转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 74 / 139 下载 TSV

上一页 74 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004402 Chr02 NC_080388.1:66356792-66356803promoter 内 801-812 bp - 3189 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 66353008-66353603(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGAGACGTGGT
SmilChr02G005053 Chr02 NC_080388.1:72236287-72236298promoter 内 801-812 bp - 3189 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 72239487-72242550(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGGTT
SmilChr01G005625 Chr01 NC_080387.1:72728363-72728374promoter 内 728-739 bp + 3262 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 72723566-72725101(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGAATA
SmilChr02G003438 Chr02 NC_080388.1:55667357-55667368promoter 内 607-618 bp - 3383 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 55663412-55663974(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAGAGACGTGGG
SmilChr04G002883 Chr04 NC_080390.1:45053306-45053317promoter 内 538-549 bp - 3452 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 45048692-45049854(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTGAGACGTGGG
SmilChr01G002272 Chr01 NC_080387.1:39493108-39493119promoter 内 484-495 bp + 3506 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 39488234-39489602(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACACGTCAGTA
SmilChr05G000321 Chr05 NC_080391.1:2413630-2413641promoter 内 447-458 bp - 3543 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 2403088-2410087(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCCGACGTGGA
SmilChr03G003996 Chr03 NC_080389.1:58999987-58999998promoter 内 418-429 bp + 3572 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 59003570-59004740(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCAAGACGTGGG
SmilChr01G003418 Chr01 NC_080387.1:52813726-52813737promoter 内 315-326 bp + 3675 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 52817412-52823614(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TATTCACGTGGC
SmilChr02G001792 Chr02 NC_080388.1:32676475-32676486promoter 内 310-321 bp + 3680 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 32680166-32682314(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACTGACGTGTG
SmilChr02G005401 Chr02 NC_080388.1:74563096-74563107promoter 内 293-304 bp + 3697 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 74566804-74569571(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTATCACGTGGC
SmilChr02G005412 Chr02 NC_080388.1:74599288-74599299promoter 内 293-304 bp + 3697 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 74602996-74605763(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTATCACGTGGC
SmilChr03G002631 Chr03 NC_080389.1:41782531-41782542promoter 内 254-265 bp - 3736 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 41777927-41778795(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACTGACGTGTC
SmilChr02G005411 Chr02 NC_080388.1:74594989-74595000promoter 内 225-236 bp + 3765 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 74598765-74599655(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTATCACGTGGC
SmilChr03G000953 Chr03 NC_080389.1:10789288-10789299promoter 内 203-214 bp + 3787 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 10782182-10785501(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCACGTCAGCT
SmilChr01G005240 Chr01 NC_080387.1:69949801-69949812promoter 内 88-99 bp + 3902 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 69953714-69954297(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGTGAT
SmilChr02G005414 Chr02 NC_080388.1:74605268-74605279promoter 内 84-95 bp + 3906 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 74609185-74610719(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTATCACGTGGC
SmilChr05G000322 Chr05 NC_080391.1:2413630-2413641promoter 内 54-65 bp - 3936 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 2417577-2421707(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGGAT
SmilChr03G003037 Chr03 NC_080389.1:47268883-47268894promoter 内 13-24 bp - 3977 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 47272871-47274909(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTTGG
SmilChr01G003939 Chr01 NC_080387.1:57724001-57724012promoter 内 3416-3427 bp - 574 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 3 57724586-57724936(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATGT
SmilChr04G002128 Chr04 NC_080390.1:34264310-34264321promoter 内 2965-2976 bp + 1025 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 3 34265346-34266165(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTATGACGTGGT
SmilChr02G002468 Chr02 NC_080388.1:43067987-43067998promoter 内 2798-2809 bp - 1192 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 3 43069190-43072353(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATGT
SmilChr02G005428 Chr02 NC_080388.1:74729577-74729588promoter 内 2797-2808 bp + 1193 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 3 74725462-74728384(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAATG
SmilChr04G002125 Chr04 NC_080390.1:34264310-34264321promoter 内 2348-2359 bp + 1642 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 3 34258065-34262668(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCATAG
SmilChr02G000815 Chr02 NC_080388.1:13641817-13641828promoter 内 2186-2197 bp - 1804 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 3 13643632-13649062(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCACGTCAGTG
SmilChr04G002130 Chr04 NC_080390.1:34264310-34264321promoter 内 1861-1872 bp + 2129 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 3 34266450-34267918(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTATGACGTGGT
SmilChr02G005368 Chr02 NC_080388.1:74374289-74374300promoter 内 1598-1609 bp + 2392 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 3 74368868-74371897(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAAAC
SmilChr01G000731 Chr01 NC_080387.1:16272037-16272048promoter 内 9-20 bp - 3981 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 3 16265866-16268056(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAATGACGTGGT
SmilChr02G005584 Chr02 NC_080388.1:75659640-75659651promoter 内 3964-3975 bp + 26 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 75651935-75659614(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCACAT
SmilChr02G004363 Chr02 NC_080388.1:65920557-65920568promoter 内 3879-3890 bp - 111 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 65920679-65922154(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGACGTCAGAT
SmilChr01G003917 Chr01 NC_080387.1:57442468-57442479promoter 内 3715-3726 bp - 275 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 57442754-57447133(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTTCT
SmilChr03G003707 Chr03 NC_080389.1:56010355-56010366promoter 内 3714-3725 bp - 276 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 56010642-56012642(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATGT
SmilChr01G005298 Chr01 NC_080387.1:70279522-70279533promoter 内 3589-3600 bp + 401 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 70279934-70281517(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CATTGACGTGGT
SmilChr02G002736 Chr02 NC_080388.1:47299288-47299299promoter 内 3578-3589 bp - 412 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 47299711-47301460(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCATAT
SmilChr01G000244 Chr01 NC_080387.1:4528526-4528537promoter 内 3538-3549 bp - 452 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 4526622-4528074(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAATGACGTGGT
SmilChr03G003578 Chr03 NC_080389.1:54391055-54391066promoter 内 3535-3546 bp + 455 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 54391521-54397746(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AAGTGACGTGGT
SmilChr02G000833 Chr02 NC_080388.1:14101485-14101496promoter 内 3371-3382 bp - 619 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 14102115-14103030(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGACGTCAGAT
SmilChr04G004045 Chr04 NC_080390.1:55670942-55670953promoter 内 3174-3185 bp + 816 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 55671769-55674743(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTATGACGTGGT
SmilChr03G003703 Chr03 NC_080389.1:55979108-55979119promoter 内 3167-3178 bp + 823 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 55979942-55982925(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATTTGACGTGGG
SmilChr01G001064 Chr01 NC_080387.1:21996413-21996424promoter 内 2738-2749 bp + 1252 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 21997676-21998775(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACATGACGTGGA
SmilChr04G000470 Chr04 NC_080390.1:5019258-5019269promoter 内 2651-2662 bp + 1339 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 5020608-5021363(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATTTGACGTGGG
SmilChr04G000887 Chr04 NC_080390.1:11355615-11355626promoter 内 2551-2562 bp - 1439 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 11357065-11366190(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATTG
SmilChr01G002430 Chr01 NC_080387.1:41844403-41844414promoter 内 2492-2503 bp - 1498 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 41837718-41842905(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGTAGACGTGGT
SmilChr03G001535 Chr03 NC_080389.1:19212010-19212021promoter 内 2474-2485 bp - 1516 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 19213537-19214357(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCATGT
SmilChr03G000683 Chr03 NC_080389.1:7630038-7630049promoter 内 2437-2448 bp + 1553 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 7631602-7633987(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CATTGACGTGGA
SmilChr02G004035 Chr02 NC_080388.1:62650524-62650535promoter 内 2362-2373 bp - 1628 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 62652163-62655801(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATGT
SmilChr02G004835 Chr02 NC_080388.1:70470941-70470952promoter 内 2337-2348 bp + 1653 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 70472605-70475789(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGAACACGTGGC
SmilChr02G003082 Chr02 NC_080388.1:51743811-51743822promoter 内 2224-2235 bp + 1766 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 51741973-51742045(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTACA
SmilChr01G003901 Chr01 NC_080387.1:57293218-57293229promoter 内 2080-2091 bp - 1910 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 57295139-57298637(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTTCT
SmilChr01G005874 Chr01 NC_080387.1:74701290-74701301promoter 内 1827-1838 bp - 2163 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 74686291-74699127(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACTTGACGTGGT