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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G000478; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001018-RA_Salv SmilChr08G000478 GATA XP_057781809.1 MP00130 AGATCTAGATCTGAA

可能结合的靶基因

9821 个结合位点 6015 个候选靶基因 第 86 / 121 下载 TSV

上一页 86 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001675 Chr01 NC_080387.1:30901317-30901331promoter 内 2479-2493 bp - 1508 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 30902839-30904718(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATTTAAATTC
SmilChr01G004603 Chr01 NC_080387.1:64020266-64020280promoter 内 2438-2452 bp + 1549 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 64016144-64018717(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTGAGATCTATTCCT
SmilChr03G001192 Chr03 NC_080389.1:13726788-13726802promoter 内 2396-2410 bp - 1591 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 13723941-13725197(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AAGTCTAAATCTGAA
SmilChr01G003335 Chr01 NC_080387.1:52093488-52093502promoter 内 2395-2409 bp + 1592 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 52095094-52101508(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GGGTCTAGATCCATG
SmilChr05G001309 Chr05 NC_080391.1:11292177-11292191promoter 内 2312-2326 bp + 1675 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 11293866-11294391(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AACTAGAGATCTGAG
SmilChr04G002842 Chr04 NC_080390.1:44561264-44561278promoter 内 2248-2262 bp + 1739 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 44557741-44559525(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTCAGATCTATCTAC
SmilChr01G003316 Chr01 NC_080387.1:51886305-51886319promoter 内 2237-2251 bp - 1750 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 51880672-51884555(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TCCTATAGATCTGAA
SmilChr01G004645 Chr01 NC_080387.1:64507086-64507100promoter 内 2033-2047 bp - 1954 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 64509054-64510628(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATTGGATCTAGTTTT
SmilChr03G001759 Chr03 NC_080389.1:23947410-23947424promoter 内 2006-2020 bp + 1981 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 23944449-23945429(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTCAGATCCAAAGGA
SmilChr03G001064 Chr03 NC_080389.1:12359898-12359912promoter 内 1997-2011 bp + 1990 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 12356058-12357908(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CATAGATCTAGTTAT
SmilChr03G002390 Chr03 NC_080389.1:37839907-37839921promoter 内 1958-1972 bp + 2029 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 37841950-37849352(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TAATATAGATCTAAA
SmilChr03G000071 Chr03 NC_080389.1:867942-867956promoter 内 1918-1932 bp - 2069 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 870025-871029(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCTCTCTCT
SmilChr02G005081 Chr02 NC_080388.1:72436401-72436415promoter 内 1855-1869 bp - 2132 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 72432735-72434269(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGGGCTCGATCTGAG
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SmilChr02G001611 Chr02 NC_080388.1:29978064-29978078promoter 内 1806-1820 bp + 2181 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 29980259-29983080(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACCTATGGATCTGAC
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SmilChr04G003120 Chr04 NC_080390.1:47769969-47769983promoter 内 1531-1545 bp + 2456 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 47759909-47767513(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCGGAATCA
SmilChr02G005418 Chr02 NC_080388.1:74642643-74642657promoter 内 1493-1507 bp + 2494 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 74637606-74640149(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TATAGATCTAAACCT
SmilChr01G003761 Chr01 NC_080387.1:56001995-56002009promoter 内 1491-1505 bp - 2496 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 56004505-56010545(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CCTAGATCTACTTCG
SmilChr02G001924 Chr02 NC_080388.1:34647591-34647605promoter 内 1458-1472 bp - 2529 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 34650134-34653116(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GCGAGATCTAGCTCG
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SmilChr01G005616 Chr01 NC_080387.1:72675594-72675608promoter 内 1428-1442 bp + 2559 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 72672952-72673035(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTGGGATCTAGTTTT
SmilChr03G002627 Chr03 NC_080389.1:41683955-41683969promoter 内 1268-1282 bp - 2719 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 41679789-41681236(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATAACTAGATCTATG
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SmilChr03G001056 Chr03 NC_080389.1:12287784-12287798promoter 内 1250-1264 bp + 2737 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 12282066-12285047(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTGAGATCTATTTTT
SmilChr02G003303 Chr02 NC_080388.1:54306420-54306434promoter 内 1188-1202 bp - 2799 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 54300201-54303621(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGAGAGAGATCTGAA
SmilChr04G002843 Chr04 NC_080390.1:44561264-44561278promoter 内 1154-1168 bp + 2833 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 44564111-44564994(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTAGATAGATCTGAC
SmilChr03G002668 Chr03 NC_080389.1:42364404-42364418promoter 内 1148-1162 bp - 2839 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 42367257-42368166(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GCGAGATCTAGTTTA
SmilChr02G001783 Chr02 NC_080388.1:32606233-32606247promoter 内 1139-1153 bp + 2848 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 32609095-32611523(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TGAGGTAGATCTAAG
SmilChr02G004951 Chr02 NC_080388.1:71466890-71466904promoter 内 1091-1105 bp + 2896 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 71469800-71473160(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACCATTAGATCTAAG
SmilChr02G004056 Chr02 NC_080388.1:62874952-62874966promoter 内 1073-1087 bp - 2914 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 62877880-62878834(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATTGGATCTAGTTTT
SmilChr04G003669 Chr04 NC_080390.1:53134326-53134340promoter 内 1068-1082 bp + 2919 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 53130248-53131407(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATTTAAATTC
SmilChr01G005822 Chr01 NC_080387.1:74224198-74224212promoter 内 1016-1030 bp - 2971 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 74227183-74229632(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCTCTCTCT
SmilChr04G000179 Chr04 NC_080390.1:1611748-1611762promoter 内 981-995 bp + 3006 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 1589284-1608742(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CACAGATCTAGGTGG
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SmilChr01G005232 Chr01 NC_080387.1:69900452-69900466promoter 内 743-757 bp + 3244 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 69903710-69910234(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CCATCTAGATCTACA
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SmilChr03G004517 Chr03 NC_080389.1:63207550-63207564promoter 内 668-682 bp + 3319 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 63210883-63215270(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATAATTAGATCTGTT
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SmilChr01G005143 Chr01 NC_080387.1:69220351-69220365promoter 内 650-664 bp - 3337 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 69223702-69225549(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTTGGATCTAGACCA
SmilChr05G001043 Chr05 NC_080391.1:8533496-8533510promoter 内 628-642 bp + 3359 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 8536869-8538069(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACCATTAGATCTAAG
SmilChr03G003491 Chr03 NC_080389.1:53473892-53473906promoter 内 581-595 bp - 3406 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 53477312-53480377(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATTTAGATAT
SmilChr03G004294 Chr03 NC_080389.1:61343685-61343699promoter 内 573-587 bp + 3414 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 61347113-61350884(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GAAATTAGATCTTAA
SmilChr01G000503 Chr01 NC_080387.1:10202455-10202469promoter 内 566-580 bp - 3421 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 10205890-10206875(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCCATTGGC
SmilChr01G002488 Chr01 NC_080387.1:42610951-42610965promoter 内 547-561 bp + 3440 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 42602545-42607511(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CATGGATCTAGACCC
SmilChr02G002138 Chr02 NC_080388.1:38474240-38474254promoter 内 485-499 bp + 3502 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 38477756-38480250(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGAGAGAGATCTGAA
SmilChr03G002512 Chr03 NC_080389.1:39990662-39990676promoter 内 470-484 bp + 3517 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 39982391-39987145(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATAAGATCTAGCTGC