转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000040; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00000579-RA_Salv SmilChr04G000040 ERF XP_057808382.1 MP00312 AATTGTCGGTGGAGT

可能结合的靶基因

8490 个结合位点 7006 个候选靶基因 第 10 / 141 下载 TSV

上一页 10 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G002267 Chr04 NC_080390.1:36679272-36679286promoter 内 500-514 bp - 3487 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 36682773-36686580(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTTCACCGACACTC
SmilChr03G001517 Chr03 NC_080389.1:18592643-18592657promoter 内 450-464 bp + 3537 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 18596194-18596810(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GAGTGTCGGTGAAGG
SmilChr08G000354 Chr08 NC_080394.1:2426022-2426036promoter 内 439-453 bp + 3548 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 2429584-2436644(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTTTGTCGGTGCCGG
SmilChr08G001272 Chr08 NC_080394.1:10141826-10141840promoter 内 342-356 bp - 3645 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 10132537-10138181(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TATTGTCGGTGGGGT
SmilChr07G004725 Chr07 NC_080393.1:60130317-60130331promoter 内 313-327 bp + 3674 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 60123770-60126643(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTTCACCGACACTC
SmilChr08G001338 Chr08 NC_080394.1:10687070-10687084promoter 内 238-252 bp + 3749 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 10690833-10691787(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GAGTGTCGGTGAAGG
SmilChr07G001189 Chr07 NC_080393.1:9029309-9029323promoter 内 192-206 bp + 3795 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 9033118-9034561(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GAGTGTCGGTGAAGG
SmilChr03G000709 Chr03 NC_080389.1:7889402-7889416promoter 内 189-203 bp - 3798 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 7878409-7885604(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGTTGTCGGTGGCTT
SmilChr01G000323 Chr01 NC_080387.1:6380247-6380261promoter 内 179-193 bp + 3808 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 6384069-6392414(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GGTCGTCGGTGGTGG
SmilChr08G000344 Chr08 NC_080394.1:2386504-2386518promoter 内 150-164 bp + 3837 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 2390355-2391419(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTTTGTCGGTGCCGG
SmilChr01G002675 Chr01 NC_080387.1:44965357-44965371promoter 内 104-118 bp + 3883 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 44960668-44961474(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTTCACCGACACTC
SmilChr01G005651 Chr01 NC_080387.1:72894247-72894261promoter 内 55-69 bp - 3932 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 72889589-72890315(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCATGTCGGTGGCGA
SmilChr07G000823 Chr07 NC_080393.1:5796752-5796766promoter 内 1495-1509 bp + 2492 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 6 5799258-5805833(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCGCGTCGGTGGAGA
SmilChr06G001009 Chr06 NC_080392.1:9984891-9984905promoter 内 3655-3669 bp - 332 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 5 9980226-9984559(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CATCGTCGGTGGCCG
SmilChr08G002313 Chr08 NC_080394.1:21802819-21802833promoter 内 1780-1794 bp - 2207 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 21805040-21805113(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACACCACCGACAATC
SmilChr06G002043 Chr06 NC_080392.1:26706244-26706258promoter 内 3135-3149 bp - 852 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 26707110-26710939(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AAGCCACCGACAGCT
SmilChr02G002081 Chr02 NC_080388.1:37388626-37388640promoter 内 2693-2707 bp - 1294 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 37389934-37392438(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AAGCCACCGACAGCT
SmilChr02G001928 Chr02 NC_080388.1:34700316-34700330promoter 内 747-761 bp + 3240 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 34696916-34697076(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ATCCCACCGACACCT
SmilChr02G001859 Chr02 NC_080388.1:33787593-33787607promoter 内 741-755 bp - 3246 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 33790853-33791013(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ATCCCACCGACACCT
SmilChr06G000570 Chr06 NC_080392.1:4862362-4862376promoter 内 520-534 bp - 3467 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 4857908-4858895(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGGTGTCGGTGGTTT
SmilChr01G004715 Chr01 NC_080387.1:65359466-65359480promoter 内 3741-3755 bp - 246 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 65353955-65359220(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CACTGTCGGTGACGC
SmilChr06G001661 Chr06 NC_080392.1:18891927-18891941promoter 内 3709-3723 bp - 278 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 18890472-18891649(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AAGCGTCGGTGGAGC
SmilChr06G001999 Chr06 NC_080392.1:25526207-25526221promoter 内 3615-3629 bp + 372 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 25526593-25529411(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTGTGTCGGTGACGC
SmilChr02G001054 Chr02 NC_080388.1:18817204-18817218promoter 内 3404-3418 bp + 583 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 18817801-18819608(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTTCGTCGGTGGCAG
SmilChr02G001057 Chr02 NC_080388.1:18825265-18825279promoter 内 3404-3418 bp + 583 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 18825862-18827670(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTTCGTCGGTGGCAG
SmilChr05G002109 Chr05 NC_080391.1:22105399-22105413promoter 内 3058-3072 bp - 929 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 22106342-22109510(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CAATCACCGACACCG
SmilChr05G002569 Chr05 NC_080391.1:28858623-28858637promoter 内 3048-3062 bp - 939 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 28851087-28857684(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGGCGTCGGTGGGGA
SmilChr04G003324 Chr04 NC_080390.1:49977741-49977755promoter 内 2628-2642 bp - 1359 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 49974178-49976382(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CATCGTCGGTGGAGT
SmilChr06G003225 Chr06 NC_080392.1:45002912-45002926promoter 内 2441-2455 bp - 1546 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 45000062-45001366(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGTGTCGGTGTTGG
SmilChr04G003226 Chr04 NC_080390.1:49092118-49092132promoter 内 2318-2332 bp - 1669 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 49088561-49090449(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CATCGTCGGTGGAGT
SmilChr03G001926 Chr03 NC_080389.1:27023314-27023328promoter 内 2088-2102 bp - 1899 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 27018285-27021415(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGTTGTCGGTGAAGG
SmilChr01G001793 Chr01 NC_080387.1:32786865-32786879promoter 内 2077-2091 bp - 1910 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 32788789-32792051(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GCTCCACCGACGCTT
SmilChr06G002150 Chr06 NC_080392.1:29224303-29224317promoter 内 1788-1802 bp - 2199 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 29226516-29228007(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTTCACCGACAGCT
SmilChr07G000770 Chr07 NC_080393.1:5388936-5388950promoter 内 1695-1709 bp - 2292 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 5385674-5386644(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGCTGTCGGTGGTTG
SmilChr08G003208 Chr08 NC_080394.1:32898871-32898885promoter 内 1584-1598 bp + 2403 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 32901288-32903108(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CATCGTCGGTGGAGT
SmilChr02G000542 Chr02 NC_080388.1:7470801-7470815promoter 内 1389-1403 bp + 2598 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 7473413-7474540(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGGTGTCGGTGTCGG
SmilChr02G001055 Chr02 NC_080388.1:18817204-18817218promoter 内 1363-1377 bp + 2624 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 18819842-18819997(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTTCGTCGGTGGCAG
SmilChr02G001058 Chr02 NC_080388.1:18825265-18825279promoter 内 1362-1376 bp + 2625 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 18827904-18828059(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTTCGTCGGTGGCAG
SmilChr08G003661 Chr08 NC_080394.1:40335072-40335086promoter 内 1208-1222 bp - 2779 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 40337865-40341047(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCAACACCGACACCG
SmilChr01G001359 Chr01 NC_080387.1:26926106-26926120promoter 内 1186-1200 bp + 2801 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 26928921-26930121(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TATCGTCGGTGGAGG
SmilChr01G004664 Chr01 NC_080387.1:64747833-64747847promoter 内 1129-1143 bp - 2858 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 64744474-64744975(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GAGTGTCGGTGATGG
SmilChr05G000838 Chr05 NC_080391.1:6611988-6612002promoter 内 1060-1074 bp + 2927 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 6614929-6633581(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGTCGTCGGTGGGGA
SmilChr02G001056 Chr02 NC_080388.1:18817204-18817218promoter 内 979-993 bp + 3008 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 18820226-18823614(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTTCGTCGGTGGCAG
SmilChr01G002286 Chr01 NC_080387.1:39670945-39670959promoter 内 691-705 bp + 3296 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 39664252-39667649(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGTCCACCGACAGCA
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SmilChr07G004545 Chr07 NC_080393.1:58167009-58167023promoter 内 195-209 bp + 3792 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 58160398-58163217(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCATCACCGACACTC
SmilChr06G002525 Chr06 NC_080392.1:36236711-36236725promoter 内 104-118 bp - 3883 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 36240608-36242132(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GCTCCACCGACGCTT
SmilChr02G005470 Chr02 NC_080388.1:74970307-74970321promoter 内 2190-2204 bp - 1797 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 7 74972118-74974885(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGACGAAA
SmilChr08G004216 Chr08 NC_080394.1:51549670-51549684promoter 内 1968-1982 bp + 2019 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 4 51544308-51547651(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCGGCACCGACACAA
SmilChr07G003992 Chr07 NC_080393.1:50982229-50982243promoter 内 3035-3049 bp - 952 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 50983195-50985631(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCACCACCGACGAAT