转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 43 / 149 下载 TSV

上一页 43 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G003824 Chr04 NC_080390.1:54359490-54359500promoter 内 934-944 bp + 3057 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 54354338-54356433(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTC
SmilChr01G004831 Chr01 NC_080387.1:66452662-66452672promoter 内 911-921 bp - 3080 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 66440004-66449582(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCGGCTGTCA
SmilChr04G001810 Chr04 NC_080390.1:29595906-29595916promoter 内 879-889 bp - 3112 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 29583579-29592794(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTCG
SmilChr02G001765 Chr02 NC_080388.1:32393675-32393685promoter 内 848-858 bp - 3143 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 32384930-32390532(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAAGCTGTCG
SmilChr01G004832 Chr01 NC_080387.1:66452662-66452672promoter 内 760-770 bp - 3231 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 66455903-66457952(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGAA
SmilChr02G004694 Chr02 NC_080388.1:69284529-69284539promoter 内 721-731 bp - 3270 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 69287809-69295931(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGAA
SmilChr05G000717 Chr05 NC_080391.1:5475690-5475700promoter 内 691-701 bp - 3300 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 5462755-5472390(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCGGCTGTCA
SmilChr06G000648 Chr06 NC_080392.1:5732441-5732451promoter 内 674-684 bp - 3317 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 5735768-5737611(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGT
SmilChr01G003660 Chr01 NC_080387.1:55028853-55028863promoter 内 567-577 bp - 3424 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 55020547-55025429(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCGGCTGTCA
SmilChr03G003029 Chr03 NC_080389.1:47220911-47220921promoter 内 540-550 bp + 3451 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 47215559-47217460(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAG
SmilChr07G002034 Chr07 NC_080393.1:18435937-18435947promoter 内 443-453 bp - 3548 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 18429204-18432389(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAGGCTGTCA
SmilChr05G001308 Chr05 NC_080391.1:11297397-11297407promoter 内 140-150 bp - 3851 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 11289311-11293546(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAGGCTGTCA
SmilChr04G003826 Chr04 NC_080390.1:54359490-54359500promoter 内 118-128 bp + 3873 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 54363373-54365077(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAGGCTGTCA
SmilChr05G002247 Chr05 NC_080391.1:24149740-24149750promoter 内 100-110 bp - 3891 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 24144159-24145849(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACAAGCTGTCG
SmilChr01G001993 Chr01 NC_080387.1:35324415-35324425promoter 内 92-102 bp - 3899 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 35328324-35336128(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTC
SmilChr04G003198 Chr04 NC_080390.1:48830568-48830578promoter 内 89-99 bp - 3902 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 48834480-48834959(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGAA
SmilChr05G000285 Chr05 NC_080391.1:2208807-2208817promoter 内 38-48 bp + 3953 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 2202419-2204854(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTC
SmilChr05G002378 Chr05 NC_080391.1:26097712-26097722promoter 内 20-30 bp - 3971 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 26092113-26093741(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCGGCTGTCA
SmilChr04G000158 Chr04 NC_080390.1:1385254-1385264promoter 内 722-732 bp - 3269 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 4 1379306-1381985(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCC
SmilChr05G001054 Chr05 NC_080391.1:8735065-8735075promoter 内 3205-3215 bp - 786 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 8735861-8739073(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCGT
SmilChr03G000197 Chr03 NC_080389.1:2244539-2244549promoter 内 1320-1330 bp - 2671 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 2229827-2241868(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCC
SmilChr02G002981 Chr02 NC_080388.1:50376325-50376335promoter 内 678-688 bp + 3313 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 50370905-50373012(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTG
SmilChr05G002387 Chr05 NC_080391.1:26319923-26319933promoter 内 568-578 bp - 3423 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 26315937-26316500(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAGGCTGTCA
SmilChr03G001175 Chr03 NC_080389.1:13507173-13507183promoter 内 3357-3367 bp + 634 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 13505637-13506539(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCGT
SmilChr02G000336 Chr02 NC_080388.1:4253690-4253700promoter 内 3221-3231 bp - 770 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 4249585-4252920(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACGAGCTGTCG
SmilChr05G001349 Chr05 NC_080391.1:11986339-11986349promoter 内 3194-3204 bp + 797 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 11980425-11985542(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTG
SmilChr07G001468 Chr07 NC_080393.1:11534106-11534116promoter 内 3087-3097 bp - 904 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 11527509-11533202(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAA
SmilChr01G002840 Chr01 NC_080387.1:46979984-46979994promoter 内 3081-3091 bp - 910 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 46980904-46983021(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTGC
SmilChr05G001284 Chr05 NC_080391.1:10998015-10998025promoter 内 2933-2943 bp + 1058 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 10995185-10996957(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTGC
SmilChr02G003850 Chr02 NC_080388.1:60262105-60262115promoter 内 2858-2868 bp + 1133 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 60258727-60260972(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTGC
SmilChr02G001730 Chr02 NC_080388.1:31790083-31790093promoter 内 2850-2860 bp + 1141 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 31788837-31788942(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTG
SmilChr01G000360 Chr01 NC_080387.1:7426935-7426945promoter 内 2838-2848 bp + 1153 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 7425677-7425782(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTG
SmilChr04G002811 Chr04 NC_080390.1:44112635-44112645promoter 内 2800-2810 bp - 1191 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 44108660-44111444(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAGGCTGTCA
SmilChr01G000852 Chr01 NC_080387.1:18407541-18407551promoter 内 2737-2747 bp + 1254 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 18408805-18412146(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAGGCTGTCA
SmilChr01G002874 Chr01 NC_080387.1:47336791-47336801promoter 内 2582-2592 bp + 1409 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 47334007-47335382(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTGC
SmilChr03G003645 Chr03 NC_080389.1:55126968-55126978promoter 内 2548-2558 bp + 1443 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 55124810-55125525(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTGC
SmilChr02G003925 Chr02 NC_080388.1:61328086-61328096promoter 内 2521-2531 bp - 1470 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 61329566-61330255(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTGC
SmilChr02G003510 Chr02 NC_080388.1:56304940-56304950promoter 内 2418-2428 bp - 1573 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 56306523-56307767(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTGC
SmilChr02G005085 Chr02 NC_080388.1:72477587-72477597promoter 内 2388-2398 bp + 1603 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 72474431-72475984(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTGC
SmilChr01G003879 Chr01 NC_080387.1:57119349-57119359promoter 内 2132-2142 bp - 1859 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 57111588-57117490(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAGGCTGTCA
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SmilChr05G002576 Chr05 NC_080391.1:28955113-28955123promoter 内 2085-2095 bp - 1906 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 28957029-28957135(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTG
SmilChr05G003760 Chr05 NC_080391.1:50830764-50830774promoter 内 2063-2073 bp + 1928 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 50827640-50828836(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTGC
SmilChr02G002488 Chr02 NC_080388.1:43297717-43297727promoter 内 1899-1909 bp + 2092 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 43299819-43300526(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCC
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SmilChr01G003635 Chr01 NC_080387.1:54868300-54868310promoter 内 1647-1657 bp - 2344 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 54865129-54865956(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCC
SmilChr05G001285 Chr05 NC_080391.1:10998015-10998025promoter 内 1470-1480 bp + 2521 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 11000546-11003333(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCC
SmilChr02G005087 Chr02 NC_080388.1:72477587-72477597promoter 内 1298-1308 bp + 2693 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 72480290-72482320(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCC
SmilChr04G002044 Chr04 NC_080390.1:33166863-33166873promoter 内 1266-1276 bp - 2725 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 33163257-33164138(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCC
SmilChr03G004381 Chr03 NC_080389.1:62019322-62019332promoter 内 1175-1185 bp + 2816 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 62022148-62027841(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCC