转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 13 / 136 下载 TSV

上一页 13 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003394 Chr01 NC_080387.1:52658721-52658731promoter 内 1763-1773 bp + 2228 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 52660959-52662894(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGGC
SmilChr01G003954 Chr01 NC_080387.1:57918218-57918228promoter 内 1194-1204 bp + 2797 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 57921025-57976435(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGGC
SmilChr08G001771 Chr08 NC_080394.1:14914394-14914404promoter 内 771-781 bp + 3220 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 14917624-14936642(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGGC
SmilChr05G001560 Chr05 NC_080391.1:14292998-14293008promoter 内 656-666 bp - 3335 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 14296343-14296823(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGGC
SmilChr07G000846 Chr07 NC_080393.1:6031973-6031983promoter 内 643-653 bp - 3348 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 6026138-6028625(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGCA
SmilChr06G002343 Chr06 NC_080392.1:34077027-34077037promoter 内 544-554 bp - 3447 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 34080484-34095065(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGGC
SmilChr01G002909 Chr01 NC_080387.1:47798287-47798297promoter 内 176-186 bp - 3815 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 47802112-47805860(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGGG
SmilChr08G004680 Chr08 NC_080394.1:56275230-56275240promoter 内 2979-2989 bp + 1012 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 11 56273417-56274218(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr04G000284 Chr04 NC_080390.1:2604882-2604892promoter 内 2384-2394 bp + 1607 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 9 2595443-2603275(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr08G004579 Chr08 NC_080394.1:55376463-55376473promoter 内 3140-3150 bp + 851 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 8 55374841-55375612(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr03G001694 Chr03 NC_080389.1:22458209-22458219promoter 内 3707-3717 bp - 284 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 4 22458503-22458609(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr06G001665 Chr06 NC_080392.1:18933568-18933578promoter 内 737-747 bp + 3254 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 4 18929405-18930314(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr08G004678 Chr08 NC_080394.1:56275230-56275240promoter 内 86-96 bp + 3905 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 3 56268445-56271325(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr06G002227 Chr06 NC_080392.1:31418734-31418744promoter 内 2065-2075 bp + 1926 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 31420670-31421188(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCA
SmilChr08G004311 Chr08 NC_080394.1:52830878-52830888promoter 内 1440-1450 bp + 2551 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 52827496-52828327(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr06G001554 Chr06 NC_080392.1:16935480-16935490promoter 内 3256-3266 bp + 735 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 16936225-16937582(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCA
SmilChr08G003741 Chr08 NC_080394.1:42366749-42366759promoter 内 3188-3198 bp + 803 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 42367562-42370656(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCA
SmilChr03G001878 Chr03 NC_080389.1:26067216-26067226promoter 内 2834-2844 bp + 1157 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 26068383-26069999(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCA
SmilChr08G003127 Chr08 NC_080394.1:31624112-31624122promoter 内 2824-2834 bp + 1167 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 31620853-31622945(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr05G003506 Chr05 NC_080391.1:46814697-46814707promoter 内 2728-2738 bp - 1263 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 46810466-46813434(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCA
SmilChr05G003510 Chr05 NC_080391.1:46876248-46876258promoter 内 2728-2738 bp - 1263 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 46872018-46874985(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCA
SmilChr07G001033 Chr07 NC_080393.1:7546442-7546452promoter 内 2675-2685 bp + 1316 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 7541682-7545126(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr04G002537 Chr04 NC_080390.1:40601769-40601779promoter 内 2560-2570 bp + 1431 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 40603210-40606038(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCA
SmilChr02G001102 Chr02 NC_080388.1:19836014-19836024promoter 内 2463-2473 bp - 1528 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 19837552-19840447(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr04G002522 Chr04 NC_080390.1:40278227-40278237promoter 内 2376-2386 bp + 1615 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 40275153-40276612(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr03G000188 Chr03 NC_080389.1:2096903-2096913promoter 内 2337-2347 bp - 1654 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 2091044-2095249(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCA
SmilChr07G004206 Chr07 NC_080393.1:54206018-54206028promoter 内 2325-2335 bp - 1666 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 54207694-54209120(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr01G001382 Chr01 NC_080387.1:27233265-27233275promoter 内 2216-2226 bp + 1775 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 27230601-27231490(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr07G001424 Chr07 NC_080393.1:11069757-11069767promoter 内 2202-2212 bp - 1789 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 11071556-11072565(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr04G001963 Chr04 NC_080390.1:31820822-31820832promoter 内 2122-2132 bp + 1869 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 31818171-31818953(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr06G002133 Chr06 NC_080392.1:28729820-28729830promoter 内 2118-2128 bp - 1873 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 28726910-28727947(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCA
SmilChr05G003130 Chr05 NC_080391.1:39935328-39935338promoter 内 2054-2064 bp + 1937 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 39937275-39938309(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCA
SmilChr08G003863 Chr08 NC_080394.1:45538422-45538432promoter 内 2032-2042 bp + 1959 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 45540391-45541131(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCA
SmilChr01G001357 Chr01 NC_080387.1:26835532-26835542promoter 内 1955-1965 bp - 2036 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 26837578-26838320(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr07G002891 Chr07 NC_080393.1:29259534-29259544promoter 内 1931-1941 bp + 2060 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 29256823-29257474(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr07G001073 Chr07 NC_080393.1:7896454-7896464promoter 内 1788-1798 bp - 2203 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 7898667-7902573(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr03G000038 Chr03 NC_080389.1:456762-456772promoter 内 1746-1756 bp - 2245 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 459017-461513(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr03G000208 Chr03 NC_080389.1:2406304-2406314promoter 内 1743-1753 bp + 2248 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 2403126-2404056(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr04G001796 Chr04 NC_080390.1:29433203-29433213promoter 内 1702-1712 bp - 2289 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 29435502-29436015(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr05G003193 Chr05 NC_080391.1:40830854-40830864promoter 内 1680-1690 bp + 2311 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 40827707-40828543(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr03G001542 Chr03 NC_080389.1:19354533-19354543promoter 内 1332-1342 bp + 2659 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 19349623-19351874(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr04G001560 Chr04 NC_080390.1:25896471-25896481promoter 内 1262-1272 bp - 2729 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 25899210-25902942(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr06G001945 Chr06 NC_080392.1:23936735-23936745promoter 内 1216-1226 bp + 2775 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 23939520-23944110(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCA
SmilChr03G001356 Chr03 NC_080389.1:15931493-15931503promoter 内 1001-1011 bp + 2990 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 15927053-15928503(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr06G000266 Chr06 NC_080392.1:1810732-1810742promoter 内 941-951 bp + 3050 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 1799954-1807682(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr08G003103 Chr08 NC_080394.1:31245935-31245945promoter 内 692-702 bp - 3299 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 31249244-31251339(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr07G004199 Chr07 NC_080393.1:54044928-54044938promoter 内 612-622 bp + 3379 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 54032445-54041549(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr01G000411 Chr01 NC_080387.1:8368652-8368662promoter 内 583-593 bp + 3408 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 8364560-8365244(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr02G003585 Chr02 NC_080388.1:57020950-57020960promoter 内 475-485 bp + 3516 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 57016493-57017434(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT
SmilChr08G002029 Chr08 NC_080394.1:18088470-18088480promoter 内 453-463 bp + 3538 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 18083981-18084932(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGCT