转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 118 / 149 下载 TSV

上一页 118 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005186 Chr02 NC_080388.1:73175987-73175997promoter 内 3863-3873 bp - 128 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 73172860-73175859(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCC
SmilChr03G003429 Chr03 NC_080389.1:52629684-52629694promoter 内 3863-3873 bp + 128 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 52629822-52630371(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAT
SmilChr02G004847 Chr02 NC_080388.1:70609732-70609742promoter 内 3821-3831 bp + 170 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 70609912-70613661(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTAG
SmilChr02G005194 Chr02 NC_080388.1:73209350-73209360promoter 内 3808-3818 bp - 183 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 73208114-73209167(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCTAGCTGTCT
SmilChr01G001930 Chr01 NC_080387.1:34472636-34472646promoter 内 3787-3797 bp + 204 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 34471363-34472432(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGTG
SmilChr01G001931 Chr01 NC_080387.1:34472636-34472646promoter 内 3724-3734 bp + 267 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 34472913-34474261(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTAG
SmilChr01G001345 Chr01 NC_080387.1:26705268-26705278promoter 内 3701-3711 bp - 290 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 26705568-26708801(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTATC
SmilChr01G005715 Chr01 NC_080387.1:73359564-73359574promoter 内 3624-3634 bp + 367 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 73356046-73359197(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGA
SmilChr01G003840 Chr01 NC_080387.1:56744013-56744023promoter 内 3605-3615 bp + 386 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 56744409-56745452(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAC
SmilChr07G002360 Chr07 NC_080393.1:21923485-21923495promoter 内 3605-3615 bp - 386 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 21922056-21923099(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAC
SmilChr04G000072 Chr04 NC_080390.1:669557-669567promoter 内 3506-3516 bp + 485 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 670052-670942(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCTAGCTGTCT
SmilChr07G000285 Chr07 NC_080393.1:1851033-1851043promoter 内 3480-3490 bp - 511 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 1851554-1854430(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGA
SmilChr07G002095 Chr07 NC_080393.1:19078115-19078125promoter 内 3478-3488 bp - 513 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 19078638-19080561(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGA
SmilChr06G001440 Chr06 NC_080392.1:15214190-15214200promoter 内 3320-3330 bp - 671 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 15208420-15213519(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCC
SmilChr04G002654 Chr04 NC_080390.1:41946187-41946197promoter 内 3306-3316 bp - 685 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 41946882-41950074(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCGGGC
SmilChr05G001867 Chr05 NC_080391.1:18807092-18807102promoter 内 3228-3238 bp - 763 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 18807865-18810753(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGGT
SmilChr05G002148 Chr05 NC_080391.1:22699879-22699889promoter 内 3098-3108 bp + 893 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 22656765-22698986(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGGT
SmilChr05G003391 Chr05 NC_080391.1:44950522-44950532promoter 内 3071-3081 bp - 920 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 44947761-44949602(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAT
SmilChr07G000400 Chr07 NC_080393.1:2761779-2761789promoter 内 3026-3036 bp + 965 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 2762754-2766447(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAT
SmilChr01G001826 Chr01 NC_080387.1:33221565-33221575promoter 内 2993-3003 bp + 998 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 33201879-33220567(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGTG
SmilChr05G003244 Chr05 NC_080391.1:41771914-41771924promoter 内 2964-2974 bp - 1027 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 41769709-41770887(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCTAGCTGTCT
SmilChr03G003275 Chr03 NC_080389.1:50695745-50695755promoter 内 2961-2971 bp - 1030 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 50696785-50699161(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGGT
SmilChr05G003518 Chr05 NC_080391.1:46984932-46984942promoter 内 2907-2917 bp + 1084 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 46986026-46987370(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCTAGCTGTCT
SmilChr01G000926 Chr01 NC_080387.1:19642627-19642637promoter 内 2895-2905 bp + 1096 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 19638550-19641531(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGA
SmilChr03G001392 Chr03 NC_080389.1:16503061-16503071promoter 内 2790-2800 bp - 1201 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 16504272-16507413(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTATC
SmilChr01G005630 Chr01 NC_080387.1:72751483-72751493promoter 内 2679-2689 bp - 1312 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 72746687-72750171(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTAG
SmilChr01G002493 Chr01 NC_080387.1:42681367-42681377promoter 内 2600-2610 bp + 1391 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 42676562-42679976(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGA
SmilChr01G004510 Chr01 NC_080387.1:63190857-63190867promoter 内 2546-2556 bp - 1445 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 63184665-63189412(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCCGCTGTCA
SmilChr04G003098 Chr04 NC_080390.1:47577027-47577037promoter 内 2454-2464 bp + 1537 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 47578574-47579306(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCTAGCTGTCT
SmilChr01G005697 Chr01 NC_080387.1:73240319-73240329promoter 内 2442-2452 bp + 1549 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 73241878-73242772(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCTAGCTGTCT
SmilChr07G001911 Chr07 NC_080393.1:16521879-16521889promoter 内 2418-2428 bp - 1573 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 16523462-16524907(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGGT
SmilChr03G001391 Chr03 NC_080389.1:16503061-16503071promoter 内 2386-2396 bp - 1605 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 16499300-16501456(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCC
SmilChr05G000034 Chr05 NC_080391.1:158134-158144promoter 内 2363-2373 bp + 1628 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 159772-162850(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCTAGCTGTCT
SmilChr03G002813 Chr03 NC_080389.1:44593450-44593460promoter 内 2232-2242 bp + 1759 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 44595219-44596953(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCTAGCTGTCT
SmilChr03G002138 Chr03 NC_080389.1:33319393-33319403promoter 内 1975-1985 bp + 2016 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 33314936-33317377(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAA
SmilChr03G003273 Chr03 NC_080389.1:50695745-50695755promoter 内 1948-1958 bp - 2043 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 50689598-50693702(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAT
SmilChr02G003970 Chr02 NC_080388.1:61879080-61879090promoter 内 1898-1908 bp + 2093 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 61876547-61876987(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGA
SmilChr01G005869 Chr01 NC_080387.1:74626618-74626628promoter 内 1877-1887 bp - 2114 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 74623630-74624504(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCTAGCTGTCT
SmilChr03G001476 Chr03 NC_080389.1:17757543-17757553promoter 内 1868-1878 bp - 2123 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 17759676-17762201(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAA
SmilChr03G000926 Chr03 NC_080389.1:10602290-10602300promoter 内 1839-1849 bp - 2152 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 10604452-10607730(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAA
SmilChr01G000601 Chr01 NC_080387.1:13070688-13070698promoter 内 1816-1826 bp + 2175 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 13065988-13068513(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAA
SmilChr01G000070 Chr01 NC_080387.1:1200574-1200584promoter 内 1810-1820 bp - 2181 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 1202765-1205423(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAA
SmilChr07G001412 Chr07 NC_080393.1:11006013-11006023promoter 内 1794-1804 bp + 2197 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 11002449-11003816(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGA
SmilChr04G001171 Chr04 NC_080390.1:17532709-17532719promoter 内 1754-1764 bp - 2237 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 17534956-17537932(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAA
SmilChr02G002745 Chr02 NC_080388.1:47436775-47436785promoter 内 1745-1755 bp - 2246 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 47433057-47434529(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTAAGCTGTCG
SmilChr06G002096 Chr06 NC_080392.1:27888008-27888018promoter 内 1725-1735 bp + 2266 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 27890284-27891927(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCCGCTGTCA
SmilChr06G002306 Chr06 NC_080392.1:33295692-33295702promoter 内 1648-1658 bp - 2343 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 33298045-33300441(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAA
SmilChr05G002326 Chr05 NC_080391.1:25091214-25091224promoter 内 1598-1608 bp + 2393 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 25084366-25088821(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGGT
SmilChr05G002330 Chr05 NC_080391.1:25157410-25157420promoter 内 1524-1534 bp + 2467 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 25150749-25154943(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGGT
SmilChr03G004182 Chr03 NC_080389.1:60537154-60537164promoter 内 1497-1507 bp - 2494 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 60539658-60542483(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAA