转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 18 / 143 下载 TSV

上一页 18 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G003432 Chr07 NC_080393.1:37727198-37727209promoter 内 415-426 bp + 3575 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 37730784-37732882(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTGAC
SmilChr02G005346 Chr02 NC_080388.1:74277348-74277359promoter 内 2602-2613 bp - 1388 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 5 74278747-74282868(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTC
SmilChr02G000755 Chr02 NC_080388.1:12329080-12329091promoter 内 842-853 bp - 3148 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 5 12304635-12325932(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGGA
SmilChr08G001385 Chr08 NC_080394.1:11069665-11069676promoter 内 1627-1638 bp - 2363 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 3 11063174-11067302(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGGA
SmilChr05G001119 Chr05 NC_080391.1:9339392-9339403promoter 内 736-747 bp - 3254 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 3 9333670-9336138(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGAA
SmilChr05G000244 Chr05 NC_080391.1:1866359-1866370promoter 内 596-607 bp - 3394 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 3 1869764-1871498(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTCGG
SmilChr02G002376 Chr02 NC_080388.1:41646328-41646339promoter 内 524-535 bp - 3466 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 3 41649805-41652168(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGAAT
SmilChr01G004984 Chr01 NC_080387.1:67890013-67890024promoter 内 3909-3920 bp + 81 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 67888541-67889932(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCCC
SmilChr01G004533 Chr01 NC_080387.1:63500275-63500286promoter 内 3893-3904 bp + 97 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 63495354-63500178(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTC
SmilChr06G002843 Chr06 NC_080392.1:41193109-41193120promoter 内 3858-3869 bp + 132 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 41192076-41192977(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTC
SmilChr07G002649 Chr07 NC_080393.1:25662131-25662142promoter 内 3582-3593 bp + 408 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 25659899-25661723(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCTA
SmilChr07G003935 Chr07 NC_080393.1:49675633-49675644promoter 内 3459-3470 bp + 531 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 49674263-49675102(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCTA
SmilChr07G004138 Chr07 NC_080393.1:53170185-53170196promoter 内 3449-3460 bp + 541 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 53169488-53169644(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCTA
SmilChr07G003702 Chr07 NC_080393.1:44678002-44678013promoter 内 3218-3229 bp + 772 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 44675654-44677230(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCTA
SmilChr04G000736 Chr04 NC_080390.1:8825432-8825443promoter 内 3203-3214 bp + 787 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 8821774-8824645(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGCTG
SmilChr02G002615 Chr02 NC_080388.1:45314947-45314958promoter 内 2963-2974 bp + 1027 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 45315985-45319676(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGGA
SmilChr07G001796 Chr07 NC_080393.1:15316598-15316609promoter 内 2956-2967 bp + 1034 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 15306210-15315564(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGCCA
SmilChr01G004779 Chr01 NC_080387.1:65958546-65958557promoter 内 2761-2772 bp - 1229 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 65959786-65963505(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCTA
SmilChr06G002002 Chr06 NC_080392.1:25678738-25678749promoter 内 2743-2754 bp + 1247 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 25671303-25677491(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGAAT
SmilChr07G002974 Chr07 NC_080393.1:30311478-30311489promoter 内 2682-2693 bp - 1308 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 30312797-30316855(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGCCA
SmilChr02G002394 Chr02 NC_080388.1:41841575-41841586promoter 内 2168-2179 bp - 1822 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 41843408-41844457(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCTA
SmilChr01G004983 Chr01 NC_080387.1:67890013-67890024promoter 内 2080-2091 bp + 1910 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 67882168-67888103(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCCC
SmilChr02G002393 Chr02 NC_080388.1:41841575-41841586promoter 内 2065-2076 bp - 1925 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 41838295-41839650(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGGA
SmilChr04G002753 Chr04 NC_080390.1:43241368-43241379promoter 内 2029-2040 bp - 1961 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 43228900-43239407(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGCCAGCTGTT
SmilChr04G004005 Chr04 NC_080390.1:55390345-55390356promoter 内 1917-1928 bp - 2073 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 55392429-55393504(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGCTT
SmilChr06G003004 Chr06 NC_080392.1:42912620-42912631promoter 内 1748-1759 bp + 2242 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 42902035-42910378(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCTA
SmilChr08G000272 Chr08 NC_080394.1:1864119-1864130promoter 内 1385-1396 bp - 2605 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 1858264-1861514(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGAA
SmilChr08G001682 Chr08 NC_080394.1:14043347-14043358promoter 内 1292-1303 bp - 2698 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 14046056-14048365(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCTA
SmilChr03G001867 Chr03 NC_080389.1:25819105-25819116promoter 内 1218-1229 bp - 2772 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 25821888-25823864(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGCTT
SmilChr01G004627 Chr01 NC_080387.1:64329422-64329433promoter 内 1082-1093 bp + 2908 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 64324689-64326514(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCCC
SmilChr02G002298 Chr02 NC_080388.1:40556869-40556880promoter 内 1061-1072 bp - 2929 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 40559809-40561749(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCTA
SmilChr01G002953 Chr01 NC_080387.1:48398802-48398813promoter 内 670-681 bp + 3320 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 48402133-48404640(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTA
SmilChr07G002254 Chr07 NC_080393.1:20719061-20719072promoter 内 654-665 bp + 3336 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 20714064-20715725(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTC
SmilChr02G001391 Chr02 NC_080388.1:26408957-26408968promoter 内 653-664 bp + 3337 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 26402064-26405620(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCTA
SmilChr07G004189 Chr07 NC_080393.1:53903952-53903963promoter 内 591-602 bp - 3399 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 53907362-53913051(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGCCA
SmilChr01G000203 Chr01 NC_080387.1:3479665-3479676promoter 内 357-368 bp + 3633 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 3483309-3484678(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGGA
SmilChr01G004458 Chr01 NC_080387.1:62693384-62693395promoter 内 296-307 bp - 3694 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 62697089-62699251(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCAC
SmilChr06G000896 Chr06 NC_080392.1:8476583-8476594promoter 内 192-203 bp - 3798 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 8466820-8472785(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGTA
SmilChr05G001174 Chr05 NC_080391.1:9845279-9845290promoter 内 6-17 bp + 3984 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 9839921-9841295(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTC
SmilChr07G001696 Chr07 NC_080393.1:14386125-14386136promoter 内 3899-3910 bp + 91 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 14383815-14386034(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGCCT
SmilChr02G005427 Chr02 NC_080388.1:74723672-74723683promoter 内 3494-3505 bp + 496 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 74724179-74724652(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTA
SmilChr02G002620 Chr02 NC_080388.1:45505547-45505558promoter 内 3301-3312 bp - 689 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 45503857-45504858(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTGGG
SmilChr05G001360 Chr05 NC_080391.1:12104775-12104786promoter 内 3093-3104 bp - 897 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 12100982-12103878(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGAA
SmilChr06G000007 Chr06 NC_080392.1:178929-178940promoter 内 2563-2574 bp + 1427 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 180367-184233(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTA
SmilChr04G000812 Chr04 NC_080390.1:10187768-10187779promoter 内 2545-2556 bp - 1445 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 10189224-10192705(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAGCTGTCAA
SmilChr06G003141 Chr06 NC_080392.1:44426461-44426472promoter 内 2382-2393 bp - 1608 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 44428080-44431101(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCAC
SmilChr04G002420 Chr04 NC_080390.1:38828549-38828560promoter 内 2334-2345 bp - 1656 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 38830216-38833020(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAG
SmilChr02G002619 Chr02 NC_080388.1:45505547-45505558promoter 内 2281-2292 bp - 1709 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 45500653-45503838(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTGGG
SmilChr02G005426 Chr02 NC_080388.1:74723672-74723683promoter 内 2171-2182 bp + 1819 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 74721224-74721853(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCAC
SmilChr01G003179 Chr01 NC_080387.1:50566276-50566287promoter 内 2073-2084 bp + 1917 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 50568204-50568805(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGAA