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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001269; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00019281-RA_Salv SmilChr05G001269 G2-like XP_057765199.1 MP00252 AAAAGAATATTCC

可能结合的靶基因

9780 个结合位点 6478 个候选靶基因 第 98 / 130 下载 TSV

上一页 98 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004072 Chr02 NC_080388.1:63010239-63010251promoter 内 921-933 bp - 3068 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 63005876-63007171(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTGAGAATATTTG
SmilChr02G000382 Chr02 NC_080388.1:4787035-4787047promoter 内 910-922 bp + 3079 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 4780702-4783956(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AATATATTCTTTT
SmilChr02G004746 Chr02 NC_080388.1:69675567-69675579promoter 内 908-920 bp - 3081 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 69666491-69672486(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAGAGAATATTGC
SmilChr02G003859 Chr02 NC_080388.1:60397151-60397163promoter 内 903-915 bp - 3086 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 60390848-60394065(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TTAGGAATATTTT
SmilChr01G001099 Chr01 NC_080387.1:22499855-22499867promoter 内 872-884 bp + 3117 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 22496616-22496738(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTAATATTCCACC
SmilChr01G003504 Chr01 NC_080387.1:53622836-53622848promoter 内 857-869 bp + 3132 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 53617154-53619704(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTAATATTCCACC
SmilChr03G001551 Chr03 NC_080389.1:19537345-19537357promoter 内 818-830 bp + 3171 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 19540528-19540599(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGCAGAATATATC
SmilChr01G000405 Chr01 NC_080387.1:8243394-8243406promoter 内 715-727 bp - 3274 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 8237862-8240120(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAGAGAATATCCA
SmilChr02G001367 Chr02 NC_080388.1:25763937-25763949promoter 内 635-647 bp - 3354 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 25759521-25760583(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAAGAATATATT
SmilChr01G000371 Chr01 NC_080387.1:7670113-7670125promoter 内 628-640 bp - 3361 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 7664912-7666752(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAGAGAATATCCA
SmilChr03G002127 Chr03 NC_080389.1:33129815-33129827promoter 内 607-619 bp - 3382 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 33123457-33126433(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTGAGAATATTTG
SmilChr02G000415 Chr02 NC_080388.1:5299112-5299124promoter 内 603-615 bp + 3386 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 5294334-5295726(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CGATTATTCTTTT
SmilChr01G000263 Chr01 NC_080387.1:5064205-5064217promoter 内 559-571 bp - 3430 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 5059402-5060775(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAGAGAATATGCA
SmilChr02G002515 Chr02 NC_080388.1:43656040-43656052promoter 内 531-543 bp + 3458 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 43650178-43652582(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTAATATTCCATA
SmilChr03G002071 Chr03 NC_080389.1:31602571-31602583promoter 内 482-494 bp + 3507 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 31606090-31607582(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAGAGAATATCCA
SmilChr02G000891 Chr02 NC_080388.1:15331441-15331453promoter 内 444-456 bp - 3545 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 15334998-15339992(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCCATG
SmilChr03G002137 Chr03 NC_080389.1:33282518-33282530promoter 内 435-447 bp - 3554 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 33276009-33278964(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAGAGAATATCCA
SmilChr01G005197 Chr01 NC_080387.1:69657071-69657083promoter 内 422-434 bp + 3567 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 69652794-69653504(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCCATG
SmilChr01G000978 Chr01 NC_080387.1:20684145-20684157promoter 内 418-430 bp - 3571 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 20678587-20680574(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AATGGAATATTGG
SmilChr02G002421 Chr02 NC_080388.1:42179368-42179380promoter 内 377-389 bp - 3612 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 42182992-42187865(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTAATATTCGTCA
SmilChr02G004735 Chr02 NC_080388.1:69575367-69575379promoter 内 358-370 bp + 3631 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 69579010-69580653(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CTGGGAATATTAC
SmilChr02G002875 Chr02 NC_080388.1:48991384-48991396promoter 内 353-365 bp + 3636 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 48995032-48996916(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TTTGGAATATTTC
SmilChr01G006102 Chr01 NC_080387.1:76527624-76527636promoter 内 220-232 bp - 3769 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 76521564-76523855(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAGAGAATATGCA
SmilChr02G000857 Chr02 NC_080388.1:14642350-14642362promoter 内 183-195 bp - 3806 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 14637642-14638544(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAAGAATATATT
SmilChr03G000994 Chr03 NC_080389.1:11311585-11311597promoter 内 128-140 bp - 3861 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 11306232-11307724(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAGAGAATATGCA
SmilChr01G000772 Chr01 NC_080387.1:16849897-16849909promoter 内 86-98 bp + 3903 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 16853812-16854899(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGGAGAATATTAG
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SmilChr01G005729 Chr01 NC_080387.1:73429746-73429758promoter 内 1244-1256 bp + 2745 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 4 73432503-73439654(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GATAGAATATTTT
SmilChr02G002381 Chr02 NC_080388.1:41717578-41717590promoter 内 3234-3246 bp - 755 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 3 41718345-41719333(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATAATATTCCCAT
SmilChr01G005010 Chr01 NC_080387.1:68121885-68121897promoter 内 3191-3203 bp + 798 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 3 68122695-68125175(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TATGGAATATTTT
SmilChr02G003358 Chr02 NC_080388.1:54735607-54735619promoter 内 3966-3978 bp - 23 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 54733669-54735584(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TATGGAATATTTT
SmilChr01G002417 Chr01 NC_080387.1:41585447-41585459promoter 内 3700-3712 bp - 289 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 41561379-41585158(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAGAGAATATATG
SmilChr01G003756 Chr01 NC_080387.1:55960765-55960777promoter 内 3480-3492 bp - 509 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 55961286-55993711(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCGTCG
SmilChr01G001675 Chr01 NC_080387.1:30902205-30902217promoter 内 3367-3379 bp - 622 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 30902839-30904718(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CTAATATTCTTAT
SmilChr01G005344 Chr01 NC_080387.1:70659295-70659307promoter 内 2952-2964 bp - 1037 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 70660344-70661647(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CTAATATTCGTAT
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SmilChr01G005970 Chr01 NC_080387.1:75393445-75393457promoter 内 2150-2162 bp - 1839 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 75382424-75391606(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GATAGAATATTTT
SmilChr02G003360 Chr02 NC_080388.1:54735607-54735619promoter 内 1457-1469 bp - 2532 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 54738151-54742587(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCCATA
SmilChr02G001953 Chr02 NC_080388.1:35245500-35245512promoter 内 1430-1442 bp - 2559 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 35248071-35250239(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CATATATTCTCTT
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SmilChr01G000699 Chr01 NC_080387.1:15682598-15682610promoter 内 383-395 bp + 3606 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 15677904-15678992(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CATATATTCTCTT
SmilChr03G001131 Chr03 NC_080389.1:13056902-13056914promoter 内 334-346 bp - 3655 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 13060569-13065688(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CCAATATTCCTTA
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SmilChr01G003328 Chr01 NC_080387.1:51969540-51969552promoter 内 3938-3950 bp - 51 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 51969603-51972266(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGCATATTCTGCA