转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000094; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00015812-RA_Salv SmilChr04G000094 YABBY XP_057807365.1 MP00620 CAATCATAAT

可能结合的靶基因

9844 个结合位点 6504 个候选靶基因 第 12 / 131 下载 TSV

上一页 12 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000531 Chr02 NC_080388.1:7307753-7307762promoter 内 2204-2213 bp - 1788 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 7309550-7325735(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr02G003325 Chr02 NC_080388.1:54525459-54525468promoter 内 2191-2200 bp + 1801 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 54519341-54523658(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr01G001416 Chr01 NC_080387.1:27751390-27751399promoter 内 2166-2175 bp - 1826 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 27748842-27749564(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr01G006030 Chr01 NC_080387.1:75847684-75847693promoter 内 2033-2042 bp - 1959 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 75845074-75845725(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr02G002031 Chr02 NC_080388.1:36558578-36558587promoter 内 2017-2026 bp - 1975 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 36560562-36561959(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr01G002288 Chr01 NC_080387.1:39683993-39684002promoter 内 2001-2010 bp + 1991 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 39675208-39682002(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr01G006010 Chr01 NC_080387.1:75656045-75656054promoter 内 1976-1985 bp - 2016 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 75658070-75662073(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr03G000946 Chr03 NC_080389.1:10742353-10742362promoter 内 1900-1909 bp - 2092 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 10739515-10740261(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr03G000943 Chr03 NC_080389.1:10710444-10710453promoter 内 1898-1907 bp - 2094 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 10707604-10708350(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr02G004499 Chr02 NC_080388.1:67496791-67496800promoter 内 1845-1854 bp + 2147 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 67491753-67494644(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr02G003220 Chr02 NC_080388.1:53426669-53426678promoter 内 1782-1791 bp - 2210 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 53422811-53424459(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr01G005975 Chr01 NC_080387.1:75418164-75418173promoter 内 1772-1781 bp + 2220 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 75414077-75415944(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr02G005376 Chr02 NC_080388.1:74438523-74438532promoter 内 1703-1712 bp - 2289 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 74431320-74436234(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr02G003454 Chr02 NC_080388.1:55822439-55822448promoter 内 1644-1653 bp - 2348 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 55824796-55826600(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr01G001164 Chr01 NC_080387.1:23641284-23641293promoter 内 1638-1647 bp + 2354 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 23637805-23638930(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr01G001751 Chr01 NC_080387.1:32243549-32243558promoter 内 1533-1542 bp - 2459 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 32246017-32248666(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr01G005228 Chr01 NC_080387.1:69815797-69815806promoter 内 1527-1536 bp + 2465 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 69818271-69819493(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr01G003626 Chr01 NC_080387.1:54804208-54804217promoter 内 1523-1532 bp - 2469 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 54806686-54807969(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr02G003095 Chr02 NC_080388.1:51824140-51824149promoter 内 1437-1446 bp + 2555 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 51826704-51829362(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr03G001230 Chr03 NC_080389.1:14198098-14198107promoter 内 1419-1428 bp + 2573 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 14200680-14200786(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr01G001563 Chr01 NC_080387.1:29633685-29633694promoter 内 1328-1337 bp + 2664 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 29636358-29637532(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr01G003999 Chr01 NC_080387.1:58399067-58399076promoter 内 1286-1295 bp - 2706 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 58395409-58396361(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr01G005227 Chr01 NC_080387.1:69815797-69815806promoter 内 1235-1244 bp + 2757 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 69808976-69813040(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr01G003643 Chr01 NC_080387.1:54920654-54920663promoter 内 1225-1234 bp - 2767 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 54923430-54924421(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr01G002375 Chr01 NC_080387.1:40960562-40960571promoter 内 1188-1197 bp - 2804 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 40963375-40970669(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr02G004073 Chr02 NC_080388.1:63013502-63013511promoter 内 1150-1159 bp + 2842 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 63016353-63020836(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr02G002165 Chr02 NC_080388.1:38865746-38865755promoter 内 1128-1137 bp - 2864 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 38861903-38862882(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr01G002374 Chr01 NC_080387.1:40967166-40967175promoter 内 1035-1044 bp - 2957 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 40960406-40964209(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr01G005844 Chr01 NC_080387.1:74426229-74426238promoter 内 978-987 bp - 3014 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 74421859-74423215(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr01G002774 Chr01 NC_080387.1:46183140-46183149promoter 内 912-921 bp + 3080 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 46186229-46186729(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr01G003031 Chr01 NC_080387.1:49359129-49359138promoter 内 909-918 bp + 3083 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 49353674-49356046(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr03G000498 Chr03 NC_080389.1:5317226-5317235promoter 内 877-886 bp + 3115 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 5320350-5320955(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr03G000792 Chr03 NC_080389.1:9012445-9012454promoter 内 874-883 bp - 3118 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 9008719-9009327(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr02G003022 Chr02 NC_080388.1:50901217-50901226promoter 内 653-662 bp + 3339 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 50904565-50905437(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr01G004741 Chr01 NC_080387.1:65606077-65606086promoter 内 583-592 bp + 3409 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 65599698-65602668(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
SmilChr01G004208 Chr01 NC_080387.1:60520908-60520917promoter 内 541-550 bp - 3451 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 60524368-60527197(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
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SmilChr01G003033 Chr01 NC_080387.1:49359129-49359138promoter 内 466-475 bp + 3526 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 49362664-49366686(+) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
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SmilChr01G003702 Chr01 NC_080387.1:55409416-55409425promoter 内 95-104 bp + 3897 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 55403087-55405519(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 ATTATGATAG
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SmilChr02G000678 Chr02 NC_080388.1:10593236-10593245promoter 内 73-82 bp - 3919 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 10580733-10589317(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr01G005970 Chr01 NC_080387.1:75391714-75391723promoter 内 3884-3893 bp - 108 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 75382424-75391606(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT
SmilChr01G002806 Chr01 NC_080387.1:46605202-46605211promoter 内 3802-3811 bp - 190 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 46601773-46605012(-) SMil_00015812-RA_Salv MP00620 CTATCATAAT