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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 7 / 143 下载 TSV

上一页 7 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G002052 Chr04 NC_080390.1:33250409-33250420promoter 内 3280-3291 bp - 710 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 2 33245351-33249699(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTT
SmilChr07G000457 Chr07 NC_080393.1:3236523-3236534promoter 内 3136-3147 bp + 854 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 2 3233129-3235669(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGCGC
SmilChr06G000970 Chr06 NC_080392.1:9420059-9420070promoter 内 2456-2467 bp - 1534 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 2 9415331-9418525(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGCCAGCTGTA
SmilChr01G000546 Chr01 NC_080387.1:11274556-11274567promoter 内 1540-1551 bp - 2450 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 2 11270593-11272106(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTGGC
SmilChr01G003237 Chr01 NC_080387.1:51128435-51128446promoter 内 933-944 bp + 3057 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 2 51118984-51125378(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCGT
SmilChr01G003150 Chr01 NC_080387.1:50299947-50299958promoter 内 666-677 bp - 3324 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 2 50303282-50306067(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCGT
SmilChr01G003239 Chr01 NC_080387.1:51128435-51128446promoter 内 16-27 bp + 3974 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 2 51132420-51135151(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGCCAGCTGTA
SmilChr01G004320 Chr01 NC_080387.1:61368586-61368597promoter 内 15-26 bp - 3975 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 4 61372572-61375018(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTCAA
SmilChr06G001007 Chr06 NC_080392.1:9967287-9967298promoter 内 3808-3819 bp + 182 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 3 9967480-9967972(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAC
SmilChr03G003504 Chr03 NC_080389.1:53654627-53654638promoter 内 2403-2414 bp + 1587 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 3 53647339-53653040(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGCGA
SmilChr03G003505 Chr03 NC_080389.1:53654627-53654638promoter 内 1936-1947 bp + 2054 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 3 53656692-53659401(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGCCAGCTGTG
SmilChr06G000611 Chr06 NC_080392.1:5275061-5275072promoter 内 2516-2527 bp - 1474 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 5265840-5273587(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAC
SmilChr02G002436 Chr02 NC_080388.1:42480786-42480797promoter 内 1446-1457 bp + 2544 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 42476395-42478242(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTCAA
SmilChr01G001267 Chr01 NC_080387.1:25357154-25357165promoter 内 615-626 bp - 3375 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 25352681-25353779(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAC
SmilChr06G000080 Chr06 NC_080392.1:590606-590617promoter 内 419-430 bp + 3571 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 594188-600122(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGCCAGCTGTG
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SmilChr07G003859 Chr07 NC_080393.1:47977803-47977814promoter 内 1881-1892 bp + 2109 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 4 47975588-47975694(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAG
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SmilChr04G001077 Chr04 NC_080390.1:15454033-15454044promoter 内 894-905 bp - 3096 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 4 15457140-15458507(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAG
SmilChr02G000930 Chr02 NC_080388.1:16201733-16201744promoter 内 687-698 bp + 3303 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 4 16205047-16214520(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGTA
SmilChr08G003713 Chr08 NC_080394.1:41738478-41738489promoter 内 630-641 bp + 3360 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 4 41734426-41735118(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAG
SmilChr01G000590 Chr01 NC_080387.1:12827156-12827167promoter 内 325-336 bp + 3665 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 4 12820889-12823491(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAG
SmilChr04G001055 Chr04 NC_080390.1:15020346-15020357promoter 内 3617-3628 bp - 373 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 3 15020730-15023338(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAG
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SmilChr07G003298 Chr07 NC_080393.1:34797327-34797338promoter 内 3007-3018 bp - 983 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 3 34794888-34796344(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGTA
SmilChr02G001863 Chr02 NC_080388.1:33878111-33878122promoter 内 2946-2957 bp - 1044 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 3 33879166-33880307(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAG
SmilChr02G000609 Chr02 NC_080388.1:8892867-8892878promoter 内 2836-2847 bp + 1154 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 3 8894032-8900571(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGTA
SmilChr05G003481 Chr05 NC_080391.1:46204748-46204759promoter 内 2606-2617 bp - 1384 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 3 46206143-46208911(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAG
SmilChr02G005497 Chr02 NC_080388.1:75124815-75124826promoter 内 2543-2554 bp - 1447 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 3 75126273-75130033(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCAG
SmilChr05G003258 Chr05 NC_080391.1:42108569-42108580promoter 内 2391-2402 bp + 1599 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 3 42110179-42111174(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGTA
SmilChr03G001805 Chr03 NC_080389.1:24665367-24665378promoter 内 2380-2391 bp + 1610 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 3 24666988-24675013(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGTA
SmilChr05G002769 Chr05 NC_080391.1:32143926-32143937promoter 内 2144-2155 bp + 1846 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 3 32136306-32142080(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCGC
SmilChr05G002034 Chr05 NC_080391.1:21162140-21162151promoter 内 1765-1776 bp + 2225 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 3 21164376-21166848(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGTA
SmilChr03G001890 Chr03 NC_080389.1:26389903-26389914promoter 内 1601-1612 bp - 2389 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 3 26385874-26387514(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGTA
SmilChr04G002037 Chr04 NC_080390.1:33089424-33089435promoter 内 1593-1604 bp - 2397 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 3 33085708-33087027(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGTA
SmilChr03G002116 Chr03 NC_080389.1:32913505-32913516promoter 内 1540-1551 bp - 2450 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 3 32915966-32916445(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAG
SmilChr05G003241 Chr05 NC_080391.1:41664585-41664596promoter 内 1467-1478 bp - 2523 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 3 41667119-41669394(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAG
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SmilChr01G000904 Chr01 NC_080387.1:19093428-19093439promoter 内 1116-1127 bp + 2874 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 3 19086795-19090554(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAG
SmilChr05G002370 Chr05 NC_080391.1:25951925-25951936promoter 内 1074-1085 bp - 2916 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 3 25954852-25955773(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAG
SmilChr02G003928 Chr02 NC_080388.1:61353080-61353091promoter 内 1059-1070 bp + 2931 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 3 61356022-61361913(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTGGA
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SmilChr06G002571 Chr06 NC_080392.1:36882615-36882626promoter 内 185-196 bp + 3805 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 3 36878702-36878810(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAG
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SmilChr06G001980 Chr06 NC_080392.1:25193213-25193224promoter 内 3775-3786 bp - 215 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 25193439-25195096(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAG