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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004607; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002089-RA_Salv SmilChr02G004607 C2H2 XP_057791470.1 MP00608 AAAAACAGAGCA

可能结合的靶基因

9817 个结合位点 6398 个候选靶基因 第 104 / 128 下载 TSV

上一页 104 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002500 Chr02 NC_080388.1:43454054-43454065promoter 内 610-621 bp + 3380 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 43449618-43450674(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCCTCA
SmilChr02G001120 Chr02 NC_080388.1:20210148-20210159promoter 内 584-595 bp + 3406 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 20204191-20206742(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATTTCTGTTTCT
SmilChr02G002460 Chr02 NC_080388.1:42882998-42883009promoter 内 555-566 bp - 3435 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 42886444-42889510(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTTTCTGTTTTA
SmilChr01G001693 Chr01 NC_080387.1:31144338-31144349promoter 内 554-565 bp + 3436 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 31147785-31148333(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAAAC
SmilChr01G004579 Chr01 NC_080387.1:63848807-63848818promoter 内 530-541 bp - 3460 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 63843623-63845347(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAAAA
SmilChr02G004852 Chr02 NC_080388.1:70683215-70683226promoter 内 489-500 bp - 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 70678035-70679714(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAAAT
SmilChr02G000383 Chr02 NC_080388.1:4783482-4783493promoter 内 461-472 bp + 3529 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 4787022-4791337(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAAAT
SmilChr02G002946 Chr02 NC_080388.1:49994491-49994502promoter 内 461-472 bp + 3529 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 49990033-49990962(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GTTTCTGTTTTG
SmilChr01G003889 Chr01 NC_080387.1:57201399-57201410promoter 内 451-462 bp - 3539 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 57204949-57209344(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CCTTCTGTTTTA
SmilChr01G002890 Chr01 NC_080387.1:47591963-47591974promoter 内 444-455 bp - 3546 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 47588344-47588417(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAACAGAAAC
SmilChr01G001655 Chr01 NC_080387.1:30604789-30604800promoter 内 436-447 bp + 3554 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 30608354-30613727(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAAAT
SmilChr01G000982 Chr01 NC_080387.1:20788454-20788465promoter 内 417-428 bp - 3573 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 20792038-20795706(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATTTCTGTTTCT
SmilChr02G001663 Chr02 NC_080388.1:30850187-30850198promoter 内 415-426 bp + 3575 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 30853773-30857355(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAGGCAGAGCA
SmilChr02G002053 Chr02 NC_080388.1:36933654-36933665promoter 内 392-403 bp + 3598 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 36937263-36939768(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAAAT
SmilChr01G004140 Chr01 NC_080387.1:59903032-59903043promoter 内 379-390 bp + 3611 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 59897665-59899421(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GTTTCTGTTTTC
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SmilChr02G003333 Chr02 NC_080388.1:54579048-54579059promoter 内 321-332 bp + 3669 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 54573091-54575379(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AATTCTGTTTTG
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SmilChr02G002813 Chr02 NC_080388.1:48178723-48178734promoter 内 246-257 bp + 3744 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 48182478-48183750(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAGGCAGAGCA
SmilChr01G001879 Chr01 NC_080387.1:33823570-33823581promoter 内 224-235 bp - 3766 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 33816167-33819804(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAAAT
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SmilChr01G005556 Chr01 NC_080387.1:72383892-72383903promoter 内 204-215 bp - 3786 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 72377029-72380106(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAAAT
SmilChr02G001591 Chr02 NC_080388.1:29684148-29684159promoter 内 186-197 bp + 3804 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 29677481-29680344(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AATTCTGTTTTG
SmilChr02G000973 Chr02 NC_080388.1:17013582-17013593promoter 内 145-156 bp + 3845 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 17017438-17018094(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAGAACAGAGTT
SmilChr01G005102 Chr01 NC_080387.1:68812406-68812417promoter 内 52-63 bp - 3938 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 68816355-68818798(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATTTCTGTTTCT
SmilChr02G005260 Chr02 NC_080388.1:73682904-73682915promoter 内 50-61 bp - 3940 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 73686855-73688340(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATTTCTGTTTTT
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SmilChr02G000509 Chr02 NC_080388.1:7006526-7006537promoter 内 44-55 bp + 3946 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 7010483-7028520(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAGGCAGAGCA
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SmilChr03G001586 Chr03 NC_080389.1:20091095-20091106promoter 内 3349-3360 bp - 641 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 20091747-20094864(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TACTCTGTTATG
SmilChr01G002603 Chr01 NC_080387.1:44233531-44233542promoter 内 3320-3331 bp + 670 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 44231924-44232861(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AATTCTGTTTTC
SmilChr01G003148 Chr01 NC_080387.1:50290643-50290654promoter 内 3031-3042 bp + 959 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 50291613-50292790(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAACAGAATT
SmilChr02G005169 Chr02 NC_080388.1:73018261-73018272promoter 内 2507-2518 bp - 1483 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 73013770-73016778(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAATC
SmilChr01G003837 Chr01 NC_080387.1:56722709-56722720promoter 内 1872-1883 bp - 2118 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 56719044-56720591(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAACAGAATT
SmilChr01G000941 Chr01 NC_080387.1:19905663-19905674promoter 内 1775-1786 bp - 2215 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 19907889-19909399(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTCCTA
SmilChr02G001226 Chr02 NC_080388.1:22545877-22545888promoter 内 1373-1384 bp + 2617 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 22542391-22543260(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGCTCTGTTATG
SmilChr03G000720 Chr03 NC_080389.1:8058986-8058997promoter 内 1336-1347 bp + 2654 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 8061651-8063327(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTAACAGAGCA
SmilChr02G001060 Chr02 NC_080388.1:18838874-18838885promoter 内 1262-1273 bp - 2728 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 18841613-18842665(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AATTCTGTTTTC
SmilChr01G005494 Chr01 NC_080387.1:71860200-71860211promoter 内 1227-1238 bp - 2763 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 71853840-71857437(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AATAACAGAGCT
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SmilChr01G003147 Chr01 NC_080387.1:50290643-50290654promoter 内 425-436 bp + 3565 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 50283121-50287078(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AATTCTGTTTCC