转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001518; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023584-RA_Salv SmilChr05G001518 WRKY XP_057765511.1 MP00455 AACGTTGACTATT

可能结合的靶基因

9792 个结合位点 6900 个候选靶基因 第 47 / 138 下载 TSV

上一页 47 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G004496 Chr03 NC_080389.1:63082063-63082075promoter 内 1655-1667 bp - 2334 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 63077199-63079729(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCCTTTGACTAAA
SmilChr03G000744 Chr03 NC_080389.1:8485171-8485183promoter 内 1640-1652 bp - 2349 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 8480356-8482822(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCCTTTGACTAAA
SmilChr01G005066 Chr01 NC_080387.1:68558907-68558919promoter 内 1509-1521 bp - 2480 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 68550983-68556427(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAGGTTGACTTAA
SmilChr01G002511 Chr01 NC_080387.1:43003065-43003077promoter 内 1415-1427 bp + 2574 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 43005651-43008379(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGGGTTGACTTCA
SmilChr01G002389 Chr01 NC_080387.1:41156997-41157009promoter 内 1271-1283 bp + 2718 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 41159727-41162434(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTTGTTGACTGTT
SmilChr02G001496 Chr02 NC_080388.1:27904862-27904874promoter 内 1267-1279 bp - 2722 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 27900496-27902140(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATGGTTGACTATA
SmilChr03G003252 Chr03 NC_080389.1:50389630-50389642promoter 内 1159-1171 bp - 2830 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 50392472-50396682(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAAAGTCAACATT
SmilChr02G002263 Chr02 NC_080388.1:40086503-40086515promoter 内 1144-1156 bp + 2845 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 40081593-40083658(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCAAGTCAACCGG
SmilChr03G000831 Chr03 NC_080389.1:9527353-9527365promoter 内 1128-1140 bp - 2861 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 9523425-9524492(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTGGTTGACTGTT
SmilChr01G000080 Chr01 NC_080387.1:1460121-1460133promoter 内 1084-1096 bp + 2905 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 1457111-1457216(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TACAGTCAACCAT
SmilChr03G000574 Chr03 NC_080389.1:6237596-6237608promoter 内 659-671 bp + 3330 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 6240938-6243384(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCCTTTGACTAAA
SmilChr02G001447 Chr02 NC_080388.1:27143304-27143316promoter 内 628-640 bp - 3361 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 27137826-27139943(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATGTTGACTGGT
SmilChr01G003342 Chr01 NC_080387.1:52201449-52201461promoter 内 594-606 bp + 3395 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 52204856-52207135(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATGTTGACTTTG
SmilChr01G003016 Chr01 NC_080387.1:49184869-49184881promoter 内 575-587 bp + 3414 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 49188295-49190988(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTGGTTGACTTTT
SmilChr02G004884 Chr02 NC_080388.1:70924338-70924350promoter 内 527-539 bp + 3462 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 70927812-70928715(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACTGTTGACTTTC
SmilChr01G002094 Chr01 NC_080387.1:36947644-36947656promoter 内 524-536 bp - 3465 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 36951121-36953344(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGCAGTCAACGAA
SmilChr03G003875 Chr03 NC_080389.1:57867687-57867699promoter 内 513-525 bp - 3476 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 57871175-57872627(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CACAGTCAACATT
SmilChr02G002957 Chr02 NC_080388.1:50098068-50098080promoter 内 488-500 bp - 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 50101581-50105146(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AACAGTCAACCAA
SmilChr01G002047 Chr01 NC_080387.1:36248340-36248352promoter 内 486-498 bp - 3503 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 36242712-36244837(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATGTTGACTGGT
SmilChr03G000658 Chr03 NC_080389.1:7345398-7345410promoter 内 254-266 bp + 3735 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 7340706-7341663(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGTAGTCAACCGC
SmilChr01G001634 Chr01 NC_080387.1:30401405-30401417promoter 内 104-116 bp + 3885 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 30392990-30397520(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAACGC
SmilChr03G001760 Chr03 NC_080389.1:24006736-24006748promoter 内 102-114 bp + 3887 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 24001867-24002849(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GACAGTCAACACT
SmilChr03G004446 Chr03 NC_080389.1:62598668-62598680promoter 内 3634-3646 bp - 355 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 62594368-62598313(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTCGTTGACTCAG
SmilChr01G003901 Chr01 NC_080387.1:57292462-57292474promoter 内 1324-1336 bp + 2665 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 57295139-57298637(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGAGTTGACTAGT
SmilChr01G003900 Chr01 NC_080387.1:57292462-57292474promoter 内 879-891 bp + 3110 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 57286627-57289352(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACTAGTCAACTCT
SmilChr01G004165 Chr01 NC_080387.1:60160027-60160039promoter 内 519-531 bp + 3470 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 60151027-60156557(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAACCTG
SmilChr03G000179 Chr03 NC_080389.1:1923352-1923364promoter 内 3913-3925 bp - 76 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 1923440-2552598(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACTAGTCAACTCT
SmilChr02G000299 Chr02 NC_080388.1:3769603-3769615promoter 内 2188-2200 bp - 1801 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 3771416-3774441(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAGAGTCAACACC
SmilChr02G005312 Chr02 NC_080388.1:74011368-74011380promoter 内 1942-1954 bp + 2047 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 74013427-74014978(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCTGTTGACTTAA
SmilChr03G002552 Chr03 NC_080389.1:40711778-40711790promoter 内 1831-1843 bp - 2158 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 40704100-40709620(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCGTTGACTCCA
SmilChr02G004351 Chr02 NC_080388.1:65778186-65778198promoter 内 1804-1816 bp - 2185 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 65764145-65776001(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCTGTTGACTAGT
SmilChr02G002277 Chr02 NC_080388.1:40260611-40260623promoter 内 1801-1813 bp + 2188 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 40253801-40258423(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCAAGTCAACTCT
SmilChr02G005161 Chr02 NC_080388.1:72953468-72953480promoter 内 1126-1138 bp - 2863 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 72956343-72960922(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTCAGTCAACCCA
SmilChr01G004845 Chr01 NC_080387.1:66599066-66599078promoter 内 748-760 bp - 3241 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 66589666-66595825(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAGGTTGACTCTG
SmilChr02G001622 Chr02 NC_080388.1:30158119-30158131promoter 内 3804-3816 bp - 185 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 30155354-30157934(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATGGTTGACTGAT
SmilChr02G001643 Chr02 NC_080388.1:30506225-30506237promoter 内 3791-3803 bp - 198 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 30503466-30506027(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATGGTTGACTGAT
SmilChr03G001425 Chr03 NC_080389.1:16899861-16899873promoter 内 3693-3705 bp - 296 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 16898811-16899565(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATGTTGACTTTT
SmilChr03G001323 Chr03 NC_080389.1:15469445-15469457promoter 内 3692-3704 bp + 297 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 15469754-15470548(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATGTTGACTTTT
SmilChr02G003264 Chr02 NC_080388.1:53923052-53923064promoter 内 3377-3389 bp + 612 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 53920424-53922440(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCAGTCAACCGC
SmilChr03G003269 Chr03 NC_080389.1:50615745-50615757promoter 内 3105-3117 bp - 884 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 50616641-50622504(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCTAGTCAACTCT
SmilChr02G003265 Chr02 NC_080388.1:53923052-53923064promoter 内 2992-3004 bp + 997 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 53924061-53925012(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCGGTTGACTGCA
SmilChr01G005710 Chr01 NC_080387.1:73324328-73324340promoter 内 2950-2962 bp + 1039 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 73325379-73329438(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCGGTTGACTTAA
SmilChr03G000691 Chr03 NC_080389.1:7722177-7722189promoter 内 2847-2859 bp - 1142 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 7723331-7725582(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCAGTCAACCGC
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SmilChr03G003654 Chr03 NC_080389.1:55371195-55371207promoter 内 2830-2842 bp + 1159 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 55368761-55370036(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTAGTCAAAGAC
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SmilChr01G004783 Chr01 NC_080387.1:66030594-66030606promoter 内 2180-2192 bp - 1809 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 66028084-66028785(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAGGTTGACTCTT
SmilChr03G000508 Chr03 NC_080389.1:5481923-5481935promoter 内 2175-2187 bp + 1814 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 5483749-5488480(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATGTTGACTTTT