转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G000949; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003681-RA_Salv SmilChr02G000949 bZIP XP_057795176.1 MP00318 TGCCACGTCAGCATT

可能结合的靶基因

9413 个结合位点 6849 个候选靶基因 第 103 / 137 下载 TSV

上一页 103 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G004512 Chr07 NC_080393.1:57768305-57768319promoter 内 2219-2233 bp + 1768 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 57756612-57766537(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TAACCTGACGTGGAA
SmilChr01G001973 Chr01 NC_080387.1:35112098-35112112promoter 内 1883-1897 bp - 2104 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 35114216-35115779(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGAATCGACGTGGCG
SmilChr01G001962 Chr01 NC_080387.1:34909465-34909479promoter 内 1794-1808 bp - 2193 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 34911672-34914031(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGAATCGACGTGGCG
SmilChr02G001324 Chr02 NC_080388.1:24728318-24728332promoter 内 1692-1706 bp - 2295 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 24730627-24732489(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AATTATGACGTGTCC
SmilChr08G004084 Chr08 NC_080394.1:49473871-49473885promoter 内 1532-1546 bp - 2455 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 49468558-49471416(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGGTTCTG
SmilChr02G003418 Chr02 NC_080388.1:55411986-55412000promoter 内 1080-1094 bp - 2907 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 55406754-55409079(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTCGATTCC
SmilChr02G004706 Chr02 NC_080388.1:69356150-69356164promoter 内 979-993 bp - 3008 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 69351219-69353142(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGGTTCTG
SmilChr08G004918 Chr08 NC_080394.1:58124774-58124788promoter 内 822-836 bp + 3165 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 58127953-58129973(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTGATGTAT
SmilChr01G000360 Chr01 NC_080387.1:7429196-7429210promoter 内 573-587 bp + 3414 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 7425677-7425782(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGATAAGACGTGGCT
SmilChr02G001730 Chr02 NC_080388.1:31792410-31792424promoter 内 519-533 bp + 3468 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 31788837-31788942(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGATAAGACGTGGCT
SmilChr08G003011 Chr08 NC_080394.1:30223460-30223474promoter 内 171-185 bp - 3816 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 30227290-30228918(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGAATCGACGTGGCG
SmilChr01G001628 Chr01 NC_080387.1:30346745-30346759promoter 内 3986-4000 bp + 1 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 30341174-30346744(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGGCATCACGTGGCG
SmilChr01G002731 Chr01 NC_080387.1:45664184-45664198promoter 内 3983-3997 bp - 4 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 45664202-45666868(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GCTTTCCACGTGGCC
SmilChr04G000853 Chr04 NC_080390.1:10797390-10797404promoter 内 3978-3992 bp - 9 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 10797413-10801269(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGTTTTGACGTGTCG
SmilChr04G000090 Chr04 NC_080390.1:810204-810218promoter 内 3938-3952 bp - 49 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 810267-814505(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTGTCCTACGTGGCG
SmilChr04G002812 Chr04 NC_080390.1:44134097-44134111promoter 内 3935-3949 bp + 52 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 44130870-44134045(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GACAGACACGTGGCA
SmilChr06G001336 Chr06 NC_080392.1:13893735-13893749promoter 内 3931-3945 bp + 56 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 13891501-13893679(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AATGCTGACGTGGTG
SmilChr02G004898 Chr02 NC_080388.1:70998889-70998903promoter 内 3929-3943 bp + 58 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 70998961-71000673(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TCCCACGTCAGCCCA
SmilChr04G003163 Chr04 NC_080390.1:48260143-48260157promoter 内 3922-3936 bp - 65 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 48260222-48264857(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CCCAATGACGTGGCA
SmilChr07G000774 Chr07 NC_080393.1:5421247-5421261promoter 内 3884-3898 bp + 103 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 5421364-5422583(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGTCGTCA
SmilChr06G000832 Chr06 NC_080392.1:7832907-7832921promoter 内 3880-3894 bp - 107 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 7833028-7842373(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GCAGATGACGTGGAT
SmilChr08G001866 Chr08 NC_080394.1:16025048-16025062promoter 内 3859-3873 bp + 128 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 16025190-16025735(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTCCACGTCGCATAC
SmilChr07G004378 Chr07 NC_080393.1:56316813-56316827promoter 内 3829-3843 bp - 158 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 56316985-56320063(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGAATCGACGTGGCG
SmilChr06G003108 Chr06 NC_080392.1:43924965-43924979promoter 内 3783-3797 bp + 204 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 43925183-43927272(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTGTAAACC
SmilChr02G000678 Chr02 NC_080388.1:10589525-10589539promoter 内 3779-3793 bp - 208 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 10580733-10589317(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTCACGCTT
SmilChr02G005153 Chr02 NC_080388.1:72895031-72895045promoter 内 3720-3734 bp - 267 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 72895312-72899474(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AAAGATGACGTGGAT
SmilChr01G003206 Chr01 NC_080387.1:50847774-50847788promoter 内 3703-3717 bp - 284 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 50815771-50847490(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCAAAATT
SmilChr05G003077 Chr05 NC_080391.1:38837674-38837688promoter 内 3703-3717 bp - 284 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 38835915-38837390(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TCCCACGTCACCTCT
SmilChr02G002004 Chr02 NC_080388.1:36187228-36187242promoter 内 3698-3712 bp + 289 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 36187531-36187691(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTCGCTCTG
SmilChr07G001001 Chr07 NC_080393.1:7277478-7277492promoter 内 3694-3708 bp + 293 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 7277785-7281231(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTCATTTTC
SmilChr07G003893 Chr07 NC_080393.1:48785692-48785706promoter 内 3682-3696 bp - 305 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 48783201-48785387(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGACACGTCAACTCG
SmilChr01G003488 Chr01 NC_080387.1:53427616-53427630promoter 内 3670-3684 bp - 317 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 53422592-53427299(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTCGATTCC
SmilChr03G000864 Chr03 NC_080389.1:9839777-9839791promoter 内 3665-3679 bp + 322 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 9840113-9843954(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTCGATTCC
SmilChr06G001237 Chr06 NC_080392.1:12773271-12773285promoter 内 3537-3551 bp + 450 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 12750540-12772821(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGTGTTGACGTGTCT
SmilChr02G002739 Chr02 NC_080388.1:47321518-47321532promoter 内 3526-3540 bp + 461 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 47321993-47324609(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTCCACGTCAGATAA
SmilChr01G004995 Chr01 NC_080387.1:67995414-67995428promoter 内 3459-3473 bp - 528 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 67990440-67994886(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTCGATTCC
SmilChr06G000290 Chr06 NC_080392.1:2001084-2001098promoter 内 3452-3466 bp + 535 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 2001633-2006170(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTCGATTCC
SmilChr06G000833 Chr06 NC_080392.1:7832907-7832921promoter 内 3393-3407 bp - 594 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 7833515-7835643(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GCAGATGACGTGGAT
SmilChr08G004397 Chr08 NC_080394.1:53687284-53687298promoter 内 3343-3357 bp + 644 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 53687942-53693671(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTACACGTCAGCATT
SmilChr07G001078 Chr07 NC_080393.1:7914814-7914828promoter 内 3304-3318 bp + 683 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 7915511-7918256(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGGATTCC
SmilChr07G001238 Chr07 NC_080393.1:9489773-9489787promoter 内 3292-3306 bp - 695 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 9490482-9493973(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCGATGACGTGTCT
SmilChr04G001632 Chr04 NC_080390.1:27082611-27082625promoter 内 3244-3258 bp - 743 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 27083368-27086311(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTTTTTCACGTGGCC
SmilChr03G000706 Chr03 NC_080389.1:7860974-7860988promoter 内 3212-3226 bp + 775 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 7861763-7864719(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAGGACAG
SmilChr08G004396 Chr08 NC_080394.1:53687284-53687298promoter 内 3182-3196 bp + 805 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 53685766-53686479(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AATGCTGACGTGTAC
SmilChr03G004327 Chr03 NC_080389.1:61630939-61630953promoter 内 3123-3137 bp + 864 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 61619444-61630075(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ACTGTCTACGTGGCG
SmilChr08G002171 Chr08 NC_080394.1:19635622-19635636promoter 内 3111-3125 bp - 876 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 19630388-19634746(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATCCACGTCATCTTT
SmilChr08G001509 Chr08 NC_080394.1:12238923-12238937promoter 内 3055-3069 bp + 932 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 12239869-12243892(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGAAGATA
SmilChr07G003775 Chr07 NC_080393.1:46225995-46226009promoter 内 3016-3030 bp + 971 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 46226980-46227456(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTCTTATCC
SmilChr05G003884 Chr05 NC_080391.1:52601482-52601496promoter 内 2993-3007 bp - 994 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 52598222-52600488(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCTGACCA
SmilChr08G000101 Chr08 NC_080394.1:624209-624223promoter 内 2948-2962 bp - 1039 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 625262-627529(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GCAGATGACGTGGAT