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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G002277; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003292-RA_Salv SmilChr05G002277 ERF XP_057809665.1 MP00452 TCTTTGCCGACATCA

可能结合的靶基因

7783 个结合位点 6671 个候选靶基因 第 95 / 134 下载 TSV

上一页 95 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000536 Chr03 NC_080389.1:5777081-5777095promoter 内 997-1011 bp - 2990 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 5780085-5827863(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ATTTGTCGGCCACTG
SmilChr08G004842 Chr08 NC_080394.1:57691512-57691526promoter 内 989-1003 bp + 2998 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 57685720-57688514(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GTTTGTCGGCCATAG
SmilChr01G002347 Chr01 NC_080387.1:40618004-40618018promoter 内 953-967 bp + 3034 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 40608642-40614970(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CTATGTCGGTTATCT
SmilChr02G003956 Chr02 NC_080388.1:61732901-61732915promoter 内 918-932 bp - 3069 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 61735984-61739536(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GCTTGTCGGCACAAG
SmilChr06G000734 Chr06 NC_080392.1:6783888-6783902promoter 内 894-908 bp - 3093 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 6779082-6780795(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CTTGTGCCGACAAGC
SmilChr07G004152 Chr07 NC_080393.1:53376603-53376617promoter 内 891-905 bp - 3096 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 53379713-53382957(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCGTGTCGGCACAAA
SmilChr06G000596 Chr06 NC_080392.1:5126199-5126213promoter 内 873-887 bp + 3114 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 5129327-5130298(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GGAGTACCGACATGT
SmilChr08G004879 Chr08 NC_080394.1:57903013-57903027promoter 内 863-877 bp + 3124 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 57897608-57899889(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GTTTGTCGGCCATAG
SmilChr06G000067 Chr06 NC_080392.1:536566-536580promoter 内 842-856 bp - 3145 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 531326-533421(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GAGATGCCGACGTAG
SmilChr06G000750 Chr06 NC_080392.1:6969383-6969397promoter 内 840-854 bp - 3147 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 6962441-6966236(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GTTCAGCCGACATTC
SmilChr08G004844 Chr08 NC_080394.1:57691512-57691526promoter 内 812-826 bp + 3175 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 57694701-57695144(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CTATGGCCGACAAAC
SmilChr08G004881 Chr08 NC_080394.1:57903013-57903027promoter 内 798-812 bp + 3189 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 57906216-57906659(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CTATGGCCGACAAAC
SmilChr05G000519 Chr05 NC_080391.1:3998892-3998906promoter 内 767-781 bp + 3220 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 3994482-3995672(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CCGGGTCGGCAAGGT
SmilChr01G005033 Chr01 NC_080387.1:68289325-68289339promoter 内 762-776 bp - 3225 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 68283988-68286100(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ACTATGCCGACACAC
SmilChr03G000524 Chr03 NC_080389.1:5619145-5619159promoter 内 750-764 bp - 3237 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 5622396-5628473(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ATTTGTCGGCCACTG
SmilChr03G001003 Chr03 NC_080389.1:11345460-11345474promoter 内 720-734 bp - 3267 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 11348741-11353651(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ATTTGTCGGCCACTG
SmilChr06G001256 Chr06 NC_080392.1:13071244-13071258promoter 内 678-692 bp - 3309 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 13067243-13067935(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AGCACGCCGACACTG
SmilChr07G003713 Chr07 NC_080393.1:44876743-44876757promoter 内 673-687 bp - 3314 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 44872746-44873429(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GAGGAGCCGACATCT
SmilChr06G000056 Chr06 NC_080392.1:443814-443828promoter 内 644-658 bp - 3343 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 447171-452585(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGATGTCGGTTTTGT
SmilChr03G002097 Chr03 NC_080389.1:32417633-32417647promoter 内 602-616 bp - 3385 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 32421032-32421138(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AGATGTCGGCTCCTC
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SmilChr05G000521 Chr05 NC_080391.1:3994712-3994726promoter 内 551-565 bp - 3436 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 3998162-3999067(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CCGGGTCGGCAAGGT
SmilChr02G004139 Chr02 NC_080388.1:63672788-63672802promoter 内 522-536 bp + 3465 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 63668533-63669323(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGCTGTCGGCAGAGT
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SmilChr08G003622 Chr08 NC_080394.1:39401359-39401373promoter 内 417-431 bp + 3570 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 39404943-39407804(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGCCGGCCGACAATG
SmilChr06G002171 Chr06 NC_080392.1:29919413-29919427promoter 内 408-422 bp - 3579 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 29923006-29924409(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGATGTCGGTTTATG
SmilChr06G000153 Chr06 NC_080392.1:1079317-1079331promoter 内 398-412 bp - 3589 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 1070958-1075728(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ATTAAACCGACATCG
SmilChr05G000517 Chr05 NC_080391.1:3994712-3994726promoter 内 341-355 bp - 3646 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 3989011-3991066(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ACCTTGCCGACCCGG
SmilChr07G000954 Chr07 NC_080393.1:6854938-6854952promoter 内 275-289 bp - 3712 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 6846323-6851226(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTGTGGCCGACAAAC
SmilChr08G002763 Chr08 NC_080394.1:27262753-27262767promoter 内 250-264 bp - 3737 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 27266504-27267419(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCGTGTCGGCACAAA
SmilChr05G001062 Chr05 NC_080391.1:8779264-8779278promoter 内 239-253 bp + 3748 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 8783026-8794472(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CTCACGCCGACAGCG
SmilChr02G003382 Chr02 NC_080388.1:54937954-54937968promoter 内 225-239 bp + 3762 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 54934086-54934192(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AGATGTCGGCTCCTC
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SmilChr03G001883 Chr03 NC_080389.1:26223195-26223209promoter 内 152-166 bp + 3835 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 26219255-26219360(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AGATGTCGGCTCCTC
SmilChr05G001958 Chr05 NC_080391.1:20056949-20056963promoter 内 152-166 bp + 3835 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 20053009-20053114(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AGATGTCGGCTCCTC
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SmilChr02G001448 Chr02 NC_080388.1:27158214-27158228promoter 内 117-131 bp + 3870 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 27154238-27154344(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AGATGTCGGCTCCTC
SmilChr07G003268 Chr07 NC_080393.1:34445329-34445343promoter 内 70-84 bp - 3917 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 34440662-34441412(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CATAAACCGACATCA
SmilChr05G003081 Chr05 NC_080391.1:38941380-38941394promoter 内 29-43 bp - 3958 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 38945352-38945457(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AGATGTCGGCTCCTC
SmilChr05G001677 Chr05 NC_080391.1:15884732-15884746promoter 内 3893-3907 bp + 94 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 15884840-15886910(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ATAATGCCGACGTGG
SmilChr05G001684 Chr05 NC_080391.1:15985965-15985979promoter 内 3793-3807 bp - 194 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 15986173-15987351(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGCTGTCGGCCAGGA
SmilChr05G001112 Chr05 NC_080391.1:9280694-9280708promoter 内 3448-3462 bp + 539 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 9279787-9280155(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TAATGTCGGTATCCA
SmilChr06G001994 Chr06 NC_080392.1:25354912-25354926promoter 内 3248-3262 bp - 739 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 25355665-25356790(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGCTGTCGGCCAGGA