转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 84 / 139 下载 TSV

上一页 84 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G004027 Chr04 NC_080390.1:55521820-55521831promoter 内 2924-2935 bp - 1066 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 55517467-55520754(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCTGACGGGGT
SmilChr01G001510 Chr01 NC_080387.1:28932712-28932723promoter 内 2391-2402 bp + 1599 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 28934322-28936840(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCTGACGGGGT
SmilChr02G000645 Chr02 NC_080388.1:9734091-9734102promoter 内 2169-2180 bp - 1821 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 9735923-9737129(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCGCGTCAGCC
SmilChr01G005928 Chr01 NC_080387.1:75074457-75074468promoter 内 2052-2063 bp - 1938 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 75076406-75077641(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGAAA
SmilChr03G003577 Chr03 NC_080389.1:54385150-54385161promoter 内 1870-1881 bp - 2120 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 54379225-54383030(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACGGACGTGGC
SmilChr02G000336 Chr02 NC_080388.1:4255805-4255816promoter 内 1105-1116 bp + 2885 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 4249585-4252920(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCACGTCACCT
SmilChr04G000606 Chr04 NC_080390.1:6863209-6863220promoter 内 897-908 bp - 3093 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 6853578-6860116(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCTGACGGGGT
SmilChr02G000167 Chr02 NC_080388.1:2161832-2161843promoter 内 726-737 bp - 3264 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 2165107-2171928(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCGCGTCAGCT
SmilChr02G000486 Chr02 NC_080388.1:6629889-6629900promoter 内 3922-3933 bp + 68 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 6629968-6632943(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTTGACGTGAC
SmilChr02G003772 Chr02 NC_080388.1:59409969-59409980promoter 内 3497-3508 bp + 493 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 59408949-59409476(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCAACA
SmilChr03G004075 Chr03 NC_080389.1:59702617-59702628promoter 内 3479-3490 bp + 511 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 59699018-59702106(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGATA
SmilChr04G004070 Chr04 NC_080390.1:55796401-55796412promoter 内 3046-3057 bp + 944 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 55797356-55799899(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCTGACGGGGA
SmilChr03G001185 Chr03 NC_080389.1:13610268-13610279promoter 内 2963-2974 bp - 1027 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 13611306-13612343(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCGCGTCAGCC
SmilChr03G000614 Chr03 NC_080389.1:6806987-6806998promoter 内 2911-2922 bp + 1079 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 6804871-6805908(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCGCGTCAGCC
SmilChr02G001996 Chr02 NC_080388.1:36068644-36068655promoter 内 2848-2859 bp - 1142 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 36054525-36067502(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCTGACGAGGG
SmilChr02G003800 Chr02 NC_080388.1:59633626-59633637promoter 内 2579-2590 bp + 1411 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 59631682-59632215(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCAACA
SmilChr05G000269 Chr05 NC_080391.1:2082435-2082446promoter 内 2568-2579 bp + 1422 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 2057143-2081013(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCTCGTCAGCG
SmilChr04G002261 Chr04 NC_080390.1:36579400-36579411promoter 内 2434-2445 bp - 1556 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 36576393-36577844(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCTGACGCGGT
SmilChr02G002026 Chr02 NC_080388.1:36504373-36504384promoter 内 2413-2424 bp + 1577 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 36502182-36502796(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCACGTCACCG
SmilChr02G002027 Chr02 NC_080388.1:36508229-36508240promoter 内 2413-2424 bp + 1577 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 36506038-36506652(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCACGTCACCG
SmilChr02G002732 Chr02 NC_080388.1:47238250-47238261promoter 内 1768-1779 bp + 2222 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 47232592-47236028(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCACGTCATCG
SmilChr02G004576 Chr02 NC_080388.1:68264637-68264648promoter 内 1660-1671 bp - 2330 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 68256724-68262307(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTTGACGTGAC
SmilChr03G000142 Chr03 NC_080389.1:1612804-1612815promoter 内 1590-1601 bp + 2400 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 1547153-1610404(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCCCGTCAGCC
SmilChr02G003733 Chr02 NC_080388.1:58971494-58971505promoter 内 1573-1584 bp - 2417 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 58964002-58969077(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACGGACGTGGC
SmilChr04G003483 Chr04 NC_080390.1:51279203-51279214promoter 内 1497-1508 bp + 2493 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 51281707-51292148(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCGGACGTGGC
SmilChr04G000100 Chr04 NC_080390.1:902948-902959promoter 内 1231-1242 bp + 2759 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 905718-910298(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTTGACGTGAC
SmilChr03G000613 Chr03 NC_080389.1:6806987-6806998promoter 内 1180-1191 bp + 2810 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 6800230-6804177(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCGCGTCAGCC
SmilChr02G004889 Chr02 NC_080388.1:70949974-70949985promoter 内 1085-1096 bp + 2905 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 70945121-70947069(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCCCGTCAGCG
SmilChr04G002016 Chr04 NC_080390.1:32682994-32683005promoter 内 1007-1018 bp + 2983 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 32677657-32680011(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCACGTCACCG
SmilChr02G003734 Chr02 NC_080388.1:58976756-58976767promoter 内 723-734 bp - 3267 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 58971007-58973489(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTTGACGTGAC
SmilChr02G003222 Chr02 NC_080388.1:53440858-53440869promoter 内 450-461 bp - 3540 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 53444409-53444987(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCCCGTCAGCG
SmilChr04G000478 Chr04 NC_080390.1:5094368-5094379promoter 内 344-355 bp + 3646 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 5098025-5100657(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCGGACGTGGC
SmilChr04G000031 Chr04 NC_080390.1:309174-309185promoter 内 240-251 bp - 3750 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 312935-317187(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCCGAC
SmilChr02G005300 Chr02 NC_080388.1:73957580-73957591promoter 内 231-242 bp - 3759 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 73951277-73953821(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGATGACGTGCG
SmilChr04G003253 Chr04 NC_080390.1:49279529-49279540promoter 内 3747-3758 bp - 243 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 3 49278281-49279286(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCAACACGTGGC
SmilChr02G001620 Chr02 NC_080388.1:30139455-30139466promoter 内 3168-3179 bp - 822 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 3 30140288-30143101(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCAC
SmilChr02G000978 Chr02 NC_080388.1:17149766-17149777promoter 内 2739-2750 bp + 1251 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 3 17151028-17160868(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCTGACGTGTA
SmilChr02G001137 Chr02 NC_080388.1:20500266-20500277promoter 内 2626-2637 bp - 1364 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 3 20501641-20503792(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCAC
SmilChr02G001165 Chr02 NC_080388.1:21298702-21298713promoter 内 2553-2564 bp - 1437 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 3 21300150-21300222(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCAC
SmilChr01G001090 Chr01 NC_080387.1:22355816-22355827promoter 内 2465-2476 bp + 1525 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 3 22352657-22354291(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCAC
SmilChr01G000194 Chr01 NC_080387.1:3355284-3355295promoter 内 2320-2331 bp + 1670 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 3 3351514-3353614(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCAC
SmilChr01G000465 Chr01 NC_080387.1:9534040-9534051promoter 内 2284-2295 bp - 1706 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 3 9535757-9539133(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCAC
SmilChr02G003013 Chr02 NC_080388.1:50817549-50817560promoter 内 2270-2281 bp + 1720 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 3 50814886-50815829(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCAC
SmilChr04G003254 Chr04 NC_080390.1:49279562-49279573promoter 内 2232-2243 bp + 1758 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 3 49281331-49283072(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTGACACGTGGC
SmilChr03G002750 Chr03 NC_080389.1:43677896-43677907promoter 内 1069-1080 bp - 2921 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 3 43680828-43688933(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCAC
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SmilChr01G000538 Chr01 NC_080387.1:11060802-11060813promoter 内 863-874 bp + 3127 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 3 11063940-11065616(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTGACACGTGGC
SmilChr02G002690 Chr02 NC_080388.1:46600600-46600611promoter 内 309-320 bp - 3681 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 3 46604292-46608803(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTGAA
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SmilChr01G001694 Chr01 NC_080387.1:31193997-31194008promoter 内 3923-3934 bp + 67 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 31194075-31199123(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCAACACGTGGC