转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G002364; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00006712-RA_Salv SmilChr05G002364 WRKY XP_057809766.1 MP00069 AGTCAACG

可能结合的靶基因

9917 个结合位点 7882 个候选靶基因 第 84 / 158 下载 TSV

上一页 84 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003987 Chr02 NC_080388.1:62122854-62122861promoter 内 1074-1081 bp + 2920 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 62125781-62129586(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACC
SmilChr06G000151 Chr06 NC_080392.1:1062066-1062073promoter 内 1070-1077 bp - 2924 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 1053337-1059142(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACC
SmilChr04G000061 Chr04 NC_080390.1:549382-549389promoter 内 1067-1074 bp - 2927 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 552316-553638(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 GGTTGACT
SmilChr05G002501 Chr05 NC_080391.1:27726232-27726239promoter 内 1065-1072 bp - 2929 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 27729168-27732293(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 GGTTGACT
SmilChr02G005437 Chr02 NC_080388.1:74785828-74785835promoter 内 1064-1071 bp + 2930 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 74777892-74782898(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 GGTTGACT
SmilChr03G003494 Chr03 NC_080389.1:53516438-53516445promoter 内 1063-1070 bp - 2931 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 53508101-53513507(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACC
SmilChr05G002041 Chr05 NC_080391.1:21256353-21256360promoter 内 1057-1064 bp + 2937 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 21252103-21253416(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 GGTTGACT
SmilChr07G003486 Chr07 NC_080393.1:39363297-39363304promoter 内 1055-1062 bp - 2939 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 39359894-39360358(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACC
SmilChr02G005187 Chr02 NC_080388.1:73179713-73179720promoter 内 1052-1059 bp + 2942 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 73182662-73184352(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACC
SmilChr02G002004 Chr02 NC_080388.1:36184580-36184587promoter 内 1050-1057 bp + 2944 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 36187531-36187691(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACC
SmilChr03G000188 Chr03 NC_080389.1:2098196-2098203promoter 内 1047-1054 bp + 2947 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 2091044-2095249(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 GGTTGACT
SmilChr03G001956 Chr03 NC_080389.1:27964372-27964379promoter 内 1047-1054 bp - 2947 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 27967326-27967778(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 GGTTGACT
SmilChr06G001567 Chr06 NC_080392.1:17125279-17125286promoter 内 1043-1050 bp - 2951 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 17128237-17131047(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 GGTTGACT
SmilChr04G000825 Chr04 NC_080390.1:10382439-10382446promoter 内 1040-1047 bp + 2954 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 10378136-10379485(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 GGTTGACT
SmilChr04G000333 Chr04 NC_080390.1:3070477-3070484promoter 内 1034-1041 bp - 2960 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 3066259-3067517(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACC
SmilChr02G003263 Chr02 NC_080388.1:53923054-53923061promoter 内 1032-1039 bp - 2962 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 53917226-53920092(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACC
SmilChr04G000164 Chr04 NC_080390.1:1480134-1480141promoter 内 1028-1035 bp - 2966 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 1483107-1484835(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 GGTTGACT
SmilChr03G002714 Chr03 NC_080389.1:43102734-43102741promoter 内 1023-1030 bp + 2971 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 43097783-43099763(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 GGTTGACT
SmilChr03G000908 Chr03 NC_080389.1:10402898-10402905promoter 内 1021-1028 bp + 2973 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 10405878-10409933(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACC
SmilChr05G004334 Chr05 NC_080391.1:57021713-57021720promoter 内 1021-1028 bp - 2973 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 57024693-57028242(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 GGTTGACT
SmilChr06G001725 Chr06 NC_080392.1:19898893-19898900promoter 内 1021-1028 bp - 2973 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 19894920-19895920(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACC
SmilChr03G000772 Chr03 NC_080389.1:8815456-8815463promoter 内 1014-1021 bp - 2980 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 8810690-8812476(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACC
SmilChr01G002387 Chr01 NC_080387.1:41114681-41114688promoter 内 1010-1017 bp + 2984 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 41111140-41111697(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 GGTTGACT
SmilChr07G003535 Chr07 NC_080393.1:40806244-40806251promoter 内 1008-1015 bp - 2986 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 40799001-40803258(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACC
SmilChr07G001517 Chr07 NC_080393.1:12123890-12123897promoter 内 1007-1014 bp + 2987 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 12126884-12132306(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACC
SmilChr05G002860 Chr05 NC_080391.1:34093085-34093092promoter 内 1006-1013 bp - 2988 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 34096080-34096197(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 GGTTGACT
SmilChr07G002784 Chr07 NC_080393.1:27757430-27757437promoter 内 1005-1012 bp + 2989 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 27753422-27754441(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 GGTTGACT
SmilChr03G002251 Chr03 NC_080389.1:35451239-35451246promoter 内 1003-1010 bp - 2991 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 35445037-35448248(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACC
SmilChr04G004097 Chr04 NC_080390.1:55955362-55955369promoter 内 1002-1009 bp + 2992 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 55951584-55952370(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 GGTTGACT
SmilChr05G002760 Chr05 NC_080391.1:31951845-31951852promoter 内 1001-1008 bp - 2993 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 31945610-31948852(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACC
SmilChr03G002389 Chr03 NC_080389.1:37821092-37821099promoter 内 1000-1007 bp - 2994 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 37824093-37830882(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 GGTTGACT
SmilChr05G000932 Chr05 NC_080391.1:7477617-7477624promoter 内 992-999 bp + 3002 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 7480626-7482724(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACC
SmilChr06G002689 Chr06 NC_080392.1:38819292-38819299promoter 内 992-999 bp + 3002 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 38814854-38816290(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 GGTTGACT
SmilChr01G002353 Chr01 NC_080387.1:40703941-40703948promoter 内 985-992 bp + 3009 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 40680169-40700932(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 GGTTGACT
SmilChr02G001480 Chr02 NC_080388.1:27686551-27686558promoter 内 985-992 bp - 3009 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 27683437-27683542(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACC
SmilChr03G000392 Chr03 NC_080389.1:4308663-4308670promoter 内 985-992 bp - 3009 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 4311679-4313040(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 GGTTGACT
SmilChr05G002045 Chr05 NC_080391.1:21281941-21281948promoter 内 981-988 bp + 3013 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 21284961-21285030(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACC
SmilChr04G000592 Chr04 NC_080390.1:6617700-6617707promoter 内 977-984 bp - 3017 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 6612261-6614683(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACC
SmilChr06G001679 Chr06 NC_080392.1:19067984-19067991promoter 内 977-984 bp - 3017 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 19063937-19064967(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACC
SmilChr07G003541 Chr07 NC_080393.1:40942227-40942234promoter 内 977-984 bp + 3017 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 40937871-40939210(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 GGTTGACT
SmilChr07G003299 Chr07 NC_080393.1:34861873-34861880promoter 内 973-980 bp - 3021 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 34864901-34865876(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 GGTTGACT
SmilChr03G001877 Chr03 NC_080389.1:26048502-26048509promoter 内 962-969 bp + 3032 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 26051541-26060128(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACC
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SmilChr07G002427 Chr07 NC_080393.1:22591690-22591697promoter 内 950-957 bp + 3044 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 22594741-22599568(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACC
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SmilChr02G001681 Chr02 NC_080388.1:31047710-31047717promoter 内 949-956 bp - 3045 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 31050762-31051106(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 GGTTGACT
SmilChr02G003534 Chr02 NC_080388.1:56491351-56491358promoter 内 949-956 bp - 3045 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 56484043-56488306(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACC
SmilChr01G002218 Chr01 NC_080387.1:38505321-38505328promoter 内 948-955 bp - 3046 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 38501470-38502275(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACC
SmilChr03G001388 Chr03 NC_080389.1:16424593-16424600promoter 内 948-955 bp - 3046 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 16427646-16428575(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 GGTTGACT