转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G000478; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001018-RA_Salv SmilChr08G000478 GATA XP_057781809.1 MP00130 AGATCTAGATCTGAA

可能结合的靶基因

9821 个结合位点 6015 个候选靶基因 第 8 / 121 下载 TSV

上一页 8 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G000378 Chr04 NC_080390.1:3800386-3800400promoter 内 3800-3814 bp + 187 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 3800587-3803585(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CGGTCCAGATCTGAT
SmilChr01G001222 Chr01 NC_080387.1:24507945-24507959promoter 内 3124-3138 bp - 863 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 24490718-24507082(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CGGTCCAGATCTGAT
SmilChr01G004516 Chr01 NC_080387.1:63288824-63288838promoter 内 2937-2951 bp + 1050 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 63281065-63287774(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTCAGATCCAGCCCC
SmilChr03G002935 Chr03 NC_080389.1:46088291-46088305promoter 内 2549-2563 bp + 1438 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 46089743-46089829(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AAGTTCAGATCTGGG
SmilChr04G001431 Chr04 NC_080390.1:23346610-23346624promoter 内 2402-2416 bp + 1585 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 23343883-23345025(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCTGGATGA
SmilChr02G002297 Chr02 NC_080388.1:40515051-40515065promoter 内 2370-2384 bp - 1617 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 40506142-40513434(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AAGTTCAGATCTGGG
SmilChr02G004760 Chr02 NC_080388.1:69790103-69790117promoter 内 2025-2039 bp + 1962 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 69792079-69794247(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GGATCTAGATCTAAT
SmilChr04G000834 Chr04 NC_080390.1:10474879-10474893promoter 内 1951-1965 bp - 2036 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 10476929-10478260(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTCAGATCTGGATAC
SmilChr02G001612 Chr02 NC_080388.1:30016031-30016045promoter 内 1817-1831 bp + 2170 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 30009153-30013861(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GGCAGATCTGGATCT
SmilChr03G003220 Chr03 NC_080389.1:49837696-49837710promoter 内 1576-1590 bp - 2411 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 49833183-49835285(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTATCCAGATCTGAC
SmilChr03G001336 Chr03 NC_080389.1:15601369-15601383promoter 内 1545-1559 bp - 2442 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 15595801-15598927(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AAGTTCAGATCTGGG
SmilChr02G000148 Chr02 NC_080388.1:1976797-1976811promoter 内 358-372 bp + 3629 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 1980440-1981591(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGAGCCAGATCTGCG
SmilChr02G001131 Chr02 NC_080388.1:20454169-20454183promoter 内 1304-1318 bp - 2683 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 20456866-20457752(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CGCAGATCTGGCTCT
SmilChr04G000835 Chr04 NC_080390.1:10487091-10487105promoter 内 2272-2286 bp - 1715 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 6 10488820-10491275(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTCAGATCTGGACGA
SmilChr02G000189 Chr02 NC_080388.1:2357710-2357724promoter 内 742-756 bp - 3245 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 6 2360969-2364496(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTCAGATCTGGACGA
SmilChr05G001229 Chr05 NC_080391.1:10373600-10373614promoter 内 1066-1080 bp - 2921 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 10368911-10370679(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGCTCTGGATCTGAA
SmilChr02G001802 Chr02 NC_080388.1:32875737-32875751promoter 内 2982-2996 bp - 1005 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 32876756-32879335(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CCCAGATCTGGTCCA
SmilChr02G005020 Chr02 NC_080388.1:71964178-71964192promoter 内 1689-1703 bp + 2298 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 71966490-71968279(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AAATCCAGATCTGCA
SmilChr02G002632 Chr02 NC_080388.1:45700753-45700767promoter 内 702-716 bp + 3285 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 45697397-45697468(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTCAGATCTGTTTCT
SmilChr03G001438 Chr03 NC_080389.1:17067374-17067388promoter 内 583-597 bp - 3404 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 17070792-17073998(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTCAGATCTGTTTCT
SmilChr02G001803 Chr02 NC_080388.1:32875737-32875751promoter 内 45-59 bp - 3942 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 32879693-32882684(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CCCAGATCTGGTCCA
SmilChr01G002489 Chr01 NC_080387.1:42612389-42612403promoter 内 3822-3836 bp - 165 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 42609779-42612224(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GGATCTAGATCTCAT
SmilChr01G006067 Chr01 NC_080387.1:76076898-76076912promoter 内 3545-3559 bp + 442 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 76077354-76078168(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGAAACAGATCTGAG
SmilChr01G004591 Chr01 NC_080387.1:63918834-63918848promoter 内 3261-3275 bp - 726 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 63914506-63918108(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GGCTTCAGATCTGAA
SmilChr05G001344 Chr05 NC_080391.1:11872796-11872810promoter 内 3073-3087 bp - 914 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 11873724-11877614(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CCCAGATCTGGCGCC
SmilChr01G001936 Chr01 NC_080387.1:34557888-34557902promoter 内 2744-2758 bp - 1243 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 34555603-34556645(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GGTTCTAGATCTGAC
SmilChr04G000045 Chr04 NC_080390.1:423737-423751promoter 内 1792-1806 bp - 2195 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 419699-421542(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGAATCAGATCTGGA
SmilChr01G004592 Chr01 NC_080387.1:63918834-63918848promoter 内 1400-1414 bp - 2587 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 63921435-63922453(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCTGAAGCC
SmilChr03G001697 Chr03 NC_080389.1:22517008-22517022promoter 内 519-533 bp + 3468 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 22520490-22521910(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGAAACAGATCTGAG
SmilChr05G000088 Chr05 NC_080391.1:487740-487754promoter 内 27-41 bp + 3960 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 491714-494629(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGCTCTGGATCTGAA
SmilChr02G001914 Chr02 NC_080388.1:34445931-34445945promoter 内 3307-3321 bp + 680 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 34443481-34445251(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACCAGATCTAGACTC
SmilChr04G000962 Chr04 NC_080390.1:12797610-12797624promoter 内 2435-2449 bp - 1552 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 12793273-12796058(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GGTTTCGGATCTGAA
SmilChr02G003106 Chr02 NC_080388.1:51982070-51982084promoter 内 2270-2284 bp - 1717 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 51983801-52028202(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TCCAGATCTAGACTC
SmilChr04G002054 Chr04 NC_080390.1:33277039-33277053promoter 内 1861-1875 bp - 2126 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 33271976-33274913(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GACTCCGGATCTGAA
SmilChr02G001507 Chr02 NC_080388.1:28095572-28095586promoter 内 1670-1684 bp + 2317 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 28091874-28093255(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTGAGATCTAGACCC
SmilChr01G003311 Chr01 NC_080387.1:51795894-51795908promoter 内 1633-1647 bp - 2354 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 51791498-51793540(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TGGACCGGATCTGAG
SmilChr03G002887 Chr03 NC_080389.1:45525698-45525712promoter 内 1616-1630 bp - 2371 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 45520383-45523327(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TGGACCGGATCTGAG
SmilChr01G004263 Chr01 NC_080387.1:60896045-60896059promoter 内 1956-1970 bp + 2031 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 10 60898090-60902347(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CGATCCAGATCTGGC
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SmilChr01G005117 Chr01 NC_080387.1:68945874-68945888promoter 内 387-401 bp + 3600 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 4 68949488-68952268(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CGATCCAGATCTGGC
SmilChr01G002653 Chr01 NC_080387.1:44843161-44843175promoter 内 3293-3307 bp + 694 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 44839835-44842467(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCTATATCC
SmilChr01G002659 Chr01 NC_080387.1:44843161-44843175promoter 内 2859-2873 bp + 1128 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 44841936-44842033(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCTATATCC
SmilChr01G002658 Chr01 NC_080387.1:44843161-44843175promoter 内 2509-2523 bp + 1478 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 44841605-44841683(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCTATATCC
SmilChr03G003296 Chr03 NC_080389.1:51087250-51087264promoter 内 2446-2460 bp - 1541 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 51088805-51091756(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACCAGATCTGATTCT
SmilChr01G002657 Chr01 NC_080387.1:44843161-44843175promoter 内 2326-2340 bp + 1661 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 44841411-44841500(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCTATATCC
SmilChr01G002656 Chr01 NC_080387.1:44843161-44843175promoter 内 1971-1985 bp + 2016 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 44841020-44841145(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCTATATCC
SmilChr01G002655 Chr01 NC_080387.1:44843161-44843175promoter 内 1612-1626 bp + 2375 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 44840703-44840786(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCTATATCC
SmilChr01G002654 Chr01 NC_080387.1:44843161-44843175promoter 内 1476-1490 bp + 2511 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 44840508-44840650(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCTATATCC
SmilChr02G004687 Chr02 NC_080388.1:69196863-69196877promoter 内 366-380 bp + 3621 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 69190049-69193242(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCTAGAATC
SmilChr02G005091 Chr02 NC_080388.1:72500306-72500320promoter 内 3204-3218 bp - 783 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 72501103-72503096(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACCAGATCTGAAACC