转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 61 / 149 下载 TSV

上一页 61 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G001420 Chr04 NC_080390.1:23070146-23070156promoter 内 1208-1218 bp + 2783 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 23072939-23074810(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATAGCTGTCA
SmilChr01G002304 Chr01 NC_080387.1:39931330-39931340promoter 内 1126-1136 bp + 2865 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 39926329-39928465(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAT
SmilChr07G000378 Chr07 NC_080393.1:2554770-2554780promoter 内 1117-1127 bp + 2874 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 2557654-2560703(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCC
SmilChr03G001292 Chr03 NC_080389.1:15123074-15123084promoter 内 993-1003 bp - 2998 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 15126082-15131174(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTGT
SmilChr02G003698 Chr02 NC_080388.1:58439455-58439465promoter 内 891-901 bp - 3100 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 58442565-58448672(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGTA
SmilChr06G000151 Chr06 NC_080392.1:1062827-1062837promoter 内 306-316 bp - 3685 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 1053337-1059142(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGAGCTGTCG
SmilChr05G003748 Chr05 NC_080391.1:50613943-50613953promoter 内 3988-3998 bp - 3 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 50613956-50617805(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGGA
SmilChr06G000280 Chr06 NC_080392.1:1930747-1930757promoter 内 3957-3967 bp - 34 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 1929024-1930713(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAA
SmilChr07G002932 Chr07 NC_080393.1:29672721-29672731promoter 内 3910-3920 bp + 81 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 29672812-29673326(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGAGCTGTCG
SmilChr07G002933 Chr07 NC_080393.1:29683576-29683586promoter 内 3910-3920 bp + 81 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 29683667-29684181(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGAGCTGTCG
SmilChr05G003457 Chr05 NC_080391.1:46001993-46002003promoter 内 3878-3888 bp - 113 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 45999310-46001880(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCA
SmilChr04G002481 Chr04 NC_080390.1:39661076-39661086promoter 内 3873-3883 bp + 118 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 39659148-39660958(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAT
SmilChr05G001167 Chr05 NC_080391.1:9794808-9794818promoter 内 3851-3861 bp + 140 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 9793050-9794668(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATG
SmilChr06G001444 Chr06 NC_080392.1:15265290-15265300promoter 内 3846-3856 bp - 145 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 15265445-15268458(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATG
SmilChr04G002782 Chr04 NC_080390.1:43626273-43626283promoter 内 3816-3826 bp + 175 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 43624422-43626098(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTT
SmilChr05G002165 Chr05 NC_080391.1:22911329-22911339promoter 内 3795-3805 bp + 196 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 22905228-22911133(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAT
SmilChr03G000090 Chr03 NC_080389.1:1032057-1032067promoter 内 3790-3800 bp + 201 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 1018269-1031856(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAT
SmilChr06G002392 Chr06 NC_080392.1:34723947-34723957promoter 内 3695-3705 bp + 296 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 34724253-34725008(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTCC
SmilChr06G002394 Chr06 NC_080392.1:34736121-34736131promoter 内 3695-3705 bp + 296 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 34736427-34737182(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTCC
SmilChr06G002411 Chr06 NC_080392.1:34848861-34848871promoter 内 3673-3683 bp - 318 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 34847788-34848543(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTCC
SmilChr03G000092 Chr03 NC_080389.1:1032057-1032067promoter 内 3659-3669 bp + 332 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 1029068-1031725(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAT
SmilChr02G003359 Chr02 NC_080388.1:54738349-54738359promoter 内 3605-3615 bp - 386 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 54735600-54737963(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGGGCTGTCA
SmilChr05G001023 Chr05 NC_080391.1:8394781-8394791promoter 内 3602-3612 bp + 389 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 8393853-8394392(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGAG
SmilChr01G000872 Chr01 NC_080387.1:18595619-18595629promoter 内 3520-3530 bp - 471 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 18594111-18595148(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATAGCTGTCA
SmilChr03G000340 Chr03 NC_080389.1:3867860-3867870promoter 内 3411-3421 bp + 580 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 3859136-3867280(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAT
SmilChr01G002550 Chr01 NC_080387.1:43605155-43605165promoter 内 3404-3414 bp - 587 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 43605752-43610948(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGAG
SmilChr02G003442 Chr02 NC_080388.1:55700251-55700261promoter 内 3333-3343 bp + 658 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 55696078-55699593(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGGA
SmilChr05G000340 Chr05 NC_080391.1:2538879-2538889promoter 内 3328-3338 bp + 663 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 2539552-2543983(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGAGCTGTCG
SmilChr07G002417 Chr07 NC_080393.1:22519367-22519377promoter 内 3315-3325 bp - 676 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 22520053-22521551(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTT
SmilChr01G003888 Chr01 NC_080387.1:57197625-57197635promoter 内 3306-3316 bp - 685 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 57198320-57204154(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAT
SmilChr02G000877 Chr02 NC_080388.1:15096272-15096282promoter 内 3288-3298 bp - 703 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 15084624-15095569(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCA
SmilChr01G003597 Chr01 NC_080387.1:54520128-54520138promoter 内 3216-3226 bp + 775 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 54520913-54523342(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCA
SmilChr05G002991 Chr05 NC_080391.1:36636322-36636332promoter 内 3146-3156 bp - 845 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 36634650-36635477(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCA
SmilChr02G003670 Chr02 NC_080388.1:58094936-58094946promoter 内 3102-3112 bp + 889 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 58092009-58094047(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATG
SmilChr02G003669 Chr02 NC_080388.1:58084504-58084514promoter 内 3100-3110 bp + 891 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 58081509-58083613(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATG
SmilChr04G002471 Chr04 NC_080390.1:39525147-39525157promoter 内 3095-3105 bp - 896 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 39523722-39524251(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATAGCTGTCA
SmilChr03G002195 Chr03 NC_080389.1:34576780-34576790promoter 内 3072-3082 bp + 919 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 34574705-34575861(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGGA
SmilChr01G005376 Chr01 NC_080387.1:70986341-70986351promoter 内 3060-3070 bp - 931 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 70980715-70985410(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGAGCTGTCG
SmilChr06G001640 Chr06 NC_080392.1:18494639-18494649promoter 内 3033-3043 bp + 958 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 18495607-18500657(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAA
SmilChr01G001759 Chr01 NC_080387.1:32296284-32296294promoter 内 2966-2976 bp + 1025 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 32297319-32298592(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATAGCTGTCA
SmilChr03G001685 Chr03 NC_080389.1:22229598-22229608promoter 内 2932-2942 bp + 1059 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 22230667-22232603(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCA
SmilChr01G004540 Chr01 NC_080387.1:63545466-63545476promoter 内 2930-2940 bp - 1061 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 63546537-63551510(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATG
SmilChr01G001124 Chr01 NC_080387.1:22849264-22849274promoter 内 2920-2930 bp + 1071 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 22850345-22851537(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCA
SmilChr03G004453 Chr03 NC_080389.1:62648137-62648147promoter 内 2902-2912 bp - 1089 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 62649236-62651273(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATG
SmilChr07G003051 Chr07 NC_080393.1:31823193-31823203promoter 内 2793-2803 bp - 1198 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 31824401-31829535(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAT
SmilChr04G002078 Chr04 NC_080390.1:33536536-33536546promoter 内 2769-2779 bp - 1222 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 33537768-33538851(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATG
SmilChr04G002215 Chr04 NC_080390.1:35837959-35837969promoter 内 2651-2661 bp - 1340 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 35839309-35843360(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAT
SmilChr01G000389 Chr01 NC_080387.1:8012328-8012338promoter 内 2634-2644 bp - 1357 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 8008665-8010971(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGAGCTGTCG
SmilChr01G002615 Chr01 NC_080387.1:44418592-44418602promoter 内 2632-2642 bp + 1359 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 44411608-44417233(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATG
SmilChr05G000685 Chr05 NC_080391.1:5197503-5197513promoter 内 2608-2618 bp + 1383 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 5194324-5196120(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAT