转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002803; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020702-RA_Salv SmilChr07G002803 NAC XP_057777238.1 MP00221 ACACGTAACTT

可能结合的靶基因

9903 个结合位点 7965 个候选靶基因 第 84 / 160 下载 TSV

上一页 84 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001483 Chr01 NC_080387.1:28604619-28604629promoter 内 1540-1550 bp + 2451 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 28601175-28602168(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GCCTTACGTGT
SmilChr02G002548 Chr02 NC_080388.1:44342280-44342290promoter 内 1520-1530 bp + 2471 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 44337856-44339809(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CTGTTACGTAT
SmilChr02G001957 Chr02 NC_080388.1:35311336-35311346promoter 内 1508-1518 bp + 2483 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 35305803-35308853(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GCGTTACGTCT
SmilChr05G002954 Chr05 NC_080391.1:35696931-35696941promoter 内 1507-1517 bp + 2484 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 35699425-35702715(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCACGTAAGTA
SmilChr04G000859 Chr04 NC_080390.1:10901233-10901243promoter 内 1492-1502 bp - 2499 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 10903742-10905247(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TACTTACGTGA
SmilChr03G000226 Chr03 NC_080389.1:2679957-2679967promoter 内 1491-1501 bp - 2500 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 2682467-2685145(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GAAATACGTGT
SmilChr05G001081 Chr05 NC_080391.1:8997638-8997648promoter 内 1460-1470 bp - 2531 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 8988963-8995107(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ATACGTAACAG
SmilChr03G003663 Chr03 NC_080389.1:55484705-55484715promoter 内 1458-1468 bp + 2533 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 55479717-55482172(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TATTTACGTGT
SmilChr01G003499 Chr01 NC_080387.1:53592888-53592898promoter 内 1455-1465 bp - 2536 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 53588664-53590352(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATTTC
SmilChr02G003085 Chr02 NC_080388.1:51751205-51751215promoter 内 1435-1445 bp - 2556 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 51753771-51754938(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CTGTTACGTAT
SmilChr02G000300 Chr02 NC_080388.1:3790224-3790234promoter 内 1417-1427 bp - 2574 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 3792808-3794739(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CTGTTACGTAT
SmilChr03G000224 Chr03 NC_080389.1:2623176-2623186promoter 内 1390-1400 bp - 2601 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 2625787-2628468(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CTCTTACGTGT
SmilChr03G003950 Chr03 NC_080389.1:58556853-58556863promoter 内 1372-1382 bp - 2619 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 58554149-58554234(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAAGAG
SmilChr05G003401 Chr05 NC_080391.1:45064379-45064389promoter 内 1338-1348 bp - 2653 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 45060505-45061726(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAAGAG
SmilChr02G002822 Chr02 NC_080388.1:48333857-48333867promoter 内 1333-1343 bp + 2658 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 48336525-48342033(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAAATA
SmilChr03G003438 Chr03 NC_080389.1:52732105-52732115promoter 内 1315-1325 bp + 2676 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 52734791-52736443(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCACGTAAGTA
SmilChr02G004112 Chr02 NC_080388.1:63411295-63411305promoter 内 1305-1315 bp - 2686 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 63413991-63416190(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GAAATACGTGT
SmilChr01G005180 Chr01 NC_080387.1:69520823-69520833promoter 内 1287-1297 bp + 2704 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 69523537-69526664(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAAGAG
SmilChr02G003074 Chr02 NC_080388.1:51640406-51640416promoter 内 1267-1277 bp + 2724 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 51643140-51644435(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAAGGC
SmilChr02G004081 Chr02 NC_080388.1:63089632-63089642promoter 内 1261-1271 bp - 2730 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 63092372-63096688(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CTCTTACGTGT
SmilChr02G000006 Chr02 NC_080388.1:53907-53917promoter 内 1222-1232 bp + 2769 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 56686-58534(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAAGAG
SmilChr05G003124 Chr05 NC_080391.1:39892533-39892543promoter 内 1205-1215 bp + 2786 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 39887523-39889747(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CTCTTACGTGT
SmilChr05G002773 Chr05 NC_080391.1:32269016-32269026promoter 内 1193-1203 bp + 2798 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 32271824-32274423(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAAGGC
SmilChr01G000180 Chr01 NC_080387.1:3045245-3045255promoter 内 1185-1195 bp - 2806 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 3040681-3042439(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAAGAG
SmilChr01G004154 Chr01 NC_080387.1:60056638-60056648promoter 内 1154-1164 bp + 2837 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 60059485-60062271(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAAGAG
SmilChr03G003924 Chr03 NC_080389.1:58327387-58327397promoter 内 1136-1146 bp + 2855 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 58320326-58324532(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TATTTACGTGT
SmilChr02G000430 Chr02 NC_080388.1:5507507-5507517promoter 内 1099-1109 bp + 2892 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 5510409-5511098(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAAGGC
SmilChr03G003973 Chr03 NC_080389.1:58754751-58754761promoter 内 1051-1061 bp - 2940 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 58757701-58763813(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TATTTACGTGT
SmilChr01G001233 Chr01 NC_080387.1:24759331-24759341promoter 内 1039-1049 bp - 2952 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 24762293-24763434(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CTCTTACGTGT
SmilChr02G004509 Chr02 NC_080388.1:67613784-67613794promoter 内 1027-1037 bp + 2964 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 67609877-67610820(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TACTTACGTGA
SmilChr02G001227 Chr02 NC_080388.1:22551685-22551695promoter 内 1026-1036 bp + 2965 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 22547755-22548720(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GTGTTACGTGA
SmilChr02G004559 Chr02 NC_080388.1:68108889-68108899promoter 内 991-1001 bp - 3000 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 68111899-68113130(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GAAATACGTGT
SmilChr02G005227 Chr02 NC_080388.1:73474360-73474370promoter 内 971-981 bp + 3020 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 73468206-73471340(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TATTTACGTGT
SmilChr04G000507 Chr04 NC_080390.1:5551088-5551098promoter 内 961-971 bp - 3030 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 5554128-5557577(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TAGTTACGTAA
SmilChr01G005232 Chr01 NC_080387.1:69900660-69900670promoter 内 951-961 bp + 3040 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 69903710-69910234(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATTTC
SmilChr01G005336 Chr01 NC_080387.1:70574749-70574759promoter 内 951-961 bp - 3040 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 70567561-70571709(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATTTC
SmilChr01G001280 Chr01 NC_080387.1:25588777-25588787promoter 内 947-957 bp - 3044 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 25591831-25593134(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GCCTTACGTGT
SmilChr02G003730 Chr02 NC_080388.1:58937960-58937970promoter 内 929-939 bp - 3062 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 58929601-58934898(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ATACGTAACAG
SmilChr01G003661 Chr01 NC_080387.1:55035724-55035734promoter 内 921-931 bp + 3070 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 55031026-55032654(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CTCTTACGTGT
SmilChr01G000350 Chr01 NC_080387.1:7296943-7296953promoter 内 913-923 bp + 3078 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 7300031-7302750(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GCACGTAACAA
SmilChr04G001208 Chr04 NC_080390.1:18711425-18711435promoter 内 891-901 bp - 3100 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 18714535-18721749(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CTCTTACGTGT
SmilChr02G002874 Chr02 NC_080388.1:49000054-49000064promoter 内 883-893 bp - 3108 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 48993750-48996946(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAAGAG
SmilChr01G000433 Chr01 NC_080387.1:8664760-8664770promoter 内 879-889 bp + 3112 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 8658607-8661648(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GCCTTACGTGT
SmilChr02G003086 Chr02 NC_080388.1:51751205-51751215promoter 内 877-887 bp - 3114 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 51754329-51754979(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CTGTTACGTAT
SmilChr03G000457 Chr03 NC_080389.1:4872679-4872689promoter 内 858-868 bp + 3133 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 4865793-4869546(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CTCTTACGTGT
SmilChr04G003763 Chr04 NC_080390.1:53875677-53875687promoter 内 811-821 bp - 3180 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 53878867-53882961(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CTCTTACGTGT
SmilChr02G001865 Chr02 NC_080388.1:33881069-33881079promoter 内 803-813 bp + 3188 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 33884267-33884842(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAAGAG
SmilChr04G001767 Chr04 NC_080390.1:29073640-29073650promoter 内 793-803 bp - 3198 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 29076848-29082118(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GCCTTACGTGT
SmilChr03G003285 Chr03 NC_080389.1:50903968-50903978promoter 内 782-792 bp + 3209 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 50899609-50900759(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TATTTACGTGT
SmilChr01G003641 Chr01 NC_080387.1:54911741-54911751promoter 内 766-776 bp + 3225 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 54914976-54919283(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAAATA