 内 3677-3691 bp |
+ | 310 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 2 | 5593661-5597528(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
AGGCGGTGGCGCTTT |
SmilChr05G004362 |
Chr05 | NC_080391.1:57169920-57169934promoter 内 3389-3403 bp |
+ | 598 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 2 | 57169190-57169322(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGGCGGTGGAAAGGA |
SmilChr05G004361 |
Chr05 | NC_080391.1:57169920-57169934promoter 内 3151-3165 bp |
+ | 836 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 2 | 57168951-57169084(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGGCGGTGGAAAGGA |
SmilChr01G004847 |
Chr01 | NC_080387.1:66619031-66619045promoter 内 1482-1496 bp |
+ | 2505 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 2 | 66621550-66625582(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
GCACCTCCGCCGCAT |
SmilChr07G002645 |
Chr07 | NC_080393.1:25593400-25593414promoter 内 1437-1451 bp |
- | 2550 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 2 | 25588789-25590850(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
GCAGATCCACCGCCA |
SmilChr07G001428 |
Chr07 | NC_080393.1:11104992-11105006promoter 内 278-292 bp |
+ | 3709 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 2 | 11099023-11101283(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
AGGCGGTGGAAATGC |
SmilChr04G000613 |
Chr04 | NC_080390.1:6919219-6919233promoter 内 111-125 bp |
+ | 3876 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 2 | 6923109-6923948(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CATCCTCCACCACCA |
SmilChr08G002217 |
Chr08 | NC_080394.1:20174560-20174574promoter 内 3973-3987 bp |
- | 14 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 20173422-20174546(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
TAGACTCCACCGCCG |
SmilChr03G001439 |
Chr03 | NC_080389.1:17099455-17099469promoter 内 3938-3952 bp |
+ | 49 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 17098015-17099406(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
ATGCGGCGGAGGTGC |
SmilChr02G002292 |
Chr02 | NC_080388.1:40457176-40457190promoter 内 3925-3939 bp |
- | 62 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 40457252-40460983(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
TGGCGGTGGAGAGAA |
SmilChr06G000405 |
Chr06 | NC_080392.1:3290803-3290817promoter 内 3909-3923 bp |
+ | 78 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 3290895-3308856(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CCACTTACACCGCCG |
SmilChr05G004244 |
Chr05 | NC_080391.1:56251044-56251058promoter 内 3827-3841 bp |
- | 160 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 56247092-56250884(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGTCCTGCACCGCCG |
SmilChr07G000060 |
Chr07 | NC_080393.1:275728-275742promoter 内 3794-3808 bp |
+ | 193 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 270185-275535(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGGCGGTGGAAAGGA |
SmilChr06G001661 |
Chr06 | NC_080392.1:18891924-18891938promoter 内 3712-3726 bp |
+ | 275 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 18890472-18891649(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGTCGGTGGAGCCCG |
SmilChr02G000431 |
Chr02 | NC_080388.1:5583432-5583446promoter 内 3696-3710 bp |
- | 291 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 5582653-5583141(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CCATTCCCACCGCCA |
SmilChr03G003416 |
Chr03 | NC_080389.1:52507115-52507129promoter 内 3672-3686 bp |
- | 315 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 52507444-52508965(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
TGGCGGTGGAGAGTC |
SmilChr05G003507 |
Chr05 | NC_080391.1:46832893-46832907promoter 内 3672-3686 bp |
+ | 315 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 46833222-46833686(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CCATTCCCACCGCCA |
SmilChr05G003511 |
Chr05 | NC_080391.1:46894439-46894453promoter 内 3672-3686 bp |
+ | 315 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 46894768-46895232(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CCATTCCCACCGCCA |
SmilChr07G003507 |
Chr07 | NC_080393.1:39951990-39952004promoter 内 3672-3686 bp |
- | 315 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 39951211-39951675(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CCATTCCCACCGCCA |
SmilChr08G002117 |
Chr08 | NC_080394.1:19042082-19042096promoter 内 3672-3686 bp |
+ | 315 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 19042411-19042875(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CCATTCCCACCGCCA |
SmilChr05G003943 |
Chr05 | NC_080391.1:53198223-53198237promoter 内 3619-3633 bp |
+ | 368 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 53198605-53200335(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CCAGTCCCACCGCCG |
SmilChr04G001742 |
Chr04 | NC_080390.1:28698845-28698859promoter 内 3563-3577 bp |
+ | 424 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 28694936-28698421(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
AGGCGGTGGCGAGCA |