转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 63 / 136 下载 TSV

上一页 63 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001286 Chr03 NC_080389.1:15059523-15059533promoter 内 2145-2155 bp - 1846 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 15061379-15065070(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCG
SmilChr04G000279 Chr04 NC_080390.1:2555856-2555866promoter 内 2143-2153 bp - 1848 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 2549172-2554008(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCGC
SmilChr02G003480 Chr02 NC_080388.1:56079735-56079745promoter 内 2105-2115 bp - 1886 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 56081631-56081721(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCG
SmilChr08G004351 Chr08 NC_080394.1:53209565-53209575promoter 内 2092-2102 bp - 1899 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 53211474-53217254(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCG
SmilChr07G000935 Chr07 NC_080393.1:6684284-6684294promoter 内 2036-2046 bp + 1955 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 6672879-6682329(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACGG
SmilChr05G001557 Chr05 NC_080391.1:14290291-14290301promoter 内 2011-2021 bp + 1980 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 14286013-14288311(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGGA
SmilChr03G002512 Chr03 NC_080389.1:39989128-39989138promoter 内 2008-2018 bp + 1983 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 39982391-39987145(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCG
SmilChr01G004248 Chr01 NC_080387.1:60786066-60786076promoter 内 1978-1988 bp + 2013 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 60783001-60784053(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACGG
SmilChr06G002922 Chr06 NC_080392.1:42089282-42089292promoter 内 1937-1947 bp - 2054 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 42080580-42087228(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCGC
SmilChr02G004582 Chr02 NC_080388.1:68302592-68302602promoter 内 1906-1916 bp - 2085 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 68304687-68310878(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCCCTGAGCC
SmilChr01G003357 Chr01 NC_080387.1:52321920-52321930promoter 内 1894-1904 bp - 2097 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 52318677-52319823(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGCT
SmilChr07G000509 Chr07 NC_080393.1:3579478-3579488promoter 内 1885-1895 bp + 2106 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 3581594-3584044(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCGC
SmilChr08G003075 Chr08 NC_080394.1:30935955-30935965promoter 内 1851-1861 bp + 2140 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 30938105-30940915(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCGC
SmilChr06G001705 Chr06 NC_080392.1:19602401-19602411promoter 内 1795-1805 bp - 2196 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 19604607-19607924(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCG
SmilChr01G005032 Chr01 NC_080387.1:68282813-68282823promoter 内 1786-1796 bp - 2205 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 68278485-68280608(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGTC
SmilChr01G002741 Chr01 NC_080387.1:45712141-45712151promoter 内 1784-1794 bp + 2207 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 45714358-45719100(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTTCAGCGCC
SmilChr01G005031 Chr01 NC_080387.1:68277310-68277320promoter 内 1779-1789 bp - 2212 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 68272982-68275098(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGTC
SmilChr07G004521 Chr07 NC_080393.1:57889139-57889149promoter 内 1718-1728 bp + 2273 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 57879265-57886866(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGGA
SmilChr04G002305 Chr04 NC_080390.1:37324297-37324307promoter 内 1713-1723 bp + 2278 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 37326585-37327405(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGCT
SmilChr06G000533 Chr06 NC_080392.1:4405423-4405433promoter 内 1707-1717 bp - 2284 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 4400996-4403139(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCGC
SmilChr03G000210 Chr03 NC_080389.1:2429830-2429840promoter 内 1621-1631 bp - 2370 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 2432210-2435614(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACGG
SmilChr08G001288 Chr08 NC_080394.1:10266805-10266815promoter 内 1551-1561 bp - 2440 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 10269255-10270153(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACGG
SmilChr02G004093 Chr02 NC_080388.1:63222328-63222338promoter 内 1529-1539 bp + 2462 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 63216526-63219866(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCG
SmilChr07G003335 Chr07 NC_080393.1:35729873-35729883promoter 内 1521-1531 bp - 2470 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 35732353-35733422(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCG
SmilChr01G005447 Chr01 NC_080387.1:71544058-71544068promoter 内 1442-1452 bp + 2549 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 71546617-71547534(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCGC
SmilChr01G004981 Chr01 NC_080387.1:67861078-67861088promoter 内 1406-1416 bp + 2585 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 67855820-67858493(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACGG
SmilChr01G001163 Chr01 NC_080387.1:23620883-23620893promoter 内 1371-1381 bp - 2620 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 23617057-23618263(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCACC
SmilChr07G001313 Chr07 NC_080393.1:10111976-10111986promoter 内 1232-1242 bp + 2759 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 10106138-10109217(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCG
SmilChr06G000576 Chr06 NC_080392.1:4910882-4910892promoter 内 1216-1226 bp - 2775 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 4903775-4908107(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGTC
SmilChr05G000679 Chr05 NC_080391.1:5179612-5179622promoter 内 1196-1206 bp - 2795 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 5182417-5183946(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCCCTGAGCC
SmilChr06G000871 Chr06 NC_080392.1:8231215-8231225promoter 内 1077-1087 bp + 2914 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 8234139-8237204(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCACC
SmilChr01G001386 Chr01 NC_080387.1:27258794-27258804promoter 内 1051-1061 bp - 2940 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 27261744-27264782(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGGA
SmilChr07G000810 Chr07 NC_080393.1:5717955-5717965promoter 内 1001-1011 bp - 2990 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 5710930-5714965(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGTCAGCGCC
SmilChr08G004095 Chr08 NC_080394.1:49634539-49634549promoter 内 879-889 bp + 3112 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 49628288-49631427(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCG
SmilChr01G001531 Chr01 NC_080387.1:29301317-29301327promoter 内 869-879 bp + 3122 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 29304449-29306676(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGGT
SmilChr06G001708 Chr06 NC_080392.1:19619219-19619229promoter 内 861-871 bp - 3130 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 19622359-19622953(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCG
SmilChr05G002201 Chr05 NC_080391.1:23467903-23467913promoter 内 832-842 bp - 3159 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 23461395-23464744(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGTCAGCGCC
SmilChr07G001481 Chr07 NC_080393.1:11655160-11655170promoter 内 810-820 bp - 3181 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 11650800-11651979(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGTC
SmilChr02G001072 Chr02 NC_080388.1:19097558-19097568promoter 内 803-813 bp + 3188 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 19100756-19104184(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGTC
SmilChr03G000948 Chr03 NC_080389.1:10749313-10749323promoter 内 778-788 bp - 3213 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 10752536-10754032(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCG
SmilChr01G001647 Chr01 NC_080387.1:30535779-30535789promoter 内 770-780 bp - 3221 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 30530273-30532558(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGCT
SmilChr05G003075 Chr05 NC_080391.1:38821850-38821860promoter 内 759-769 bp - 3232 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 38816599-38818618(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGTC
SmilChr05G000554 Chr05 NC_080391.1:4176996-4177006promoter 内 744-754 bp - 3247 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 4180253-4181336(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCG
SmilChr04G003965 Chr04 NC_080390.1:55143626-55143636promoter 内 732-742 bp + 3259 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 55138128-55140367(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCG
SmilChr05G000693 Chr05 NC_080391.1:5244222-5244232promoter 内 708-718 bp + 3283 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 5239438-5240939(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCG
SmilChr01G004254 Chr01 NC_080387.1:60824117-60824127promoter 内 680-690 bp + 3311 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 60827438-60828265(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGGT
SmilChr01G001448 Chr01 NC_080387.1:28184769-28184779promoter 内 632-642 bp + 3359 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 28179537-28181410(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCG
SmilChr03G002739 Chr03 NC_080389.1:43522781-43522791promoter 内 551-561 bp - 3440 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 43526231-43527896(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGTG
SmilChr02G001551 Chr02 NC_080388.1:28798406-28798416promoter 内 460-470 bp - 3531 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 28792844-28794875(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGTC
SmilChr06G002235 Chr06 NC_080392.1:31627224-31627234promoter 内 397-407 bp - 3594 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 31622861-31623630(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGTC