转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 89 / 143 下载 TSV

上一页 89 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G002884 Chr05 NC_080391.1:34548490-34548501promoter 内 3081-3092 bp + 909 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 34549410-34550411(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTCAC
SmilChr05G002885 Chr05 NC_080391.1:34558214-34558225promoter 内 3081-3092 bp + 909 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 34559134-34560135(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTCAC
SmilChr01G003910 Chr01 NC_080387.1:57373898-57373909promoter 内 3038-3049 bp + 952 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 57374861-57380289(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTGTG
SmilChr06G000677 Chr06 NC_080392.1:5984639-5984650promoter 内 2971-2982 bp + 1019 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 5985669-5986220(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATACAGCTGTG
SmilChr07G004690 Chr07 NC_080393.1:59829439-59829450promoter 内 2962-2973 bp - 1028 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 59830478-59831552(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCTC
SmilChr08G002074 Chr08 NC_080394.1:18646834-18646845promoter 内 2959-2970 bp + 1031 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 18643255-18645803(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCTC
SmilChr08G003337 Chr08 NC_080394.1:34668646-34668657promoter 内 2909-2920 bp + 1081 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 34669738-34672777(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTACAGCTGAT
SmilChr02G004230 Chr02 NC_080388.1:64497418-64497429promoter 内 2805-2816 bp + 1185 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 64498614-64500758(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCAA
SmilChr05G003366 Chr05 NC_080391.1:44493724-44493735promoter 内 2801-2812 bp + 1189 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 44491102-44492535(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCGT
SmilChr06G002117 Chr06 NC_080392.1:28310746-28310757promoter 内 2770-2781 bp - 1220 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 28311977-28319309(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTGCAT
SmilChr02G002460 Chr02 NC_080388.1:42885183-42885194promoter 内 2740-2751 bp - 1250 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 42886444-42889510(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAGT
SmilChr08G002355 Chr08 NC_080394.1:22287468-22287479promoter 内 2670-2681 bp - 1320 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 22274477-22286148(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCAA
SmilChr01G001995 Chr01 NC_080387.1:35361123-35361134promoter 内 2643-2654 bp + 1347 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 35362481-35367022(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTACAGCTGAT
SmilChr07G000728 Chr07 NC_080393.1:5068303-5068314promoter 内 2642-2653 bp + 1348 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 5063637-5066955(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCCG
SmilChr01G003908 Chr01 NC_080387.1:57373898-57373909promoter 内 2587-2598 bp + 1403 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 57360400-57372495(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACACCTGTCAA
SmilChr08G000450 Chr08 NC_080394.1:3197597-3197608promoter 内 2582-2593 bp + 1408 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 3195275-3196189(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCTC
SmilChr06G000214 Chr06 NC_080392.1:1429729-1429740promoter 内 2575-2586 bp + 1415 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 1431155-1434387(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCAA
SmilChr03G002704 Chr03 NC_080389.1:42984328-42984339promoter 内 2511-2522 bp + 1479 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 42985818-42986925(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATACAGCTGTG
SmilChr01G004703 Chr01 NC_080387.1:65139556-65139567promoter 内 2470-2481 bp + 1520 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 65141087-65142196(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTATG
SmilChr07G002501 Chr07 NC_080393.1:23733453-23733464promoter 内 2464-2475 bp + 1526 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 23727995-23731927(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAGT
SmilChr03G004134 Chr03 NC_080389.1:60178619-60178630promoter 内 2459-2470 bp + 1531 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 60180161-60183575(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCAA
SmilChr03G001791 Chr03 NC_080389.1:24445741-24445752promoter 内 2383-2394 bp - 1607 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 24447359-24450249(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTACC
SmilChr08G000451 Chr08 NC_080394.1:3197597-3197608promoter 内 2336-2347 bp + 1654 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 3199262-3210701(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCAA
SmilChr01G004729 Chr01 NC_080387.1:65465900-65465911promoter 内 2275-2286 bp + 1715 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 65461649-65464185(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACACCTGTCAA
SmilChr08G003050 Chr08 NC_080394.1:30678014-30678025promoter 内 2271-2282 bp - 1719 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 30674031-30676295(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTAGT
SmilChr06G003267 Chr06 NC_080392.1:45302184-45302195promoter 内 2243-2254 bp - 1747 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 45297471-45300437(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTACAGCTGAA
SmilChr05G003440 Chr05 NC_080391.1:45733434-45733445promoter 内 2225-2236 bp - 1765 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 45735210-45738348(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAGT
SmilChr02G005567 Chr02 NC_080388.1:75578757-75578768promoter 内 2205-2216 bp - 1785 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 75580553-75583002(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCTC
SmilChr03G002032 Chr03 NC_080389.1:30465131-30465142promoter 内 2117-2128 bp - 1873 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 30459959-30463258(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGTG
SmilChr03G000376 Chr03 NC_080389.1:4201395-4201406promoter 内 2115-2126 bp + 1875 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 4203281-4204678(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCAA
SmilChr03G001711 Chr03 NC_080389.1:22895465-22895476promoter 内 2087-2098 bp - 1903 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 22897379-22900731(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCGC
SmilChr07G000724 Chr07 NC_080393.1:5041163-5041174promoter 内 2069-2080 bp - 1921 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 5037956-5039242(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTACAGCTGAA
SmilChr07G004155 Chr07 NC_080393.1:53401321-53401332promoter 内 1988-1999 bp + 2002 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 53398052-53399319(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCGT
SmilChr07G000634 Chr07 NC_080393.1:4284168-4284179promoter 内 1936-1947 bp - 2054 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 4279586-4282114(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATACAGCTGGG
SmilChr05G001076 Chr05 NC_080391.1:8953684-8953695promoter 内 1757-1768 bp - 2233 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 8950843-8951451(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGCAAGCTGTA
SmilChr03G003278 Chr03 NC_080389.1:50779166-50779177promoter 内 1742-1753 bp + 2248 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 50776229-50776918(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACACCTGTCAA
SmilChr05G000567 Chr05 NC_080391.1:4263738-4263749promoter 内 1742-1753 bp - 2248 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 4257504-4261490(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTGGG
SmilChr01G001177 Chr01 NC_080387.1:23822538-23822549promoter 内 1723-1734 bp + 2267 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 23824816-23825470(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCAA
SmilChr02G004566 Chr02 NC_080388.1:68180856-68180867promoter 内 1631-1642 bp - 2359 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 68183226-68185283(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCCC
SmilChr07G001095 Chr07 NC_080393.1:8070259-8070270promoter 内 1564-1575 bp - 2426 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 8062475-8067833(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCAA
SmilChr07G002511 Chr07 NC_080393.1:23803399-23803410promoter 内 1563-1574 bp + 2427 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 23805837-23805908(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTAAT
SmilChr01G001626 Chr01 NC_080387.1:30337598-30337609promoter 内 1544-1555 bp - 2446 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 30334013-30335152(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTAGG
SmilChr01G004730 Chr01 NC_080387.1:65465900-65465911promoter 内 1544-1555 bp + 2446 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 65468357-65469247(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTGTG
SmilChr07G000393 Chr07 NC_080393.1:2652288-2652299promoter 内 1445-1456 bp - 2545 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 2648052-2649743(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTATA
SmilChr07G004628 Chr07 NC_080393.1:59129717-59129728promoter 内 1444-1455 bp + 2546 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 59121469-59127171(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCTT
SmilChr08G002644 Chr08 NC_080394.1:25914709-25914720promoter 内 1440-1451 bp - 2550 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 25917270-25918804(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTAAG
SmilChr05G001269 Chr05 NC_080391.1:10833601-10833612promoter 内 1430-1441 bp - 2560 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 10836172-10840484(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTACC
SmilChr01G003851 Chr01 NC_080387.1:56795859-56795870promoter 内 1412-1423 bp - 2578 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 56798448-56799858(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGAGCTGTCTG
SmilChr05G004292 Chr05 NC_080391.1:56679250-56679261promoter 内 1398-1409 bp - 2592 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 56674063-56676658(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATACAGCTGGG
SmilChr06G000270 Chr06 NC_080392.1:1832697-1832708promoter 内 1378-1389 bp - 2612 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 1825123-1830085(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTACAGCTGAT