转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 47 / 134 下载 TSV

上一页 47 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005145 Chr01 NC_080387.1:69238423-69238435promoter 内 3066-3078 bp + 923 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 69236880-69237500(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCACTTA
SmilChr02G000617 Chr02 NC_080388.1:8990319-8990331promoter 内 3064-3076 bp + 925 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 8986416-8989394(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTTCTG
SmilChr01G001289 Chr01 NC_080387.1:25678727-25678739promoter 内 2943-2955 bp + 1046 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 25679785-25682271(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACAGAGGATAAGA
SmilChr01G005630 Chr01 NC_080387.1:72751456-72751468promoter 内 2704-2716 bp - 1285 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 72746687-72750171(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTTTGAGATAAGG
SmilChr01G000950 Chr01 NC_080387.1:20133958-20133970promoter 内 2659-2671 bp + 1330 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 20135300-20137758(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTCGGATAAGG
SmilChr02G004137 Chr02 NC_080388.1:63635711-63635723promoter 内 2449-2461 bp + 1540 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 63627924-63634171(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCTTAC
SmilChr01G004403 Chr01 NC_080387.1:62145504-62145516promoter 内 2146-2158 bp - 1843 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 62138438-62143661(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTATGGATAAGC
SmilChr01G001570 Chr01 NC_080387.1:29717999-29718011promoter 内 2106-2118 bp + 1883 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 29715007-29716116(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTTCAT
SmilChr02G000715 Chr02 NC_080388.1:11521708-11521720promoter 内 2103-2115 bp - 1886 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 11516826-11519822(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCAATAGATAAGG
SmilChr03G000325 Chr03 NC_080389.1:3728916-3728928promoter 内 2013-2025 bp - 1976 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 3725567-3726940(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATCCGGATAAGA
SmilChr01G006001 Chr01 NC_080387.1:75587807-75587819promoter 内 1735-1747 bp - 2254 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 75590073-75592161(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCTTTTG
SmilChr01G003670 Chr01 NC_080387.1:55132990-55133002promoter 内 1647-1659 bp - 2342 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 55135344-55138558(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCTTAC
SmilChr02G003414 Chr02 NC_080388.1:55334655-55334667promoter 内 1509-1521 bp - 2480 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 55337147-55338223(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTATCA
SmilChr03G001651 Chr03 NC_080389.1:21453728-21453740promoter 内 1287-1299 bp + 2702 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 21449896-21451026(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTACCAC
SmilChr02G002160 Chr02 NC_080388.1:38829626-38829638promoter 内 1283-1295 bp - 2706 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 38819841-38826920(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATAAAGGATAAGC
SmilChr02G005497 Chr02 NC_080388.1:75123427-75123439promoter 内 1155-1167 bp - 2834 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 75126273-75130033(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCATCTTC
SmilChr02G004491 Chr02 NC_080388.1:67410775-67410787promoter 内 1005-1017 bp + 2984 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 67405402-67407791(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTGAAAA
SmilChr02G004659 Chr02 NC_080388.1:69002088-69002100promoter 内 898-910 bp + 3091 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 68990617-68998997(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTTTGC
SmilChr03G001149 Chr03 NC_080389.1:13245581-13245593promoter 内 813-825 bp - 3176 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 13248769-13249803(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCACTTA
SmilChr02G005605 Chr02 NC_080388.1:75745129-75745141promoter 内 754-766 bp + 3235 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 75748376-75752116(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAATAGGATAAGC
SmilChr02G001972 Chr02 NC_080388.1:35691370-35691382promoter 内 553-565 bp - 3436 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 35694818-35697027(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTATTGC
SmilChr03G002090 Chr03 NC_080389.1:32190232-32190244promoter 内 446-458 bp + 3543 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 32184231-32186689(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCTCAAA
SmilChr01G000268 Chr01 NC_080387.1:5188844-5188856promoter 内 395-407 bp - 3594 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 5192450-5194560(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCGAAGT
SmilChr02G005386 Chr02 NC_080388.1:74518139-74518151promoter 内 335-347 bp - 3654 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 74512208-74514485(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAAGTGGATAATG
SmilChr03G000650 Chr03 NC_080389.1:7242051-7242063promoter 内 282-294 bp + 3707 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 7237817-7238344(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCACTTA
SmilChr03G001296 Chr03 NC_080389.1:15153476-15153488promoter 内 186-198 bp - 3803 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 15157291-15160121(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTGTTG
SmilChr03G001795 Chr03 NC_080389.1:24519152-24519164promoter 内 161-173 bp - 3828 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 24512402-24515324(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAAAGGGATAAGA
SmilChr01G000384 Chr01 NC_080387.1:7935234-7935246promoter 内 3821-3833 bp - 168 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 7928976-7935066(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCAATAGATAAGG
SmilChr02G004001 Chr02 NC_080388.1:62347630-62347642promoter 内 3801-3813 bp - 188 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 62347830-62348439(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTATCA
SmilChr02G003021 Chr02 NC_080388.1:50897617-50897629promoter 内 3748-3760 bp + 241 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 50897870-50901111(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAGATGGATAAGA
SmilChr03G002183 Chr03 NC_080389.1:33935940-33935952promoter 内 3741-3753 bp + 248 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 33936200-33938043(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTTGAGGATAAGT
SmilChr02G000271 Chr02 NC_080388.1:3497871-3497883promoter 内 3665-3677 bp - 324 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 3494559-3497547(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGAGTGGATAATG
SmilChr01G001247 Chr01 NC_080387.1:24986135-24986147promoter 内 3576-3588 bp - 413 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 24986560-24987734(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCGTTAG
SmilChr02G003861 Chr02 NC_080388.1:60531120-60531132promoter 内 3557-3569 bp - 432 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 60531564-60532579(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCTATT
SmilChr01G005386 Chr01 NC_080387.1:71157859-71157871promoter 内 3486-3498 bp + 503 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 71158374-71160147(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCAATAGATAAGG
SmilChr02G003128 Chr02 NC_080388.1:52307325-52307337promoter 内 3453-3465 bp + 536 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 52305963-52306789(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCGTTAG
SmilChr02G003059 Chr02 NC_080388.1:51376550-51376562promoter 内 3421-3433 bp - 568 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 51377130-51377952(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCGTTAG
SmilChr03G002193 Chr03 NC_080389.1:34484915-34484927promoter 内 3368-3380 bp + 621 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 34485548-34486483(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAAAGGGATAAGA
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SmilChr02G005565 Chr02 NC_080388.1:75576158-75576170promoter 内 3251-3263 bp + 738 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 75572911-75575420(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCCTTG
SmilChr02G004122 Chr02 NC_080388.1:63494373-63494385promoter 内 3198-3210 bp + 791 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 63492296-63493582(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCCTTG
SmilChr03G000291 Chr03 NC_080389.1:3330709-3330721promoter 内 3016-3028 bp - 973 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 3328708-3329736(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCAATAGATAAGG
SmilChr03G002062 Chr03 NC_080389.1:31464075-31464087promoter 内 3014-3026 bp - 975 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 31465062-31466439(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCTATTA
SmilChr01G001698 Chr01 NC_080387.1:31266097-31266109promoter 内 3010-3022 bp - 979 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 31262793-31265118(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATAGGAGATAAGG
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SmilChr01G002561 Chr01 NC_080387.1:43741134-43741146promoter 内 2835-2847 bp - 1154 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 43742300-43747956(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCAACTG
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SmilChr01G003066 Chr01 NC_080387.1:49508423-49508435promoter 内 2708-2720 bp - 1281 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 49505497-49507142(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAAGATGATAAGG