转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因,每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 138 / 143 下载 TSV

上一页 138 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004529 Chr01 NC_080387.1:63480529-63480540promoter 内 2571-2582 bp + 1419 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 63481959-63483387(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCCG
SmilChr07G002239 Chr07 NC_080393.1:20572186-20572197promoter 内 2554-2565 bp - 1436 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 20568198-20570750(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACAACAGCTGAA
SmilChr01G003680 Chr01 NC_080387.1:55210338-55210349promoter 内 2548-2559 bp - 1442 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 55211791-55214783(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTTAG
SmilChr02G004582 Chr02 NC_080388.1:68303152-68303163promoter 内 2466-2477 bp - 1524 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 68304687-68310878(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAACTGTCAA
SmilChr03G001904 Chr03 NC_080389.1:26601660-26601671promoter 内 2462-2473 bp - 1528 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 26595830-26600132(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAAACAGCTGGG
SmilChr06G000263 Chr06 NC_080392.1:1761809-1761820promoter 内 2445-2456 bp + 1545 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 1758554-1760264(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCTA
SmilChr05G002127 Chr05 NC_080391.1:22367000-22367011promoter 内 2440-2451 bp + 1550 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 22364438-22365450(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTAGCTGTCAA
SmilChr07G000169 Chr07 NC_080393.1:1055790-1055801promoter 内 2413-2424 bp - 1577 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 1057378-1064170(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTTGT
SmilChr04G002909 Chr04 NC_080390.1:45341933-45341944promoter 内 2379-2390 bp - 1611 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 45339572-45340322(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCAACAGCTGAG
SmilChr02G003398 Chr02 NC_080388.1:55118721-55118732promoter 内 2361-2372 bp + 1629 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 55120361-55122165(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTATT
SmilChr01G003482 Chr01 NC_080387.1:53372126-53372137promoter 内 2285-2296 bp + 1705 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 53373842-53376928(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTATT
SmilChr02G004324 Chr02 NC_080388.1:65543816-65543827promoter 内 2267-2278 bp + 1723 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 65539701-65542093(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTTGC
SmilChr06G000393 Chr06 NC_080392.1:3150178-3150189promoter 内 2236-2247 bp - 1754 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 3145796-3148424(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAAAGCTGTA
SmilChr05G003667 Chr05 NC_080391.1:49603038-49603049promoter 内 2225-2236 bp - 1765 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 49604814-49605239(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTTTC
SmilChr02G003096 Chr02 NC_080388.1:51834010-51834021promoter 内 2205-2216 bp - 1785 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 51829447-51832225(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCCT
SmilChr08G003585 Chr08 NC_080394.1:38629787-38629798promoter 内 2164-2175 bp + 1826 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 38631624-38632151(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCCG
SmilChr02G000594 Chr02 NC_080388.1:8526384-8526395promoter 内 2101-2112 bp - 1889 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 8523336-8524495(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCCT
SmilChr05G001101 Chr05 NC_080391.1:9161468-9161479promoter 内 2059-2070 bp + 1931 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 9163410-9165049(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACAACAGCTGAA
SmilChr02G004707 Chr02 NC_080388.1:69357849-69357860promoter 内 2054-2065 bp - 1936 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 69353201-69355913(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTCAAGCTGTA
SmilChr04G003324 Chr04 NC_080390.1:49978344-49978355promoter 内 2028-2039 bp + 1962 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 49974178-49976382(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTTGT
SmilChr04G002910 Chr04 NC_080390.1:45341933-45341944promoter 内 2024-2035 bp - 1966 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 45343910-45345435(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTTGC
SmilChr08G001060 Chr08 NC_080394.1:8168526-8168537promoter 内 2017-2028 bp + 1973 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 8170510-8171385(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGCT
SmilChr02G002032 Chr02 NC_080388.1:36618770-36618781promoter 内 1981-1992 bp - 2009 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 36620790-36622199(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAACTGTCAA
SmilChr03G001106 Chr03 NC_080389.1:12746439-12746450promoter 内 1980-1991 bp + 2010 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 12748460-12752581(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGCC
SmilChr08G003362 Chr08 NC_080394.1:35108073-35108084promoter 内 1943-1954 bp - 2047 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 35110131-35114461(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCTA
SmilChr02G001250 Chr02 NC_080388.1:22988967-22988978promoter 内 1925-1936 bp - 2065 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 22985814-22986902(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACAACAGCTGAA
SmilChr07G001046 Chr07 NC_080393.1:7643386-7643397promoter 内 1923-1934 bp - 2067 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 7645464-7647631(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCTA
SmilChr02G003075 Chr02 NC_080388.1:51655177-51655188promoter 内 1839-1850 bp + 2151 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 51645944-51653026(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTTAG
SmilChr04G001555 Chr04 NC_080390.1:25742683-25742694promoter 内 1824-1835 bp - 2166 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 25739893-25740517(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCCT
SmilChr02G002775 Chr02 NC_080388.1:47812295-47812306promoter 内 1788-1799 bp + 2202 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 47814508-47817471(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGAACAGCTGGG
SmilChr04G000892 Chr04 NC_080390.1:11467589-11467600promoter 内 1781-1792 bp - 2209 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 11462368-11465380(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCAACAGCTGAG
SmilChr08G000831 Chr08 NC_080394.1:6150502-6150513promoter 内 1771-1782 bp + 2219 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 6144721-6148283(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTTAG
SmilChr07G003695 Chr07 NC_080393.1:44476553-44476564promoter 内 1737-1748 bp + 2253 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 44478817-44481870(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCAACAGCTGAG
SmilChr04G003226 Chr04 NC_080390.1:49092725-49092736promoter 内 1714-1725 bp + 2276 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 49088561-49090449(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTTGT
SmilChr07G001282 Chr07 NC_080393.1:9850758-9850769promoter 内 1695-1706 bp + 2295 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 9853064-9855183(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACAACAGCTGAA
SmilChr07G003182 Chr07 NC_080393.1:33900055-33900066promoter 内 1671-1682 bp - 2319 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 33902385-33903140(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAACTGTCAA
SmilChr04G002911 Chr04 NC_080390.1:45341933-45341944promoter 内 1648-1659 bp - 2342 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 45344286-45344390(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTTGC
SmilChr01G002830 Chr01 NC_080387.1:46905534-46905545promoter 内 1629-1640 bp - 2361 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 46901493-46903173(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAAACAGCTGGG
SmilChr04G001331 Chr04 NC_080390.1:21507301-21507312promoter 内 1586-1597 bp + 2404 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 21509716-21510660(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTACC
SmilChr01G004330 Chr01 NC_080387.1:61445781-61445792promoter 内 1567-1578 bp + 2423 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 61448215-61449566(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAAAGCTGTA
SmilChr07G001832 Chr07 NC_080393.1:15797376-15797387promoter 内 1547-1558 bp + 2443 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 15799830-15801215(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTATT
SmilChr01G004763 Chr01 NC_080387.1:65805992-65806003promoter 内 1505-1516 bp + 2485 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 65799425-65803507(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTTAG
SmilChr01G000699 Chr01 NC_080387.1:15681530-15681541promoter 内 1452-1463 bp + 2538 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 15677904-15678992(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAACTGTCAA
SmilChr01G002429 Chr01 NC_080387.1:41830869-41830880promoter 内 1365-1376 bp + 2625 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 41833505-41837531(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACAACAGCTGAA
SmilChr04G002912 Chr04 NC_080390.1:45341933-45341944promoter 内 1319-1330 bp - 2671 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 45344615-45344719(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTTGC
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SmilChr03G002023 Chr03 NC_080389.1:30315193-30315204promoter 内 1248-1259 bp - 2742 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 30310880-30312451(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACAACAGCTGAA
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SmilChr02G003384 Chr02 NC_080388.1:54959514-54959525promoter 内 1241-1252 bp - 2749 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 54954313-54956765(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACAACAGCTGAA
SmilChr05G003375 Chr05 NC_080391.1:44665754-44665765promoter 内 1140-1151 bp + 2850 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 44661394-44662904(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGAGCTGTCAA