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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G002503; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027448-RA_Salv SmilChr03G002503 MYB XP_057801356.1 MP00482 AAAATATGACCGTTG

可能结合的靶基因

8940 个结合位点 6899 个候选靶基因 第 116 / 138 下载 TSV

上一页 116 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000861 Chr02 NC_080388.1:14783295-14783309promoter 内 1881-1895 bp - 2106 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 14785415-14786777(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAACGGTCCATATGA
SmilChr01G003144 Chr01 NC_080387.1:50267675-50267689promoter 内 1820-1834 bp - 2167 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 50269856-50275081(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTAACACGGA
SmilChr01G001658 Chr01 NC_080387.1:30646121-30646135promoter 内 1794-1808 bp + 2193 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 30648328-30650655(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TGTCTCCAACCGTTG
SmilChr05G002442 Chr05 NC_080391.1:26906731-26906745promoter 内 1778-1792 bp + 2209 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 26908954-26911660(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TACTAAAAACCGTTG
SmilChr06G002249 Chr06 NC_080392.1:31921075-31921089promoter 内 1734-1748 bp + 2253 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 31915698-31918822(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAACGGTCCAAAGGA
SmilChr06G002041 Chr06 NC_080392.1:26693419-26693433promoter 内 1705-1719 bp + 2282 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 26695715-26697224(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TTGACGAAACCGTTG
SmilChr08G003543 Chr08 NC_080394.1:38074497-38074511promoter 内 1692-1706 bp - 2295 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 38068454-38072202(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TGCACGAGACCGTTG
SmilChr03G002843 Chr03 NC_080389.1:44976021-44976035promoter 内 1671-1685 bp + 2316 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 44971882-44973705(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAGCGGTCATTATTT
SmilChr03G004424 Chr03 NC_080389.1:62401444-62401458promoter 内 1607-1621 bp + 2380 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 62396982-62399064(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTACTTGCTG
SmilChr01G001443 Chr01 NC_080387.1:28136961-28136975promoter 内 1503-1517 bp - 2484 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 28133035-28134477(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TTTCTTCAACCGTTG
SmilChr08G004952 Chr08 NC_080394.1:58381595-58381609promoter 内 1497-1511 bp + 2490 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 58377994-58379105(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CTACGGTCAGATTGG
SmilChr05G001550 Chr05 NC_080391.1:14236891-14236905promoter 内 1466-1480 bp - 2521 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 14232927-14234370(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TTTCTTCAACCGTTG
SmilChr04G002410 Chr04 NC_080390.1:38689887-38689901promoter 内 1465-1479 bp - 2522 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 38685772-38687365(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TTTCTTCAACCGTTG
SmilChr04G003995 Chr04 NC_080390.1:55335504-55335518promoter 内 1419-1433 bp - 2568 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 55330438-55332936(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAATAATGACCGTAA
SmilChr03G000649 Chr03 NC_080389.1:7233575-7233589promoter 内 1373-1387 bp - 2614 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 7229902-7230961(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TTGCTGCAACCGTTG
SmilChr08G004194 Chr08 NC_080394.1:51336367-51336381promoter 内 1339-1353 bp + 2648 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 51329897-51333719(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCTGAGGTT
SmilChr08G002734 Chr08 NC_080394.1:26975992-26976006promoter 内 1309-1323 bp + 2678 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 26972012-26973314(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAACGGTCAACTCAC
SmilChr04G001494 Chr04 NC_080390.1:24499224-24499238promoter 内 1239-1253 bp + 2748 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 24501986-24503327(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TTTCTTCAACCGTTG
SmilChr04G002116 Chr04 NC_080390.1:34162996-34163010promoter 内 1238-1252 bp + 2749 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 34159178-34160247(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTTGAACCCT
SmilChr06G000949 Chr06 NC_080392.1:9139996-9140010promoter 内 1202-1216 bp + 2785 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 9136268-9137211(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAACGGTCGTTGTTC
SmilChr05G001002 Chr05 NC_080391.1:8181996-8182010promoter 内 1187-1201 bp + 2800 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 8184810-8189177(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CGTATCGGACCGTTT
SmilChr06G002905 Chr06 NC_080392.1:41857928-41857942promoter 内 1166-1180 bp + 2821 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 41853306-41855107(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCCGGGCCT
SmilChr02G004690 Chr02 NC_080388.1:69237385-69237399promoter 内 1131-1145 bp + 2856 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 69212465-69234529(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAACGGTCGAATAGA
SmilChr02G002996 Chr02 NC_080388.1:50652209-50652223promoter 内 1000-1014 bp + 2987 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 50648417-50649222(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAACGGTCCTTTGTT
SmilChr01G003543 Chr01 NC_080387.1:54020345-54020359promoter 内 982-996 bp + 3005 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 54014397-54017340(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAGCGGTCATTTTGG
SmilChr05G000939 Chr05 NC_080391.1:7559235-7559249promoter 内 948-962 bp + 3039 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 7562288-7564893(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CGTATCGGACCGTTT
SmilChr02G003942 Chr02 NC_080388.1:61558552-61558566promoter 内 912-926 bp - 3075 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 61561641-61565712(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTACAGTGAT
SmilChr03G003000 Chr03 NC_080389.1:46816546-46816560promoter 内 708-722 bp - 3279 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 46819839-46820705(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTACACTCGG
SmilChr06G000444 Chr06 NC_080392.1:3613167-3613181promoter 内 681-695 bp + 3306 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 3616487-3616558(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TCGAAAATACCGTTG
SmilChr04G002118 Chr04 NC_080390.1:34162996-34163010promoter 内 592-606 bp + 3395 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 34166405-34170446(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AGGGTTCAACCGTTG
SmilChr06G000445 Chr06 NC_080392.1:3613167-3613181promoter 内 496-510 bp + 3491 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 3616672-3616743(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TCGAAAATACCGTTG
SmilChr05G000923 Chr05 NC_080391.1:7333093-7333107promoter 内 476-490 bp - 3511 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 7336618-7339663(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCCGGGCCT
SmilChr03G004078 Chr03 NC_080389.1:59716617-59716631promoter 内 377-391 bp - 3610 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 59712399-59713007(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 GGACAAAAACCGTTG
SmilChr03G004145 Chr03 NC_080389.1:60280237-60280251promoter 内 333-347 bp + 3654 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 60283905-60288534(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 GGACAAAAACCGTTG
SmilChr05G004135 Chr05 NC_080391.1:55344489-55344503promoter 内 267-281 bp - 3720 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 55348223-55349736(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTATTCATCA
SmilChr02G003581 Chr02 NC_080388.1:56977106-56977120promoter 内 175-189 bp + 3812 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 56970000-56973294(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTTGCAGCAA
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SmilChr01G002613 Chr01 NC_080387.1:44397121-44397135promoter 内 3397-3411 bp - 590 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 44391884-44396531(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAGGGGAGACCGTTG
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SmilChr08G003666 Chr08 NC_080394.1:40481064-40481078promoter 内 2039-2053 bp + 1948 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 40475763-40479116(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAACGGTCTTTCATC
SmilChr01G002047 Chr01 NC_080387.1:36247171-36247185promoter 内 1653-1667 bp - 2334 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 36242712-36244837(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CCCCAGCGACCGTTG
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SmilChr05G001380 Chr05 NC_080391.1:12308981-12308995promoter 内 3926-3940 bp + 61 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 12307303-12308920(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAACGGTCAAATGGA
SmilChr07G001162 Chr07 NC_080393.1:8695531-8695545promoter 内 3906-3920 bp - 81 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 8690311-8695450(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TTCTAAAGACCGTTG