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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004607; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002089-RA_Salv SmilChr02G004607 C2H2 XP_057791470.1 MP00608 AAAAACAGAGCA

可能结合的靶基因

9817 个结合位点 6398 个候选靶基因 第 67 / 128 下载 TSV

上一页 67 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G006187 Chr01 NC_080387.1:77413769-77413780promoter 内 1783-1794 bp - 2207 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 77415987-77416394(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTCTT
SmilChr03G001614 Chr03 NC_080389.1:20528631-20528642promoter 内 1749-1760 bp - 2241 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 20530883-20533147(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTCTT
SmilChr02G001623 Chr02 NC_080388.1:30155806-30155817promoter 内 1712-1723 bp - 2278 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 30158095-30162904(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GCCTCTGTTCCA
SmilChr02G004784 Chr02 NC_080388.1:70018708-70018719promoter 内 1664-1675 bp - 2326 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 70015359-70016382(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAGAGCAGAGCA
SmilChr01G001658 Chr01 NC_080387.1:30645927-30645938promoter 内 1600-1611 bp - 2390 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 30648328-30650655(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ACCTCTGTTCTC
SmilChr03G001367 Chr03 NC_080389.1:16017640-16017651promoter 内 1579-1590 bp + 2411 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 16020062-16023039(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAGACAGAGCT
SmilChr02G001381 Chr02 NC_080388.1:26134718-26134729promoter 内 1472-1483 bp + 2518 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 26128696-26132200(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTCTCT
SmilChr02G000640 Chr02 NC_080388.1:9691715-9691726promoter 内 1441-1452 bp + 2549 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 9694275-9697341(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAGACAGAGCT
SmilChr02G001188 Chr02 NC_080388.1:21817355-21817366promoter 内 1421-1432 bp + 2569 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 21819935-21820904(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAACG
SmilChr03G000519 Chr03 NC_080389.1:5587452-5587463promoter 内 1420-1431 bp + 2570 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 5582001-5584882(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGTTCTGTTTCC
SmilChr02G005044 Chr02 NC_080388.1:72149554-72149565promoter 内 1387-1398 bp + 2603 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 72152168-72164421(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAACAGAACG
SmilChr02G000342 Chr02 NC_080388.1:4451966-4451977promoter 内 1345-1356 bp - 2645 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 4447221-4449321(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAGACAGAGCA
SmilChr01G001340 Chr01 NC_080387.1:26635745-26635756promoter 内 1222-1233 bp - 2768 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 26632222-26632977(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAACG
SmilChr01G001501 Chr01 NC_080387.1:28863229-28863240promoter 内 1023-1034 bp - 2967 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 28858320-28860262(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAGACAGAGCA
SmilChr01G000117 Chr01 NC_080387.1:2035140-2035151promoter 内 916-927 bp + 3074 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 2031059-2032066(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTCTCT
SmilChr02G001234 Chr02 NC_080388.1:22660820-22660831promoter 内 774-785 bp - 3216 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 22656557-22657604(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGAG
SmilChr01G001243 Chr01 NC_080387.1:24937526-24937537promoter 内 765-776 bp + 3225 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 24933517-24934301(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTCTCT
SmilChr03G001887 Chr03 NC_080389.1:26313570-26313581promoter 内 724-735 bp - 3266 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 26316847-26319373(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTA
SmilChr02G004786 Chr02 NC_080388.1:70018708-70018719promoter 内 692-703 bp - 3298 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 70022017-70025989(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTA
SmilChr02G001944 Chr02 NC_080388.1:35061263-35061274promoter 内 669-680 bp + 3321 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 35064595-35070207(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGAG
SmilChr01G004887 Chr01 NC_080387.1:66929512-66929523promoter 内 615-626 bp - 3375 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 66932898-66933727(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTCTTT
SmilChr02G000754 Chr02 NC_080388.1:12290216-12290227promoter 内 497-508 bp + 3493 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 12283657-12286723(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTA
SmilChr03G001807 Chr03 NC_080389.1:24679514-24679525promoter 内 431-442 bp - 3559 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 24675884-24675955(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGGAGCAGAGCA
SmilChr02G003041 Chr02 NC_080388.1:51146820-51146831promoter 内 416-427 bp - 3574 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 51150405-51151238(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCCA
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SmilChr01G002648 Chr01 NC_080387.1:44810841-44810852promoter 内 26-37 bp + 3964 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 44802533-44806877(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCCA
SmilChr02G003448 Chr02 NC_080388.1:55725469-55725480promoter 内 3989-4000 bp - 1 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 55722680-55725468(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAAGT
SmilChr01G002511 Chr01 NC_080387.1:43003694-43003705promoter 内 2044-2055 bp + 1946 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 43005651-43008379(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAAGA
SmilChr03G001176 Chr03 NC_080389.1:13519395-13519406promoter 内 1399-1410 bp - 2591 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 13521997-13523176(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCTTCTGTTTTA
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SmilChr01G001841 Chr01 NC_080387.1:33349727-33349738promoter 内 3590-3601 bp + 400 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 33350138-33352410(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAAGA
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SmilChr01G005286 Chr01 NC_080387.1:70218793-70218804promoter 内 3509-3520 bp - 481 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 70219285-70220126(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCTTCTGTTTTA
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SmilChr02G002287 Chr02 NC_080388.1:40405065-40405076promoter 内 580-591 bp - 3410 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 40408486-40415281(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GCTTCTGTTTCC
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SmilChr02G004215 Chr02 NC_080388.1:64395184-64395195promoter 内 433-444 bp + 3557 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 64388940-64391627(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCTTCTGTTTTA
SmilChr02G000092 Chr02 NC_080388.1:1200588-1200599promoter 内 413-424 bp - 3577 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 1204176-1206430(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCTTCTGTTTCA
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SmilChr01G003701 Chr01 NC_080387.1:55402288-55402299promoter 内 3813-3824 bp + 177 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 55396510-55402111(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCTTCTGTTTCA