转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 53 / 148 下载 TSV

上一页 53 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003217 Chr01 NC_080387.1:50952948-50952961promoter 内 1829-1842 bp - 2159 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 50948363-50950789(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAAATGACACGTGG
SmilChr01G003898 Chr01 NC_080387.1:57262588-57262601promoter 内 1771-1784 bp + 2217 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 57254068-57260371(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCACATA
SmilChr04G001826 Chr04 NC_080390.1:29803174-29803187promoter 内 1595-1608 bp + 2393 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 29796969-29800781(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACCATTT
SmilChr03G001319 Chr03 NC_080389.1:15462151-15462164promoter 内 1590-1603 bp + 2398 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 15458438-15459753(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACAAGAT
SmilChr01G001931 Chr01 NC_080387.1:34470472-34470485promoter 内 1560-1573 bp + 2428 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 34472913-34474261(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GACCAGCCACGTGG
SmilChr01G003321 Chr01 NC_080387.1:51918573-51918586promoter 内 1545-1558 bp - 2443 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 51914857-51916130(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAGCTGCACGTGG
SmilChr05G003591 Chr05 NC_080391.1:48012563-48012576promoter 内 1470-1483 bp + 2518 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 48006250-48010045(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTAATGCT
SmilChr04G003912 Chr04 NC_080390.1:54846145-54846158promoter 内 1442-1455 bp - 2546 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 54848704-54850082(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTATCGAC
SmilChr05G004393 Chr05 NC_080391.1:57365850-57365863promoter 内 1426-1439 bp - 2562 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 57368425-57372651(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCTTTTT
SmilChr07G004351 Chr07 NC_080393.1:56066686-56066699promoter 内 1317-1330 bp + 2671 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 56057953-56064015(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCATTTA
SmilChr07G000017 Chr07 NC_080393.1:81556-81569promoter 内 1243-1256 bp + 2745 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 84314-85209(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCGTTACACGTGG
SmilChr03G002385 Chr03 NC_080389.1:37775621-37775634promoter 内 1208-1221 bp + 2780 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 37770658-37772841(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGTTTCT
SmilChr08G001041 Chr08 NC_080394.1:7932939-7932952promoter 内 1034-1047 bp - 2954 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 7935906-7940189(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAATCTCC
SmilChr06G003095 Chr06 NC_080392.1:43803299-43803312promoter 内 858-871 bp + 3130 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 43806442-43810535(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGTGCAGCACGTGG
SmilChr08G001002 Chr08 NC_080394.1:7536002-7536015promoter 内 742-755 bp - 3246 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 7539261-7543538(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAATCTCC
SmilChr07G001123 Chr07 NC_080393.1:8365404-8365417promoter 内 730-743 bp - 3258 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 8357823-8362146(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTCACGTCACGTGT
SmilChr03G001462 Chr03 NC_080389.1:17459221-17459234promoter 内 621-634 bp + 3367 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 17462601-17463092(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GATTGGACACGTGG
SmilChr04G003263 Chr04 NC_080390.1:49363214-49363227promoter 内 581-594 bp + 3407 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 49359417-49359807(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCAGGAT
SmilChr02G001044 Chr02 NC_080388.1:18509880-18509893promoter 内 526-539 bp - 3462 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 18501069-18506418(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCGAATCACGTGC
SmilChr01G003600 Chr01 NC_080387.1:54560430-54560443promoter 内 520-533 bp + 3468 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 54563911-54565456(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGTCCGTCACGTGT
SmilChr02G003343 Chr02 NC_080388.1:54657446-54657459promoter 内 501-514 bp - 3487 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 54660946-54666348(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGGCTAA
SmilChr08G001589 Chr08 NC_080394.1:13139616-13139629promoter 内 500-513 bp - 3488 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 13131642-13136128(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAGACCTCACGTGG
SmilChr08G001601 Chr08 NC_080394.1:13259819-13259832promoter 内 464-477 bp - 3524 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 13251846-13256295(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAGACCTCACGTGG
SmilChr07G001077 Chr07 NC_080393.1:7907892-7907905promoter 内 440-453 bp - 3548 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 7911453-7914616(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGGTTCG
SmilChr02G004732 Chr02 NC_080388.1:69565350-69565363promoter 内 364-377 bp - 3624 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 69555676-69561726(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGACTGTCACGTGA
SmilChr01G001275 Chr01 NC_080387.1:25490393-25490406promoter 内 174-187 bp - 3814 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 25486495-25486579(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CTAATGCCACGTGG
SmilChr05G003556 Chr05 NC_080391.1:47473394-47473407promoter 内 124-137 bp - 3864 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 47477271-47479136(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACGGACC
SmilChr02G004640 Chr02 NC_080388.1:68853527-68853540promoter 内 86-99 bp + 3902 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 68857442-68859086(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTAGCCACACGTGG
SmilChr03G003168 Chr03 NC_080389.1:49029387-49029400promoter 内 69-82 bp + 3919 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 49033319-49033917(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGTGCCTCACGTGC
SmilChr08G001215 Chr08 NC_080394.1:9805719-9805732promoter 内 36-49 bp - 3952 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 9809684-9817763(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATGCCCT
SmilChr07G003036 Chr07 NC_080393.1:31398392-31398405promoter 内 5-18 bp + 3983 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 31390413-31394409(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGATACC
SmilChr05G003022 Chr05 NC_080391.1:37759602-37759615promoter 内 3478-3491 bp + 510 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 4 37760125-37763087(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAATTGCACGTGG
SmilChr06G002449 Chr06 NC_080392.1:35226142-35226155promoter 内 1649-1662 bp + 2339 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 35228494-35228946(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CTAAAGCCACGTGG
SmilChr03G001506 Chr03 NC_080389.1:18418378-18418391promoter 内 631-644 bp - 3357 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 18410005-18415021(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCATTTCACGTGG
SmilChr07G001642 Chr07 NC_080393.1:13844741-13844754promoter 内 559-572 bp - 3429 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 13840293-13841312(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCTCGTCACGTGA
SmilChr07G001661 Chr07 NC_080393.1:14065205-14065218promoter 内 303-316 bp - 3685 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 14060765-14061520(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCTCGTCACGTGA
SmilChr03G001777 Chr03 NC_080389.1:24228370-24228383promoter 内 3817-3830 bp - 171 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 24220761-24228199(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCATTTCACGTGG
SmilChr02G003638 Chr02 NC_080388.1:57744023-57744036promoter 内 3165-3178 bp + 823 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 57742456-57743200(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAATGCA
SmilChr03G001524 Chr03 NC_080389.1:18765137-18765150promoter 内 2449-2462 bp - 1539 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 18756055-18763598(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGGAGTCACGTGA
SmilChr07G004200 Chr07 NC_080393.1:54069465-54069478promoter 内 2346-2359 bp - 1642 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 54063976-54067823(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATTATGCCACGTGG
SmilChr06G001357 Chr06 NC_080392.1:14135510-14135523promoter 内 2077-2090 bp + 1911 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 14137434-14139355(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTGGCACCACGTGG
SmilChr07G002089 Chr07 NC_080393.1:19012608-19012621promoter 内 703-716 bp + 3285 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 19015906-19017406(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTAAGGTCACGTGA
SmilChr03G004618 Chr03 NC_080389.1:63884537-63884550promoter 内 292-305 bp - 3696 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 63880094-63880841(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CTGACGTCACGTGT
SmilChr04G003163 Chr04 NC_080390.1:48260192-48260205promoter 内 3971-3984 bp + 17 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 48260222-48264857(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TACATGTCACGTGC
SmilChr01G004319 Chr01 NC_080387.1:61367373-61367386promoter 内 3948-3961 bp - 40 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 61367426-61371693(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCGGCTG
SmilChr02G004990 Chr02 NC_080388.1:71774830-71774843promoter 内 3936-3949 bp + 52 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 71767723-71774778(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCATTTG
SmilChr06G002995 Chr06 NC_080392.1:42843021-42843034promoter 内 3929-3942 bp + 59 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 42837169-42842962(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACCAACA
SmilChr03G003612 Chr03 NC_080389.1:54779489-54779502promoter 内 3842-3855 bp + 146 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 54777917-54779343(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGATTCG
SmilChr02G002114 Chr02 NC_080388.1:37824818-37824831promoter 内 3814-3827 bp + 174 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 37814648-37824644(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACTCTTC
SmilChr03G003595 Chr03 NC_080389.1:54587845-54587858promoter 内 3809-3822 bp + 179 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 54584497-54587666(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGATTCG