转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 80 / 148 下载 TSV

上一页 80 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000195 Chr01 NC_080387.1:3370290-3370303promoter 内 1567-1580 bp + 2421 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 3372724-3373659(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGACCAGCACGTGG
SmilChr05G001573 Chr05 NC_080391.1:14405729-14405742promoter 内 1362-1375 bp - 2626 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 14402231-14403103(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAAGGTCAGGTGG
SmilChr04G001019 Chr04 NC_080390.1:14251445-14251458promoter 内 1189-1202 bp + 2799 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 14246309-14248646(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAACGTA
SmilChr02G002951 Chr02 NC_080388.1:50059630-50059643promoter 内 1186-1199 bp - 2802 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 50052333-50056828(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGCAAATCACGTGC
SmilChr04G003497 Chr04 NC_080390.1:51385551-51385564promoter 内 1170-1183 bp - 2818 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 51388382-51391111(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGAACCA
SmilChr02G003852 Chr02 NC_080388.1:60293599-60293612promoter 内 1113-1126 bp - 2875 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 60290627-60290724(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGGTGTCCACGTGG
SmilChr02G002907 Chr02 NC_080388.1:49378182-49378195promoter 内 1110-1123 bp + 2878 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 49381073-49385561(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGCAAATCACGTGC
SmilChr02G002869 Chr02 NC_080388.1:48881119-48881132promoter 内 1076-1089 bp - 2912 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 48884044-48887808(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCAGTGTT
SmilChr03G003730 Chr03 NC_080389.1:56328562-56328575promoter 内 822-835 bp + 3166 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 56331741-56336354(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAAGCATCACGTGG
SmilChr08G001614 Chr08 NC_080394.1:13348211-13348224promoter 内 749-762 bp - 3239 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 13351463-13352418(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTACCAT
SmilChr02G002468 Chr02 NC_080388.1:43065825-43065838promoter 内 636-649 bp - 3352 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 43069190-43072353(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAGGCGTA
SmilChr03G001820 Chr03 NC_080389.1:24845041-24845054promoter 内 616-629 bp + 3372 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 24848426-24858099(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCACTTCACGTGT
SmilChr04G000523 Chr04 NC_080390.1:5750284-5750297promoter 内 603-616 bp + 3385 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 5753682-5764897(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTCAACTCACGTGC
SmilChr07G002442 Chr07 NC_080393.1:22864728-22864741promoter 内 559-572 bp + 3429 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 22868170-22869894(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGATGAGCACGTGG
SmilChr03G004687 Chr03 NC_080389.1:64260342-64260355promoter 内 539-552 bp + 3449 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 64263804-64269899(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAATTTCACGTGA
SmilChr07G000628 Chr07 NC_080393.1:4241912-4241925promoter 内 527-540 bp + 3461 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 4237684-4238451(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGAACTTC
SmilChr04G000655 Chr04 NC_080390.1:7431754-7431767promoter 内 487-500 bp + 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 7425185-7428253(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAACTCTT
SmilChr03G001253 Chr03 NC_080389.1:14460540-14460553promoter 内 398-411 bp - 3590 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 14450949-14456950(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GATTAGGCACGTGG
SmilChr01G001986 Chr01 NC_080387.1:35297352-35297365promoter 内 264-277 bp + 3724 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 35291055-35293628(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGCAGAA
SmilChr05G002111 Chr05 NC_080391.1:22127623-22127636promoter 内 235-248 bp - 3753 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 22120479-22123870(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGATTCTCACGTGG
SmilChr01G004234 Chr01 NC_080387.1:60710060-60710073promoter 内 185-198 bp + 3803 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 60704975-60706257(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGAGTTGAC
SmilChr07G002036 Chr07 NC_080393.1:18453137-18453150promoter 内 176-189 bp + 3812 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 18456962-18465975(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAAATCACACGTGG
SmilChr02G000087 Chr02 NC_080388.1:1137622-1137635promoter 内 163-176 bp + 3825 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 1130713-1133797(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCGTCAAT
SmilChr02G004184 Chr02 NC_080388.1:64167569-64167582promoter 内 153-166 bp + 3835 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 64157960-64163734(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTACCAT
SmilChr07G003607 Chr07 NC_080393.1:42323897-42323910promoter 内 153-166 bp + 3835 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 42319340-42320062(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAACTGAA
SmilChr01G004104 Chr01 NC_080387.1:59555967-59555980promoter 内 113-126 bp + 3875 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 59542606-59552092(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCAGTTT
SmilChr01G004144 Chr01 NC_080387.1:59943703-59943716promoter 内 22-35 bp - 3966 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 59934933-59939737(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAACTGACACGTGG
SmilChr06G000589 Chr06 NC_080392.1:5072794-5072807promoter 内 20-33 bp + 3968 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 5076775-5078108(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GACCGTACACGTGG
SmilChr05G003484 Chr05 NC_080391.1:46291445-46291458promoter 内 15-28 bp - 3973 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 46295431-46296483(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCTACTCA
SmilChr08G001314 Chr08 NC_080394.1:10475726-10475739promoter 内 3214-3227 bp - 774 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 10468061-10474952(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAAAACACACGTGG
SmilChr03G000305 Chr03 NC_080389.1:3480815-3480828promoter 内 3904-3917 bp - 84 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 3475239-3480731(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCTACTCACGTGA
SmilChr05G001098 Chr05 NC_080391.1:9145235-9145248promoter 内 3761-3774 bp - 227 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 9145475-9147912(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGTTTTT
SmilChr07G003320 Chr07 NC_080393.1:35460823-35460836promoter 内 3649-3662 bp + 339 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 35461175-35462572(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTCACCTCACGTGA
SmilChr05G002490 Chr05 NC_080391.1:27564150-27564163promoter 内 3018-3031 bp - 970 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 27562330-27563180(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAGAATCACGTGA
SmilChr07G004177 Chr07 NC_080393.1:53727739-53727752promoter 内 2872-2885 bp - 1116 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 53723650-53726623(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AACCCGTCACGTGT
SmilChr02G002675 Chr02 NC_080388.1:46344730-46344743promoter 内 2852-2865 bp - 1136 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 46342933-46343594(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AACCCGTCACGTGT
SmilChr03G003897 Chr03 NC_080389.1:58057291-58057304promoter 内 2412-2425 bp - 1576 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 58058880-58058953(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGCGCTA
SmilChr03G001594 Chr03 NC_080389.1:20208887-20208900promoter 内 1786-1799 bp - 2202 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 20211102-20212200(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAGGAGCT
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SmilChr02G000727 Chr02 NC_080388.1:11818423-11818436promoter 内 1065-1078 bp + 2923 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 11821359-11822787(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CTACAGCCACGTGG
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SmilChr02G004905 Chr02 NC_080388.1:71036517-71036530promoter 内 3920-3933 bp - 68 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 71033826-71036449(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTGAAAGCACGTGG
SmilChr02G000273 Chr02 NC_080388.1:3516000-3516013promoter 内 3805-3818 bp - 183 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 3515075-3515817(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGATGCTCACGTGC
SmilChr01G001047 Chr01 NC_080387.1:21757488-21757501promoter 内 3800-3813 bp + 188 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 21757689-21759255(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CACGTCTCACGTGC
SmilChr03G003645 Chr03 NC_080389.1:55125735-55125748promoter 内 3778-3791 bp - 210 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 55124810-55125525(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGACTGTCACGTGT
SmilChr05G002701 Chr05 NC_080391.1:30985268-30985281promoter 内 3768-3781 bp + 220 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 30983100-30985048(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGAACTTCT
SmilChr01G001069 Chr01 NC_080387.1:22064245-22064258promoter 内 3760-3773 bp - 228 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 22062484-22064017(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CACGTCTCACGTGC
SmilChr07G003822 Chr07 NC_080393.1:47261471-47261484promoter 内 3702-3715 bp + 286 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 47261770-47262135(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTAGATCACGTGC