转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G002885; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022980-RA_Salv SmilChr01G002885 ERF XP_057767601.1 MP00151 ATGGACGGTGGAGG

可能结合的靶基因

9976 个结合位点 6907 个候选靶基因 第 103 / 139 下载 TSV

上一页 103 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G003877 Chr05 NC_080391.1:52347758-52347771promoter 内 3687-3700 bp + 301 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 52348072-52349376(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CTGGACGGTGCCTC
SmilChr01G006058 Chr01 NC_080387.1:76043041-76043054promoter 内 3587-3600 bp - 401 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 76039776-76042640(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GATGTCGGTGGATG
SmilChr02G003081 Chr02 NC_080388.1:51734254-51734267promoter 内 3570-3583 bp - 418 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 51733764-51733836(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TGGGGCGGTGGAGT
SmilChr02G004581 Chr02 NC_080388.1:68305089-68305102promoter 内 3555-3568 bp - 433 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 68300347-68304656(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATTGACGGTGATGC
SmilChr01G000399 Chr01 NC_080387.1:8201768-8201781promoter 内 3537-3550 bp - 451 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 8202232-8203476(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CGGCCTCCGTCCAG
SmilChr02G004288 Chr02 NC_080388.1:65214890-65214903promoter 内 3487-3500 bp - 501 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 65213280-65214389(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TAGGACGGTGAGAG
SmilChr06G002782 Chr06 NC_080392.1:40500389-40500402promoter 内 3297-3310 bp - 691 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 40501093-40503339(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTGTCACCGTCCGC
SmilChr06G000986 Chr06 NC_080392.1:9653934-9653947promoter 内 3296-3309 bp - 692 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 9654639-9655472(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TATCCACCGCCCCC
SmilChr05G001100 Chr05 NC_080391.1:9155809-9155822promoter 内 3263-3276 bp + 725 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 9156547-9156885(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGAGGCCA
SmilChr04G000898 Chr04 NC_080390.1:11549562-11549575promoter 内 3240-3253 bp - 748 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 11547810-11548814(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATTGACGGTGGATC
SmilChr01G003847 Chr01 NC_080387.1:56776682-56776695promoter 内 3184-3197 bp + 804 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 56777499-56780088(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GGGGGCGGTGGATA
SmilChr06G001223 Chr06 NC_080392.1:12633366-12633379promoter 内 3116-3129 bp + 872 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 12626675-12632494(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACTCCACCGACATC
SmilChr01G002584 Chr01 NC_080387.1:43971954-43971967promoter 内 2973-2986 bp - 1015 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 43970859-43970939(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGATGCGG
SmilChr07G001034 Chr07 NC_080393.1:7544924-7544937promoter 内 2881-2894 bp + 1107 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 7546044-7550251(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATTGACGGTGATGC
SmilChr02G000143 Chr02 NC_080388.1:1920935-1920948promoter 内 2811-2824 bp - 1177 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 1922125-1924139(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCTTCTCCGTCCAT
SmilChr01G005141 Chr01 NC_080387.1:69195293-69195306promoter 内 2753-2766 bp + 1235 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 69196541-69199173(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TGGGGCGGTGGAGT
SmilChr03G001508 Chr03 NC_080389.1:18442926-18442939promoter 内 2725-2738 bp + 1263 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 18444202-18444960(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTGGACGGCGTTGT
SmilChr02G004464 Chr02 NC_080388.1:67057183-67057196promoter 内 2709-2722 bp - 1279 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 67058475-67063551(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCTCCACCGTCTTC
SmilChr03G001667 Chr03 NC_080389.1:21679017-21679030promoter 内 2673-2686 bp + 1315 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 21680345-21684580(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CTGGTCGGTGGATT
SmilChr03G003436 Chr03 NC_080389.1:52716279-52716292promoter 内 2666-2679 bp + 1322 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 52717614-52726291(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCCGACGGTGGTGG
SmilChr02G000875 Chr02 NC_080388.1:15079424-15079437promoter 内 2649-2662 bp + 1339 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 15075885-15078085(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCGCCACCGTCTGA
SmilChr05G000581 Chr05 NC_080391.1:4373564-4373577promoter 内 2526-2539 bp + 1462 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 4375039-4379401(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GAAGACGGTGGCAG
SmilChr04G000695 Chr04 NC_080390.1:8130787-8130800promoter 内 2494-2507 bp + 1494 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 8127825-8129293(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CTGACACCGTCCTT
SmilChr03G004286 Chr03 NC_080389.1:61272502-61272515promoter 内 2493-2506 bp + 1495 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 61274010-61275939(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GAAGACGGTGGCAG
SmilChr02G003029 Chr02 NC_080388.1:50995629-50995642promoter 内 2451-2464 bp + 1537 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 50997179-51002895(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGCGTGAC
SmilChr03G003090 Chr03 NC_080389.1:47927283-47927296promoter 内 2235-2248 bp + 1753 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 47923075-47925530(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 AATCCACCGTCCCT
SmilChr04G003956 Chr04 NC_080390.1:55102980-55102993promoter 内 2231-2244 bp + 1757 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 55104750-55107189(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGTTGGAG
SmilChr02G002134 Chr02 NC_080388.1:38458357-38458370promoter 内 2052-2065 bp - 1936 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 38455703-38456421(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CGGGACGGTGAAGA
SmilChr02G001201 Chr02 NC_080388.1:22148920-22148933promoter 内 2039-2052 bp - 1949 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 22150882-22155610(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CATCCACCGCCCCA
SmilChr03G001108 Chr03 NC_080389.1:12758429-12758442promoter 内 2032-2045 bp + 1956 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 12760398-12762335(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GAAGACGGTGGAGC
SmilChr02G004438 Chr02 NC_080388.1:66754927-66754940promoter 内 1992-2005 bp - 1996 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 66756936-66758245(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCACCACCGTCGGC
SmilChr02G001605 Chr02 NC_080388.1:29879793-29879806promoter 内 1924-1937 bp + 2064 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 29881870-29888854(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCCGACGGTGGTGG
SmilChr02G001968 Chr02 NC_080388.1:35610326-35610339promoter 内 1768-1781 bp + 2220 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 35612559-35613464(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTGGACGGCGCGAC
SmilChr02G003157 Chr02 NC_080388.1:52607440-52607453promoter 内 1757-1770 bp - 2231 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 52609684-52612850(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTCACGCCGTCCAC
SmilChr04G004011 Chr04 NC_080390.1:55417804-55417817promoter 内 1750-1763 bp - 2238 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 55420055-55421017(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCTCCACCGGCATG
SmilChr05G001600 Chr05 NC_080391.1:14736366-14736379promoter 内 1707-1720 bp - 2281 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 14723614-14734085(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGTGTTTA
SmilChr01G003865 Chr01 NC_080387.1:56894942-56894955promoter 内 1656-1669 bp - 2332 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 56897287-56900336(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCACCACCGTCGGC
SmilChr01G002105 Chr01 NC_080387.1:37077668-37077681promoter 内 1575-1588 bp + 2413 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 37074589-37075255(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CTTCCACCGCCCGT
SmilChr01G002701 Chr01 NC_080387.1:45298441-45298454promoter 内 1297-1310 bp + 2691 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 45283580-45295750(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACATCACCGTCAAC
SmilChr05G003744 Chr05 NC_080391.1:50545357-50545370promoter 内 1246-1259 bp - 2742 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 50548112-50553897(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACAACGCCGTCCAA
SmilChr03G003091 Chr03 NC_080389.1:47927283-47927296promoter 内 1211-1224 bp + 2777 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 47930073-47932991(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 AGGGACGGTGGATT
SmilChr02G004330 Chr02 NC_080388.1:65587608-65587621promoter 内 1082-1095 bp - 2906 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 65581920-65584702(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GATGTCGGTGGATG
SmilChr06G000987 Chr06 NC_080392.1:9653934-9653947promoter 内 986-999 bp - 3002 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 9656949-9659585(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TATCCACCGCCCCC
SmilChr05G000830 Chr05 NC_080391.1:6536997-6537010promoter 内 921-934 bp + 3067 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 6532277-6533930(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACTCCACCGACATC
SmilChr01G000997 Chr01 NC_080387.1:21012269-21012282promoter 内 804-817 bp - 3184 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 21002777-21009085(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTGGACGGCGTTGT
SmilChr04G000874 Chr04 NC_080390.1:11097574-11097587promoter 内 699-712 bp - 3289 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 11100876-11102437(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GAATCGCCGTCCAA
SmilChr04G001489 Chr04 NC_080390.1:24341466-24341479promoter 内 639-652 bp + 3349 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 24336566-24338117(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCGGCACCGTCATC
SmilChr03G004583 Chr03 NC_080389.1:63684897-63684910promoter 内 622-635 bp - 3366 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 63688276-63694295(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCTTCTCCGTCCAT
SmilChr04G003280 Chr04 NC_080390.1:49470018-49470031promoter 内 486-499 bp - 3502 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 49473533-49475517(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCATCACCGTCTAT
SmilChr04G002546 Chr04 NC_080390.1:40761199-40761212promoter 内 446-459 bp + 3542 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 40756082-40757657(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCACCACCGTCGGC