转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 38 / 139 下载 TSV

上一页 38 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G003771 Chr03 NC_080389.1:56848758-56848769promoter 内 1304-1315 bp + 2686 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 4 56851455-56857112(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CAATGACGTGGC
SmilChr02G001324 Chr02 NC_080388.1:24727575-24727586promoter 内 949-960 bp + 3041 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 4 24730627-24732489(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CATTGACGTGGC
SmilChr01G005310 Chr01 NC_080387.1:70351989-70352000promoter 内 925-936 bp - 3065 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 4 70348448-70348924(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CAATGACGTGGC
SmilChr02G004706 Chr02 NC_080388.1:69356760-69356771promoter 内 372-383 bp - 3618 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 4 69351219-69353142(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CATTGACGTGGC
SmilChr01G005309 Chr01 NC_080387.1:70351989-70352000promoter 内 331-342 bp - 3659 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 4 70347307-70348330(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CAATGACGTGGC
SmilChr02G002968 Chr02 NC_080388.1:50202813-50202824promoter 内 2677-2688 bp - 1313 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 50199317-50201500(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AAGTGACGTGGC
SmilChr04G002449 Chr04 NC_080390.1:39212656-39212667promoter 内 2058-2069 bp - 1932 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 39214599-39217511(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCACAT
SmilChr02G004023 Chr02 NC_080388.1:62521368-62521379promoter 内 1731-1742 bp - 2259 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 62518392-62519109(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCTGACGTGCC
SmilChr04G003603 Chr04 NC_080390.1:52471749-52471760promoter 内 1358-1369 bp - 2632 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 52474392-52474475(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGACGTCAGGA
SmilChr02G002500 Chr02 NC_080388.1:43453453-43453464promoter 内 1211-1222 bp + 2779 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 43449618-43450674(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCACAT
SmilChr03G000474 Chr03 NC_080389.1:5043047-5043058promoter 内 1123-1134 bp - 2867 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 5045925-5046758(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCATTC
SmilChr03G002242 Chr03 NC_080389.1:35365964-35365975promoter 内 142-153 bp + 3848 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 35369823-35369894(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CATTGACGTGGC
SmilChr02G001801 Chr02 NC_080388.1:32868473-32868484promoter 内 3989-4000 bp + 1 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 32868485-32872429(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGGAGACGTGGG
SmilChr04G002895 Chr04 NC_080390.1:45177603-45177614promoter 内 3938-3949 bp - 52 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 45174462-45177551(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CAATGACGTGGC
SmilChr02G004236 Chr02 NC_080388.1:64544873-64544884promoter 内 3793-3804 bp - 197 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 64545081-64552300(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCATTG
SmilChr02G000272 Chr02 NC_080388.1:3513623-3513634promoter 内 3736-3747 bp + 254 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 3509153-3513369(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCATTC
SmilChr01G000808 Chr01 NC_080387.1:17469532-17469543promoter 内 3715-3726 bp - 275 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 17468334-17469257(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATGTGACGTGGC
SmilChr02G004676 Chr02 NC_080388.1:69107707-69107718promoter 内 3696-3707 bp + 294 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 69108012-69110559(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGGG
SmilChr03G003364 Chr03 NC_080389.1:51988330-51988341promoter 内 3577-3588 bp - 413 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 51988754-51991630(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCAATG
SmilChr03G000558 Chr03 NC_080389.1:6055428-6055439promoter 内 3385-3396 bp - 605 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 6056044-6087403(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCAATG
SmilChr02G002139 Chr02 NC_080388.1:38533736-38533747promoter 内 3348-3359 bp + 642 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 38532278-38533094(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCATTC
SmilChr03G000482 Chr03 NC_080389.1:5131936-5131947promoter 内 3294-3305 bp + 696 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 5127291-5131240(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCACTT
SmilChr01G003792 Chr01 NC_080387.1:56323697-56323708promoter 内 3122-3133 bp + 868 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 56324576-56332760(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CATTGACGTGGC
SmilChr02G002655 Chr02 NC_080388.1:45995657-45995668promoter 内 3015-3026 bp - 975 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 45993513-45994682(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCTTGACGTGGG
SmilChr01G002254 Chr01 NC_080387.1:39195309-39195320promoter 内 2859-2870 bp - 1131 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 39192654-39194178(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATGTGACGTGGC
SmilChr04G003088 Chr04 NC_080390.1:47506389-47506400promoter 内 2441-2452 bp - 1549 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 47503546-47504840(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TAGTGACGTGGG
SmilChr02G000938 Chr02 NC_080388.1:16369102-16369113promoter 内 2405-2416 bp + 1585 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 16358836-16367517(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCACAT
SmilChr02G001767 Chr02 NC_080388.1:32407392-32407403promoter 内 2263-2274 bp - 1727 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 32409130-32411706(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCATAC
SmilChr02G004912 Chr02 NC_080388.1:71118321-71118332promoter 内 2238-2249 bp + 1752 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 71120084-71122722(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATGTGACGTGGC
SmilChr01G002901 Chr01 NC_080387.1:47699327-47699338promoter 内 1717-1728 bp - 2273 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 47696201-47697054(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGTAGACGTGGC
SmilChr02G001318 Chr02 NC_080388.1:24502180-24502191promoter 内 1664-1675 bp + 2326 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 24504517-24509144(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATGTGACGTGGC
SmilChr01G004572 Chr01 NC_080387.1:63781017-63781028promoter 内 1648-1659 bp - 2342 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 63783370-63784826(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCACTT
SmilChr02G004743 Chr02 NC_080388.1:69650339-69650350promoter 内 1643-1654 bp - 2347 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 69644540-69647992(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AAGTGACGTGGC
SmilChr04G001404 Chr04 NC_080390.1:22867808-22867819promoter 内 1602-1613 bp - 2388 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 22863697-22865420(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AAGTGACGTGGC
SmilChr02G001883 Chr02 NC_080388.1:34160142-34160153promoter 内 1539-1550 bp + 2451 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 34152231-34157691(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCATTC
SmilChr04G004174 Chr04 NC_080390.1:56363156-56363167promoter 内 1446-1457 bp - 2544 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 56358324-56360612(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGAAGACGTGGC
SmilChr02G001766 Chr02 NC_080388.1:32407392-32407403promoter 内 1331-1342 bp - 2659 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 32404592-32404733(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTATGACGTGGC
SmilChr01G004475 Chr01 NC_080387.1:62867403-62867414promoter 内 1184-1195 bp - 2806 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 62870220-62872210(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCACAT
SmilChr02G002140 Chr02 NC_080388.1:38533736-38533747promoter 内 779-790 bp + 3211 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 38536958-38539443(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAATGACGTGGC
SmilChr02G001247 Chr02 NC_080388.1:22926345-22926356promoter 内 550-561 bp - 3440 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 22919554-22922905(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AAGTGACGTGGC
SmilChr02G004968 Chr02 NC_080388.1:71581115-71581126promoter 内 528-539 bp - 3462 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 71584588-71591206(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCACTT
SmilChr02G000354 Chr02 NC_080388.1:4573094-4573105promoter 内 358-369 bp + 3632 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 4576737-4577192(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGAAGACGTGGC
SmilChr02G004675 Chr02 NC_080388.1:69107707-69107718promoter 内 240-251 bp + 3750 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 69103412-69103957(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCACAA
SmilChr01G004509 Chr01 NC_080387.1:63175274-63175285promoter 内 233-244 bp - 3757 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 63179042-63182578(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCTTCC
SmilChr02G001884 Chr02 NC_080388.1:34160142-34160153promoter 内 203-214 bp + 3787 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 34163940-34164729(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAATGACGTGGC
SmilChr02G004744 Chr02 NC_080388.1:69650339-69650350promoter 内 135-146 bp - 3855 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 69654205-69656876(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCACTT
SmilChr02G000107 Chr02 NC_080388.1:1376493-1376504promoter 内 10-21 bp + 3980 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 1369393-1372513(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCAATG
SmilChr02G005084 Chr02 NC_080388.1:72467036-72467047promoter 内 3986-3997 bp - 4 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 72467051-72468400(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCTTCC
SmilChr01G004149 Chr01 NC_080387.1:60023441-60023452promoter 内 3945-3956 bp + 45 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 60016671-60023396(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGTCC
SmilChr02G001690 Chr02 NC_080388.1:31159482-31159493promoter 内 3940-3951 bp + 50 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 31159543-31170581(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACATGACGTGGC