转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 57 / 149 下载 TSV

上一页 57 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003093 Chr02 NC_080388.1:51792864-51792874promoter 内 3525-3535 bp + 466 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 51789092-51792398(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr02G005037 Chr02 NC_080388.1:72063752-72063762promoter 内 3513-3523 bp + 478 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 72064240-72066161(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGGAG
SmilChr07G001677 Chr07 NC_080393.1:14217330-14217340promoter 内 3467-3477 bp - 524 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 14216306-14216806(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr01G003394 Chr01 NC_080387.1:52660376-52660386promoter 内 3418-3428 bp + 573 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 52660959-52662894(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr04G002721 Chr04 NC_080390.1:42832162-42832172promoter 内 3384-3394 bp + 607 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 42832779-42833339(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr05G001408 Chr05 NC_080391.1:12695671-12695681promoter 内 3382-3392 bp + 609 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 12696290-12698729(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr03G003018 Chr03 NC_080389.1:47088706-47088716promoter 内 3376-3386 bp + 615 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 47089331-47090095(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr06G000299 Chr06 NC_080392.1:2130942-2130952promoter 内 3307-3317 bp - 684 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 2128271-2130258(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr05G001761 Chr05 NC_080391.1:17319448-17319458promoter 内 3241-3251 bp + 750 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 17320208-17321899(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTCT
SmilChr01G002029 Chr01 NC_080387.1:35866260-35866270promoter 内 3238-3248 bp - 753 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 35864563-35865507(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr04G003260 Chr04 NC_080390.1:49312447-49312457promoter 内 3238-3248 bp - 753 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 49309153-49311694(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCG
SmilChr02G002610 Chr02 NC_080388.1:45302838-45302848promoter 内 3234-3244 bp + 757 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 45300304-45302081(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGA
SmilChr03G001238 Chr03 NC_080389.1:14282691-14282701promoter 内 3213-3223 bp + 778 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 14283479-14283974(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCG
SmilChr06G001485 Chr06 NC_080392.1:15825385-15825395promoter 内 3160-3170 bp + 831 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 15818411-15824554(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr07G003179 Chr07 NC_080393.1:33852455-33852465promoter 内 3156-3166 bp + 835 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 33849962-33851620(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTT
SmilChr01G001757 Chr01 NC_080387.1:32289574-32289584promoter 内 3154-3164 bp + 837 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 32285853-32288737(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr02G004394 Chr02 NC_080388.1:66297826-66297836promoter 内 3117-3127 bp - 874 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 66294410-66296952(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr01G002652 Chr01 NC_080387.1:44838263-44838273promoter 内 3093-3103 bp + 898 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 44837282-44837365(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGA
SmilChr02G003725 Chr02 NC_080388.1:58873453-58873463promoter 内 3067-3077 bp - 924 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 58874387-58885251(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr07G002793 Chr07 NC_080393.1:27811708-27811718promoter 内 3039-3049 bp + 952 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 27812670-27815956(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr06G002831 Chr06 NC_080392.1:41108618-41108628promoter 内 3031-3041 bp - 960 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 41109588-41114037(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr02G003300 Chr02 NC_080388.1:54254737-54254747promoter 内 3000-3010 bp - 991 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 54255738-54256242(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGA
SmilChr02G002962 Chr02 NC_080388.1:50138712-50138722promoter 内 2993-3003 bp - 998 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 50139720-50141545(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr04G003380 Chr04 NC_080390.1:50350620-50350630promoter 内 2969-2979 bp + 1022 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 50351652-50351811(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr05G002563 Chr05 NC_080391.1:28795812-28795822promoter 内 2936-2946 bp - 1055 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 28796877-28798817(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGA
SmilChr07G001260 Chr07 NC_080393.1:9704497-9704507promoter 内 2913-2923 bp - 1078 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 9699954-9703419(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCT
SmilChr02G002580 Chr02 NC_080388.1:44837360-44837370promoter 内 2873-2883 bp + 1118 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 44838488-44841085(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAGGCTGTCA
SmilChr03G003722 Chr03 NC_080389.1:56240434-56240444promoter 内 2869-2879 bp - 1122 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 56241566-56245128(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr02G000863 Chr02 NC_080388.1:14821156-14821166promoter 内 2771-2781 bp - 1220 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 14819324-14819936(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGGAG
SmilChr05G001133 Chr05 NC_080391.1:9461843-9461853promoter 内 2756-2766 bp + 1235 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 9463088-9465615(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGGAG
SmilChr02G003286 Chr02 NC_080388.1:54153032-54153042promoter 内 2741-2751 bp + 1250 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 54149753-54151782(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGA
SmilChr05G003929 Chr05 NC_080391.1:53056225-53056235promoter 内 2741-2751 bp + 1250 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 53057485-53059626(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCG
SmilChr05G002656 Chr05 NC_080391.1:30062110-30062120promoter 内 2693-2703 bp + 1298 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 30063418-30065256(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr07G001598 Chr07 NC_080393.1:13313960-13313970promoter 内 2664-2674 bp - 1327 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 13307967-13312633(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCG
SmilChr02G004060 Chr02 NC_080388.1:62895357-62895367promoter 内 2592-2602 bp - 1399 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 62890608-62893958(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr07G000929 Chr07 NC_080393.1:6628083-6628093promoter 内 2524-2534 bp - 1467 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 6623819-6626616(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr04G003041 Chr04 NC_080390.1:46910821-46910831promoter 内 2491-2501 bp - 1500 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 46912331-46916851(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
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SmilChr03G001535 Chr03 NC_080389.1:19211982-19211992promoter 内 2446-2456 bp - 1545 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 19213537-19214357(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr02G004216 Chr02 NC_080388.1:64397134-64397144promoter 内 2434-2444 bp - 1557 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 64391702-64395577(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTCT
SmilChr06G002826 Chr06 NC_080392.1:41020198-41020208promoter 内 2431-2441 bp - 1560 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 41021768-41024832(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGA
SmilChr06G003072 Chr06 NC_080392.1:43612637-43612647promoter 内 2408-2418 bp - 1583 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 43608328-43611054(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr05G002398 Chr05 NC_080391.1:26482767-26482777promoter 内 2366-2376 bp - 1625 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 26477009-26481142(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAGGCTGTCA
SmilChr07G001798 Chr07 NC_080393.1:15356191-15356201promoter 内 2358-2368 bp - 1633 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 15351597-15354558(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCG
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SmilChr05G003327 Chr05 NC_080391.1:43628035-43628045promoter 内 2319-2329 bp + 1672 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 43629717-43633363(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAGGCTGTCA
SmilChr03G001239 Chr03 NC_080389.1:14282691-14282701promoter 内 2316-2326 bp + 1675 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 14284376-14286377(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCG
SmilChr05G000911 Chr05 NC_080391.1:7227207-7227217promoter 内 2315-2325 bp + 1676 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 7228893-7230180(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAGGCTGTCA
SmilChr01G004806 Chr01 NC_080387.1:66260214-66260224promoter 内 2311-2321 bp + 1680 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 66261904-66264810(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAGGCTGTCA
SmilChr06G000425 Chr06 NC_080392.1:3499108-3499118promoter 内 2279-2289 bp - 1712 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 3500830-3503279(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC