转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 5 / 143 下载 TSV

上一页 5 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004808 Chr02 NC_080388.1:70261658-70261669promoter 内 1703-1714 bp - 2287 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 70256688-70259371(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGTT
SmilChr03G001312 Chr03 NC_080389.1:15399255-15399266promoter 内 1693-1704 bp - 2297 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 15395343-15396958(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGGT
SmilChr02G001461 Chr02 NC_080388.1:27314570-27314581promoter 内 1549-1560 bp - 2441 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 27317022-27319718(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCAA
SmilChr07G001945 Chr07 NC_080393.1:16874986-16874997promoter 内 784-795 bp - 3206 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 16869748-16871780(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGCCAGCTGTA
SmilChr03G000669 Chr03 NC_080389.1:7486226-7486237promoter 内 682-693 bp - 3308 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 7489545-7492450(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCAA
SmilChr02G003887 Chr02 NC_080388.1:60960394-60960405promoter 内 658-669 bp + 3332 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 60953433-60957062(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCAA
SmilChr04G001498 Chr04 NC_080390.1:24523903-24523914promoter 内 570-581 bp + 3420 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 24519500-24520483(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCAA
SmilChr07G002381 Chr07 NC_080393.1:22203771-22203782promoter 内 446-457 bp + 3544 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 22197445-22200227(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCAA
SmilChr06G001501 Chr06 NC_080392.1:16083418-16083429promoter 内 225-236 bp + 3765 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 16066318-16079653(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCAA
SmilChr01G003473 Chr01 NC_080387.1:53273569-53273580promoter 内 215-226 bp + 3775 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 2 53277355-53281155(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGTT
SmilChr07G002478 Chr07 NC_080393.1:23383074-23383085promoter 内 3566-3577 bp - 424 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 23380436-23382650(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGTG
SmilChr07G003350 Chr07 NC_080393.1:35970803-35970814promoter 内 3523-3534 bp - 467 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 35971281-35987311(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTCAT
SmilChr06G000834 Chr06 NC_080392.1:7839818-7839829promoter 内 3221-3232 bp - 769 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 7836825-7839049(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGTG
SmilChr03G001581 Chr03 NC_080389.1:19970247-19970258promoter 内 2344-2355 bp + 1646 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 19967704-19968601(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTCAT
SmilChr01G002683 Chr01 NC_080387.1:45044879-45044890promoter 内 2295-2306 bp - 1695 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 45041871-45043184(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGTG
SmilChr07G004513 Chr07 NC_080393.1:57775794-57775805promoter 内 2270-2281 bp + 1720 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 57777525-57780292(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGTG
SmilChr05G001033 Chr05 NC_080391.1:8474541-8474552promoter 内 2142-2153 bp - 1848 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 8471070-8472693(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGTG
SmilChr01G004102 Chr01 NC_080387.1:59502904-59502915promoter 内 2051-2062 bp - 1939 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 59491484-59500965(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGGG
SmilChr07G000644 Chr07 NC_080393.1:4340188-4340199promoter 内 1138-1149 bp - 2852 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 4335201-4337336(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGGG
SmilChr05G000631 Chr05 NC_080391.1:4765011-4765022promoter 内 819-830 bp + 3171 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 4758784-4761840(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTCAT
SmilChr01G003721 Chr01 NC_080387.1:55531019-55531030promoter 内 774-785 bp - 3216 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 55534246-55537248(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTCAT
SmilChr07G003991 Chr07 NC_080393.1:50975802-50975813promoter 内 198-209 bp + 3792 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.4/ 100 1 50964673-50972010(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTCAT
SmilChr05G000171 Chr05 NC_080391.1:1345062-1345073promoter 内 2944-2955 bp - 1046 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 3 1343933-1344016(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGGT
SmilChr06G002114 Chr06 NC_080392.1:28259611-28259622promoter 内 1990-2001 bp + 2000 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 3 28261622-28263081(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGGT
SmilChr02G001374 Chr02 NC_080388.1:25983267-25983278promoter 内 1931-1942 bp + 2059 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 3 25985337-25988773(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTA
SmilChr04G001183 Chr04 NC_080390.1:17936491-17936502promoter 内 3986-3997 bp - 4 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 17932247-17936487(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTA
SmilChr05G000170 Chr05 NC_080391.1:1345062-1345073promoter 内 2267-2278 bp - 1723 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 1339915-1343339(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGGT
SmilChr03G001942 Chr03 NC_080389.1:27668191-27668202promoter 内 2199-2210 bp + 1791 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 27664212-27666400(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCGC
SmilChr01G000994 Chr01 NC_080387.1:20983273-20983284promoter 内 1557-1568 bp - 2433 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 20985717-20991575(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCCAGCTGTCAG
SmilChr01G000319 Chr01 NC_080387.1:6220424-6220435promoter 内 1440-1451 bp + 2550 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 6216030-6217874(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCGC
SmilChr06G001644 Chr06 NC_080392.1:18595545-18595556promoter 内 1252-1263 bp + 2738 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 18598294-18601388(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTA
SmilChr06G002312 Chr06 NC_080392.1:33395484-33395495promoter 内 1242-1253 bp + 2748 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 33398243-33401510(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTA
SmilChr07G004124 Chr07 NC_080393.1:52925491-52925502promoter 内 1214-1225 bp + 2776 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 52928278-52931702(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTA
SmilChr02G003927 Chr02 NC_080388.1:61343056-61343067promoter 内 952-963 bp + 3038 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 61346105-61348946(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTA
SmilChr03G000317 Chr03 NC_080389.1:3626450-3626461promoter 内 584-595 bp - 3406 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 3629867-3633029(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCGC
SmilChr01G001541 Chr01 NC_080387.1:29430408-29430419promoter 内 954-965 bp + 3036 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 4 29433455-29433526(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGTT
SmilChr05G002183 Chr05 NC_080391.1:23314580-23314591promoter 内 3714-3725 bp + 276 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 3 23310963-23314304(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCAT
SmilChr03G003743 Chr03 NC_080389.1:56473648-56473659promoter 内 2864-2875 bp + 1126 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 56474785-56481308(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGTT
SmilChr02G002018 Chr02 NC_080388.1:36382462-36382473promoter 内 2680-2691 bp - 1310 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 36383783-36388678(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCAT
SmilChr05G000207 Chr05 NC_080391.1:1649787-1649798promoter 内 2586-2597 bp + 1404 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 1645530-1648383(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGTCAG
SmilChr05G000474 Chr05 NC_080391.1:3620327-3620338promoter 内 1800-1811 bp + 2190 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 3615430-3618137(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGTCGC
SmilChr07G003625 Chr07 NC_080393.1:42781757-42781768promoter 内 1191-1202 bp + 2799 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 42778853-42778958(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGTCGC
SmilChr01G000820 Chr01 NC_080387.1:17717973-17717984promoter 内 974-985 bp - 3016 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 17721000-17723631(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCCAGCTGTCGC
SmilChr02G002817 Chr02 NC_080388.1:48262910-48262921promoter 内 627-638 bp - 3363 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 48266284-48268490(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCAT
SmilChr01G000659 Chr01 NC_080387.1:14692891-14692902promoter 内 489-500 bp - 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 14696403-14698547(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCCAGCTGTCGC
SmilChr01G000821 Chr01 NC_080387.1:17717973-17717984promoter 内 8-19 bp - 3982 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 17721966-17722389(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCCAGCTGTCGC
SmilChr02G004655 Chr02 NC_080388.1:68966584-68966595promoter 内 770-781 bp - 3220 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 3 68969815-68971557(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCGA
SmilChr08G000729 Chr08 NC_080394.1:5415782-5415793promoter 内 2839-2850 bp + 1151 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 5412630-5414631(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCGA
SmilChr08G000200 Chr08 NC_080394.1:1348374-1348385promoter 内 1186-1197 bp + 2804 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 1351189-1353066(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGCCAGCTGTG
SmilChr03G000765 Chr03 NC_080389.1:8745947-8745958promoter 内 1142-1153 bp + 2848 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 8748806-8752097(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG