Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID 家族 基序 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G005433; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族蛋白基序共识序列
SMil_00021978-RA_Salv SmilChr02G005433 WRKY XP_057792682.1 MP00209 CGTTGACTTTTTTTAACAT

可能结合的靶基因

9910 个结合位点 8083 个候选靶基因 第 146 / 162 下载 TSV

上一页 146 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF 基序 匹配序列
SmilChr07G003615 Chr07 NC_080393.1:42523390-42523408promoter 内 305-323 bp + 3678 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 42527086-42528188(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTTCGTTGAAAGT
SmilChr06G001035 Chr06 NC_080392.1:10273517-10273535promoter 内 294-312 bp - 3689 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 10269755-10269828(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTCGAATTATGCT
SmilChr08G000037 Chr08 NC_080394.1:260689-260707promoter 内 258-276 bp - 3725 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 254191-256964(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTAAATCCTAACC
SmilChr02G002132 Chr02 NC_080388.1:38286331-38286349promoter 内 242-260 bp + 3741 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 38275997-38282590(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGGCGTTGCAGAGTCAACC
SmilChr05G000144 Chr05 NC_080391.1:1185907-1185925promoter 内 235-253 bp - 3748 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 1181068-1182159(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTGCTGAGGGGTT
SmilChr06G001034 Chr06 NC_080392.1:10273517-10273535promoter 内 228-246 bp - 3755 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 10267852-10269762(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTCGAATTATGCT
SmilChr05G003865 Chr05 NC_080391.1:52251457-52251475promoter 内 213-231 bp + 3770 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 52255245-52259472(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTGGATCCACTTC
SmilChr03G004082 Chr03 NC_080389.1:59753801-59753819promoter 内 165-183 bp + 3818 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 59746806-59749983(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GTGAGAATTAAAGTCAAAG
SmilChr04G003268 Chr04 NC_080390.1:49392573-49392591promoter 内 148-166 bp - 3835 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 49385416-49388738(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTATAATAGACGG
SmilChr03G000460 Chr03 NC_080389.1:4915753-4915771promoter 内 118-136 bp - 3865 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 4908545-4911888(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTATCAAAGAGGT
SmilChr06G002030 Chr06 NC_080392.1:26447650-26447668promoter 内 116-134 bp + 3867 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 26435263-26443783(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGCGAATTGACAGTCAACT
SmilChr07G001168 Chr07 NC_080393.1:8782177-8782195promoter 内 102-120 bp + 3881 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 8786076-8786826(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTTGTGAGATTGT
SmilChr05G003624 Chr05 NC_080391.1:48516628-48516646promoter 内 100-118 bp - 3883 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 48520529-48527121(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTAGGATTTAGTCAACA
SmilChr04G001287 Chr04 NC_080390.1:20526858-20526876promoter 内 92-110 bp + 3891 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 20518301-20522967(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CCTACAAAATTAGTCAACC
SmilChr07G000285 Chr07 NC_080393.1:1847622-1847640promoter 内 69-87 bp + 3914 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 1851554-1854430(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTGAGTTAAAAAA
SmilChr01G004517 Chr01 NC_080387.1:63296493-63296511promoter 内 66-84 bp + 3917 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 63300428-63304872(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACTGATAGCTATTA
SmilChr02G005278 Chr02 NC_080388.1:73833683-73833701promoter 内 64-82 bp - 3919 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 73837620-73838616(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTAGGATTTAGTCAACA
SmilChr06G002235 Chr06 NC_080392.1:31627550-31627568promoter 内 63-81 bp + 3920 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 31622861-31623630(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 ACGCGACCTAAAGTCAACT
SmilChr07G001513 Chr07 NC_080393.1:12090598-12090616promoter 内 59-77 bp - 3924 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 12082291-12086674(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTTGTGAGATTGT
SmilChr08G000957 Chr08 NC_080394.1:7149510-7149528promoter 内 37-55 bp - 3946 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 7144286-7145564(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTCATACACACCA
SmilChr05G003610 Chr05 NC_080391.1:48168911-48168929promoter 内 29-47 bp - 3954 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 48172883-48174013(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AACCTCTTCAAAGTCAAAG
SmilChr01G004292 Chr01 NC_080387.1:61139137-61139155promoter 内 20-38 bp + 3963 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 61132968-61135174(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTCAATTAACAGTCAACA
SmilChr05G000674 Chr05 NC_080391.1:5156670-5156688promoter 内 4-22 bp - 3979 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 5151648-5152691(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTCTTCTGGGAAG
SmilChr07G001359 Chr07 NC_080393.1:10536250-10536268promoter 内 3172-3190 bp + 811 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 10531922-10535439(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CCCACTTTCAAAGTCAAAG
SmilChr08G001343 Chr08 NC_080394.1:10749885-10749903promoter 内 2332-2350 bp - 1651 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 10745786-10748234(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTTGTTCGCATTT
SmilChr04G003124 Chr04 NC_080390.1:47855944-47855962promoter 内 1890-1908 bp + 2093 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 47851420-47853851(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 ATTAGGAACATAGTCAACT
SmilChr01G003482 Chr01 NC_080387.1:53371513-53371531promoter 内 1672-1690 bp - 2311 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 53373842-53376928(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AATTTGGAATAAGTCAACA
SmilChr06G000710 Chr06 NC_080392.1:6394574-6394592promoter 内 1638-1656 bp + 2345 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 6396937-6401290(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTATGATTCTAAT
SmilChr05G003152 Chr05 NC_080391.1:40244758-40244776promoter 内 1007-1025 bp + 2976 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 40247752-40248903(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTGGCCTATACCT
SmilChr03G000869 Chr03 NC_080389.1:9875835-9875853promoter 内 906-924 bp + 3077 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 9870410-9872758(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTCGATCGAAAGTCAACA
SmilChr07G001360 Chr07 NC_080393.1:10536624-10536642promoter 内 580-598 bp - 3403 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 10540045-10540990(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CCCACTTTCAAAGTCAAAG
SmilChr07G000403 Chr07 NC_080393.1:2790287-2790305promoter 内 3970-3988 bp + 13 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 2790318-2795051(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CTTTGACTTGTGATTGCTA
SmilChr04G002591 Chr04 NC_080390.1:41327668-41327686promoter 内 3966-3984 bp - 17 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 41325877-41327651(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTGATTTCATACA
SmilChr01G000835 Chr01 NC_080387.1:18033277-18033295promoter 内 3937-3955 bp - 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 18033341-18034810(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GTTCTATTGCAAGTCAACT
SmilChr01G000651 Chr01 NC_080387.1:14494744-14494762promoter 内 3926-3944 bp - 57 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 14494819-14495241(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GTCACGTTTCAAGTCAACA
SmilChr08G001852 Chr08 NC_080394.1:15912287-15912305promoter 内 3924-3942 bp + 59 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 15912364-15914424(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CGTTGACCAACAAACTTCA
SmilChr01G001981 Chr01 NC_080387.1:35203603-35203621promoter 内 3913-3931 bp + 70 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 35203691-35205227(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTCCTATTGAGAA
SmilChr02G002119 Chr02 NC_080388.1:37953710-37953728promoter 内 3899-3917 bp + 84 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 37953812-37955934(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTCTTTGGTAGCT
SmilChr02G001000 Chr02 NC_080388.1:17628806-17628824promoter 内 3877-3895 bp + 106 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 17628930-17629774(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTGTTTCCAAAGA
SmilChr01G004104 Chr01 NC_080387.1:59552207-59552225promoter 内 3868-3886 bp - 115 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 59542606-59552092(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTGTTTTTTTTTT
SmilChr08G000456 Chr08 NC_080394.1:3265383-3265401promoter 内 3868-3886 bp - 115 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 3265516-3273227(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TTTTTTGATAAAGTCAACA
SmilChr06G001961 Chr06 NC_080392.1:24456345-24456363promoter 内 3865-3883 bp + 118 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 24454882-24456227(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GTTCTATTGCAAGTCAACT
SmilChr02G001039 Chr02 NC_080388.1:18483147-18483165promoter 内 3857-3875 bp - 126 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 18483291-18489780(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CTGGATGATTAAGTCAACT
SmilChr04G003878 Chr04 NC_080390.1:54641552-54641570promoter 内 3852-3870 bp + 131 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 54634667-54641421(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CTGGATGATTAAGTCAACT
SmilChr07G004702 Chr07 NC_080393.1:59914193-59914211promoter 内 3834-3852 bp - 149 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 59914360-59918585(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTAGTCTAGAGTCAACT
SmilChr01G002042 Chr01 NC_080387.1:36094448-36094466promoter 内 3820-3838 bp - 163 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 36091412-36094285(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CTTTGACTTTGAAAGTGGG
SmilChr05G001177 Chr05 NC_080391.1:9873185-9873203promoter 内 3815-3833 bp + 168 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 9870211-9873017(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGCAACTCTTAAGTCAACA
SmilChr05G000754 Chr05 NC_080391.1:5831824-5831842promoter 内 3813-3831 bp - 170 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 5832012-5842242(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AAAATAGTAAAAGTCAAAG
SmilChr07G004694 Chr07 NC_080393.1:59862890-59862908promoter 内 3811-3829 bp - 172 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 59859952-59862718(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CTTTGACTTTGCTCAAAAA
SmilChr03G004598 Chr03 NC_080389.1:63783366-63783384promoter 内 3810-3828 bp + 173 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 63781553-63783193(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAATTACAACAAGTCAACA