转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 26 / 134 下载 TSV

上一页 26 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005293 Chr02 NC_080388.1:73916018-73916030promoter 内 3924-3936 bp - 65 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 73915211-73915953(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTATGGATAAGA
SmilChr01G004852 Chr01 NC_080387.1:66683997-66684009promoter 内 3670-3682 bp + 319 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 66682128-66683678(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTTTTG
SmilChr01G000936 Chr01 NC_080387.1:19836020-19836032promoter 内 3458-3470 bp + 531 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 19836563-19837390(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATAAAGGATAAGA
SmilChr01G002900 Chr01 NC_080387.1:47669957-47669969promoter 内 2853-2865 bp - 1136 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 47671105-47672514(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTAAT
SmilChr02G004648 Chr02 NC_080388.1:68910542-68910554promoter 内 2821-2833 bp - 1168 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 68911722-68913135(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTGCTTT
SmilChr03G002450 Chr03 NC_080389.1:38883681-38883693promoter 内 2634-2646 bp - 1355 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 38885048-38885557(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCATACA
SmilChr03G000300 Chr03 NC_080389.1:3420090-3420102promoter 内 2171-2183 bp + 1818 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 3415423-3418272(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAATTG
SmilChr02G000726 Chr02 NC_080388.1:11797071-11797083promoter 内 2157-2169 bp + 1832 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 11793787-11795239(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAATAT
SmilChr01G003114 Chr01 NC_080387.1:49954496-49954508promoter 内 1971-1983 bp + 2018 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 49951069-49952478(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTGATC
SmilChr03G001642 Chr03 NC_080389.1:21232913-21232925promoter 内 1764-1776 bp + 2225 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 21235150-21239301(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAAGCAGATAAGG
SmilChr02G000655 Chr02 NC_080388.1:9938102-9938114promoter 内 1657-1669 bp + 2332 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 9933779-9935770(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTATG
SmilChr01G006200 Chr01 NC_080387.1:77700550-77700562promoter 内 1583-1595 bp - 2406 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 77690583-77698144(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAAGTGGATAACG
SmilChr02G005003 Chr02 NC_080388.1:71832349-71832361promoter 内 1245-1257 bp - 2744 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 71828703-71829605(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGAACGGATAAGG
SmilChr02G005388 Chr02 NC_080388.1:74523573-74523585promoter 内 1189-1201 bp + 2800 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 74518290-74520773(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCGCGTC
SmilChr03G000844 Chr03 NC_080389.1:9635424-9635436promoter 内 1183-1195 bp + 2806 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 9631854-9632618(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCATAGA
SmilChr01G003115 Chr01 NC_080387.1:49954496-49954508promoter 内 851-863 bp + 3138 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 49957646-49959019(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATCAAGATAAGG
SmilChr03G000958 Chr03 NC_080389.1:10828576-10828588promoter 内 3782-3794 bp + 207 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 10828795-10831314(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATATTGGATAAGA
SmilChr02G003760 Chr02 NC_080388.1:59290217-59290229promoter 内 3761-3773 bp + 228 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 59263956-59289989(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CGTTATCCATTTC
SmilChr02G004280 Chr02 NC_080388.1:64991687-64991699promoter 内 3619-3631 bp - 370 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 64989756-64991317(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATAAAGGATAAGA
SmilChr03G001580 Chr03 NC_080389.1:19960909-19960921promoter 内 3382-3394 bp - 607 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 19957268-19960302(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTAAAGATAAGG
SmilChr01G004319 Chr01 NC_080387.1:61366402-61366414promoter 内 2977-2989 bp + 1012 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 61367426-61371693(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATAAAGGATAAGA
SmilChr01G000913 Chr01 NC_080387.1:19344870-19344882promoter 内 2911-2923 bp + 1078 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 19345960-19346615(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGAGAGGATAAGA
SmilChr03G000549 Chr03 NC_080389.1:5950502-5950514promoter 内 2597-2609 bp - 1392 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 5951906-5957114(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTCTCA
SmilChr03G002244 Chr03 NC_080389.1:35395151-35395163promoter 内 2169-2181 bp + 1820 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 35396983-35399260(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATATTGGATAAGA
SmilChr01G003726 Chr01 NC_080387.1:55578975-55578987promoter 内 1739-1751 bp + 2250 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 55575070-55576725(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTTTAT
SmilChr03G001343 Chr03 NC_080389.1:15691476-15691488promoter 内 1680-1692 bp + 2309 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 15693797-15694388(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CAAAAGGATAAGA
SmilChr01G000582 Chr01 NC_080387.1:12592906-12592918promoter 内 1639-1651 bp + 2350 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 12588195-12590556(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAATTG
SmilChr02G004604 Chr02 NC_080388.1:68553652-68553664promoter 内 1634-1646 bp + 2355 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 68546587-68551297(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCGATTC
SmilChr02G000071 Chr02 NC_080388.1:902514-902526promoter 内 1353-1365 bp + 2636 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 897628-899878(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTAAAT
SmilChr02G001513 Chr02 NC_080388.1:28216340-28216352promoter 内 1195-1207 bp - 2794 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 28219146-28222828(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CGTTATCCACTTT
SmilChr02G005390 Chr02 NC_080388.1:74523573-74523585promoter 内 1014-1026 bp + 2975 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 74526560-74528656(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GACGCGGATAAGG
SmilChr02G004983 Chr02 NC_080388.1:71708857-71708869promoter 内 836-848 bp + 3153 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 71712022-71712515(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATAAAGGATAAGA
SmilChr01G002958 Chr01 NC_080387.1:48448564-48448576promoter 内 695-707 bp + 3294 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 48451870-48455831(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGAGGGGATAAGG
SmilChr01G004318 Chr01 NC_080387.1:61366402-61366414promoter 内 695-707 bp + 3294 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 61362069-61363108(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTTTAT
SmilChr01G003279 Chr01 NC_080387.1:51494192-51494204promoter 内 646-658 bp + 3343 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 51489904-51490849(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCCTTCC
SmilChr02G000840 Chr02 NC_080388.1:14234585-14234597promoter 内 641-653 bp + 3348 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 14237945-14239455(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CAATTGGATAAGA
SmilChr01G000978 Chr01 NC_080387.1:20683960-20683972promoter 内 603-615 bp + 3386 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 20678587-20680574(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCGTTCA
SmilChr02G001471 Chr02 NC_080388.1:27454267-27454279promoter 内 578-590 bp + 3411 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 27457690-27459733(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTATGGATAAGA
SmilChr01G002592 Chr01 NC_080387.1:44040843-44040855promoter 内 563-575 bp - 3426 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 44036941-44037417(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTAAAGATAAGG
SmilChr01G003117 Chr01 NC_080387.1:49973340-49973352promoter 内 562-574 bp - 3427 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 49967805-49969913(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTATGGATAAGG
SmilChr02G005292 Chr02 NC_080388.1:73916018-73916030promoter 内 551-563 bp - 3438 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 73910972-73912580(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTATGGATAAGA
SmilChr02G002252 Chr02 NC_080388.1:39958159-39958171promoter 内 476-488 bp - 3513 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 39961684-39964990(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTAAT
SmilChr02G005359 Chr02 NC_080388.1:74314134-74314146promoter 内 463-475 bp + 3526 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 74307777-74310608(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAATTG
SmilChr02G001575 Chr02 NC_080388.1:29256872-29256884promoter 内 378-390 bp - 3611 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 29251984-29253261(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CAAAAGGATAAGA
SmilChr02G001916 Chr02 NC_080388.1:34493353-34493365promoter 内 2319-2331 bp - 1670 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 4 34487721-34491683(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAGGAGGATAAGG
SmilChr03G000093 Chr03 NC_080389.1:1044934-1044946promoter 内 1920-1932 bp + 2069 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 4 1036298-1042865(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCGTATT
SmilChr02G000475 Chr02 NC_080388.1:6516881-6516893promoter 内 522-534 bp + 3467 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 4 6509284-6513414(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCACATC
SmilChr02G000666 Chr02 NC_080388.1:10231829-10231841promoter 内 3903-3915 bp + 86 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 10231927-10233018(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTTTTAGATAAGG
SmilChr03G001743 Chr03 NC_080389.1:23517953-23517965promoter 内 3313-3325 bp + 676 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 23515333-23517277(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTTCC
SmilChr02G000731 Chr02 NC_080388.1:11859666-11859678promoter 内 3305-3317 bp - 684 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 11860362-11863701(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTTCC