转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 56 / 149 下载 TSV

上一页 56 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002332 Chr02 NC_080388.1:41019274-41019284promoter 内 2172-2182 bp - 1819 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 41016474-41017455(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr05G003538 Chr05 NC_080391.1:47250561-47250571promoter 内 2092-2102 bp - 1899 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 47252470-47259557(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr05G003067 Chr05 NC_080391.1:38525543-38525553promoter 内 2086-2096 bp + 1905 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 38527458-38541289(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr01G002714 Chr01 NC_080387.1:45400433-45400443promoter 内 2006-2016 bp + 1985 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 45393416-45398448(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr06G002565 Chr06 NC_080392.1:36857726-36857736promoter 内 1979-1989 bp - 2012 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 36846941-36855714(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr05G000035 Chr05 NC_080391.1:167005-167015promoter 内 1908-1918 bp - 2083 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 163018-164922(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAGGCTGTCA
SmilChr01G001749 Chr01 NC_080387.1:32220217-32220227promoter 内 1805-1815 bp - 2186 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 32222413-32224941(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr02G002850 Chr02 NC_080388.1:48680180-48680190promoter 内 1745-1755 bp + 2246 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 48674009-48677934(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr02G003467 Chr02 NC_080388.1:55970474-55970484promoter 内 1681-1691 bp + 2310 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 55972794-55975525(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr06G001473 Chr06 NC_080392.1:15638028-15638038promoter 内 1439-1449 bp + 2552 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 15640590-15641683(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr07G002908 Chr07 NC_080393.1:29489468-29489478promoter 内 1436-1446 bp - 2555 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 29492033-29493951(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr02G003263 Chr02 NC_080388.1:53922665-53922675promoter 内 1418-1428 bp - 2573 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 53917226-53920092(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr07G002855 Chr07 NC_080393.1:28702424-28702434promoter 内 1395-1405 bp + 2596 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 28705030-28706032(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr05G004351 Chr05 NC_080391.1:57122920-57122930promoter 内 1322-1332 bp + 2669 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 57117177-57120251(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGA
SmilChr02G000820 Chr02 NC_080388.1:13812393-13812403promoter 内 948-958 bp + 3043 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 13795514-13809350(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGA
SmilChr03G003713 Chr03 NC_080389.1:56076908-56076918promoter 内 923-933 bp - 3068 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 56072904-56073840(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCG
SmilChr06G000600 Chr06 NC_080392.1:5176467-5176477promoter 内 888-898 bp + 3103 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 5179580-5180877(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCT
SmilChr05G003522 Chr05 NC_080391.1:47097276-47097286promoter 内 880-890 bp + 3111 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 47090844-47094165(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGA
SmilChr01G005674 Chr01 NC_080387.1:73015016-73015026promoter 内 753-763 bp + 3238 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 73018264-73019041(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr07G002005 Chr07 NC_080393.1:17791392-17791402promoter 内 722-732 bp - 3269 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 17787731-17788123(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr01G001740 Chr01 NC_080387.1:32038610-32038620promoter 内 671-681 bp + 3320 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 32041940-32046946(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr05G000515 Chr05 NC_080391.1:3984264-3984274promoter 内 607-617 bp + 3384 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 3979892-3980880(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr05G003245 Chr05 NC_080391.1:41783212-41783222promoter 内 511-521 bp - 3480 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 41778822-41779732(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAGGCTGTCA
SmilChr04G002741 Chr04 NC_080390.1:43078431-43078441promoter 内 380-390 bp + 3611 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 43074041-43074820(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr03G003847 Chr03 NC_080389.1:57582655-57582665promoter 内 355-365 bp - 3636 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 57575915-57579019(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCG
SmilChr04G002419 Chr04 NC_080390.1:38805214-38805224promoter 内 195-205 bp + 3796 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 38809020-38814236(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr04G001682 Chr04 NC_080390.1:27828976-27828986promoter 内 175-185 bp + 3816 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 27832802-27833926(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr01G002161 Chr01 NC_080387.1:37611360-37611370promoter 内 140-150 bp + 3851 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 37615221-37618203(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr03G004757 Chr03 NC_080389.1:64661666-64661676promoter 内 114-124 bp - 3877 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 64665553-64667736(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCCAGCTGGG
SmilChr03G000489 Chr03 NC_080389.1:5240143-5240153promoter 内 102-112 bp + 3889 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 5244042-5245091(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTCT
SmilChr02G000247 Chr02 NC_080388.1:3204338-3204348promoter 内 76-86 bp - 3915 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 3198029-3200423(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr07G002044 Chr07 NC_080393.1:18543846-18543856promoter 内 65-75 bp - 3926 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 18537071-18539920(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr02G001431 Chr02 NC_080388.1:27016341-27016351promoter 内 40-50 bp + 3951 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 27008909-27012390(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr04G001428 Chr04 NC_080390.1:23233373-23233383promoter 内 3965-3975 bp + 26 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 23233409-23235945(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCT
SmilChr03G000311 Chr03 NC_080389.1:3543622-3543632promoter 内 3957-3967 bp + 34 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 3543666-3549644(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCT
SmilChr03G000312 Chr03 NC_080389.1:3555297-3555307promoter 内 3957-3967 bp + 34 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 3555341-3558022(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCT
SmilChr04G001065 Chr04 NC_080390.1:15223571-15223581promoter 内 3911-3921 bp - 80 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 15219369-15223491(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTCAGCTGTCC
SmilChr05G000935 Chr05 NC_080391.1:7496923-7496933promoter 内 3900-3910 bp + 91 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 7495422-7496832(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr02G000319 Chr02 NC_080388.1:4004760-4004770promoter 内 3898-3908 bp - 93 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 4004863-4005674(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr07G000624 Chr07 NC_080393.1:4219042-4219052promoter 内 3833-3843 bp + 158 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 4218163-4218884(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGTT
SmilChr04G003085 Chr04 NC_080390.1:47462922-47462932promoter 内 3753-3763 bp + 238 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 47460779-47462684(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr05G000524 Chr05 NC_080391.1:4021482-4021492promoter 内 3743-3753 bp + 248 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 4016728-4021234(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGA
SmilChr01G000953 Chr01 NC_080387.1:20171647-20171657promoter 内 3732-3742 bp - 259 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 20171916-20171987(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr07G001817 Chr07 NC_080393.1:15579440-15579450promoter 内 3692-3702 bp + 299 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 15579749-15594141(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr05G001132 Chr05 NC_080391.1:9461843-9461853promoter 内 3629-3639 bp + 362 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 9460812-9461481(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCCAGCTGGG
SmilChr05G000999 Chr05 NC_080391.1:8108763-8108773promoter 内 3612-3622 bp + 379 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 8107229-8108384(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr01G004055 Chr01 NC_080387.1:58992583-58992593promoter 内 3609-3619 bp + 382 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 58984815-58992201(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr07G002792 Chr07 NC_080393.1:27811708-27811718promoter 内 3598-3608 bp + 393 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 27809258-27811315(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr04G002703 Chr04 NC_080390.1:42547373-42547383promoter 内 3575-3585 bp - 416 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 42547799-42549174(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr05G002399 Chr05 NC_080391.1:26482767-26482777promoter 内 3568-3578 bp - 423 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 26483200-26489791(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTT