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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001111; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023725-RA_Salv SmilChr06G001111 MYB XP_057768512.1 MP00388 AAAGTTAGGTATAA

可能结合的靶基因

9774 个结合位点 6870 个候选靶基因 第 94 / 138 下载 TSV

上一页 94 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001094 Chr03 NC_080389.1:12642187-12642200promoter 内 1167-1180 bp + 2821 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 12638388-12639366(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TCATACCTACATTA
SmilChr01G005583 Chr01 NC_080387.1:72531210-72531223promoter 内 1164-1177 bp - 2824 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 72527807-72528386(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CGAGTTAGGCCTAA
SmilChr01G001572 Chr01 NC_080387.1:29762098-29762111promoter 内 1032-1045 bp - 2956 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 29765067-29765138(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GAATACCTAATTTC
SmilChr01G002813 Chr01 NC_080387.1:46687868-46687881promoter 内 1023-1036 bp - 2965 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 46680753-46684903(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ATAAGTAGGTATTA
SmilChr02G002967 Chr02 NC_080388.1:50192563-50192576promoter 内 928-941 bp + 3060 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 50182192-50189503(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTAGGCCTAACTAG
SmilChr02G004739 Chr02 NC_080388.1:69589501-69589514promoter 内 813-826 bp - 3175 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 69592689-69597641(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GTATACCTACTTGC
SmilChr01G005761 Chr01 NC_080387.1:73710817-73710830promoter 内 692-705 bp - 3296 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 73714126-73716841(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CAATGCCTAACTGT
SmilChr02G000276 Chr02 NC_080388.1:3534688-3534701promoter 内 692-705 bp + 3296 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 3529212-3531392(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GATTACCTAATTTA
SmilChr01G003551 Chr01 NC_080387.1:54140715-54140728promoter 内 607-620 bp - 3381 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 54144109-54163838(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTGTACCTAAAATA
SmilChr02G003607 Chr02 NC_080388.1:57317056-57317069promoter 内 574-587 bp + 3414 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 57311917-57313642(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GAGTACCTAATATA
SmilChr02G002032 Chr02 NC_080388.1:36617361-36617374promoter 内 572-585 bp + 3416 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 36620790-36622199(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CGTGGTAGGTATTT
SmilChr02G000026 Chr02 NC_080388.1:282427-282440promoter 内 427-440 bp - 3561 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 286001-288799(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTATACCTACATTT
SmilChr02G004034 Chr02 NC_080388.1:62636771-62636784promoter 内 401-414 bp - 3587 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 62630314-62633184(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GGGGTTAGGTCGTT
SmilChr01G003381 Chr01 NC_080387.1:52510264-52510277promoter 内 386-399 bp + 3602 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 52505069-52506662(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTATACCTAATCGG
SmilChr01G001630 Chr01 NC_080387.1:30362994-30363007promoter 内 374-387 bp + 3614 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 30366621-30368468(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TCAGTTAGGCTTGA
SmilChr02G001083 Chr02 NC_080388.1:19382512-19382525promoter 内 310-323 bp - 3678 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 19386203-19392105(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTAAACCTAACGTG
SmilChr02G002001 Chr02 NC_080388.1:36160200-36160213promoter 内 170-183 bp - 3818 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 36164031-36167642(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTCTACCTAAATAT
SmilChr02G000022 Chr02 NC_080388.1:188189-188202promoter 内 93-106 bp - 3895 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 183631-184294(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTAATTAGGTAATA
SmilChr03G001061 Chr03 NC_080389.1:12301673-12301686promoter 内 62-75 bp - 3926 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 12305612-12307042(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CATTACCTAATCTC
SmilChr01G001125 Chr01 NC_080387.1:22852350-22852363promoter 内 38-51 bp - 3950 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 22856313-22858491(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTATACCTAATGTT
SmilChr01G000691 Chr01 NC_080387.1:15479861-15479874promoter 内 6-19 bp + 3982 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 15472186-15475879(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CGGGACCTAACGAA
SmilChr02G005356 Chr02 NC_080388.1:74300194-74300207promoter 内 3374-3387 bp + 614 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 4 74297560-74299580(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TGTTACCTAATCCC
SmilChr01G002844 Chr01 NC_080387.1:47013847-47013860promoter 内 3671-3684 bp - 317 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 3 47012250-47013530(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CAAATTAGGTAATA
SmilChr02G005358 Chr02 NC_080388.1:74300194-74300207promoter 内 899-912 bp + 3089 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 3 74303296-74303367(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GGGATTAGGTAACA
SmilChr02G004621 Chr02 NC_080388.1:68734784-68734797promoter 内 3969-3982 bp + 19 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 68732778-68734765(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTATACCAACCAAC
SmilChr02G004232 Chr02 NC_080388.1:64507006-64507019promoter 内 3967-3980 bp + 21 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 64507040-64508217(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTTATTAGGTACTA
SmilChr01G004112 Chr01 NC_080387.1:59636475-59636488promoter 内 3471-3484 bp - 517 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 59633189-59635958(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AAGTTTAGGTATAA
SmilChr01G001165 Chr01 NC_080387.1:23672171-23672184promoter 内 2624-2637 bp + 1364 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 23673548-23687383(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AAGTTTAGGTATAA
SmilChr02G004641 Chr02 NC_080388.1:68858604-68858617promoter 内 1925-1938 bp - 2063 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 68860680-68866969(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GCATACCTACTCGA
SmilChr02G001680 Chr02 NC_080388.1:31028234-31028247promoter 内 1790-1803 bp - 2198 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 31023295-31026036(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TATATTAGGTAATG
SmilChr03G000477 Chr03 NC_080389.1:5080277-5080290promoter 内 1672-1685 bp + 2316 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 5064634-5077961(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CAAGGCCTAACTTT
SmilChr03G000105 Chr03 NC_080389.1:1169550-1169563promoter 内 1493-1506 bp - 2495 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 1172058-1175844(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CAAAACCTAACTGG
SmilChr02G004622 Chr02 NC_080388.1:68734784-68734797promoter 内 1376-1389 bp + 2612 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 68737409-68737482(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GTTGGTTGGTATAA
SmilChr01G004544 Chr01 NC_080387.1:63587338-63587351promoter 内 1266-1279 bp + 2722 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 63590073-63593410(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TATATTAGGTATTA
SmilChr03G001385 Chr03 NC_080389.1:16370477-16370490promoter 内 1184-1197 bp + 2804 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 16373294-16374594(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTTAGTAGGTATAT
SmilChr01G002533 Chr01 NC_080387.1:43327829-43327842promoter 内 1027-1040 bp + 2961 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 43330803-43332358(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AAAAGTAGGTATTT
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SmilChr02G004969 Chr02 NC_080388.1:71596900-71596913promoter 内 908-921 bp + 3080 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 71591669-71593820(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AAACACCTAACAAT
SmilChr02G005391 Chr02 NC_080388.1:74526639-74526652promoter 内 819-832 bp + 3169 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 74529821-74531940(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GATGTTAGGTTATC
SmilChr02G002917 Chr02 NC_080388.1:49472546-49472559promoter 内 648-661 bp + 3340 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 49475899-49478067(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CAAATTAGGTAATA
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SmilChr01G001570 Chr01 NC_080387.1:29719823-29719836promoter 内 281-294 bp + 3707 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 29715007-29716116(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TGCAGCCTAACTTC
SmilChr01G005898 Chr01 NC_080387.1:74887116-74887129promoter 内 3933-3946 bp - 55 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 74887184-74896636(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTATACCAAATTTT
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SmilChr01G005301 Chr01 NC_080387.1:70298269-70298282promoter 内 3904-3917 bp - 84 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 70298366-70299252(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CCCTACCTAAACTC
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SmilChr03G000507 Chr03 NC_080389.1:5469910-5469923promoter 内 3327-3340 bp - 661 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 5470584-5477430(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TGATACCTAATAAA