转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000157; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00006890-RA_Salv SmilChr04G000157 bHLH XP_057807462.1 MP00081 AGCCACGTGA

可能结合的靶基因

9942 个结合位点 6729 个候选靶基因 第 104 / 135 下载 TSV

上一页 104 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G002732 Chr03 NC_080389.1:43418844-43418853promoter 内 2978-2987 bp + 1014 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 43414949-43417830(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr05G002612 Chr05 NC_080391.1:29402769-29402778promoter 内 2978-2987 bp + 1014 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 29398911-29401755(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr04G001159 Chr04 NC_080390.1:17155772-17155781promoter 内 2977-2986 bp + 1015 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 17151835-17154757(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr05G002613 Chr05 NC_080391.1:29412135-29412144promoter 内 2977-2986 bp + 1015 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 29408325-29411120(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr02G003200 Chr02 NC_080388.1:53161922-53161931promoter 内 2976-2985 bp + 1016 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 53158001-53160906(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr01G001384 Chr01 NC_080387.1:27248655-27248664promoter 内 2974-2983 bp - 1018 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 27249682-27252555(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr02G001096 Chr02 NC_080388.1:19777371-19777380promoter 内 2974-2983 bp - 1018 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 19778398-19784710(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr01G001383 Chr01 NC_080387.1:27238876-27238885promoter 内 2966-2975 bp - 1026 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 27239911-27242779(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr04G003075 Chr04 NC_080390.1:47350442-47350451promoter 内 2965-2974 bp - 1027 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 47351478-47354351(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr01G001050 Chr01 NC_080387.1:21846234-21846243promoter 内 2964-2973 bp - 1028 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 21847271-21850188(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr02G002434 Chr02 NC_080388.1:42395893-42395902promoter 内 2964-2973 bp + 1028 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 42391965-42394865(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr03G003114 Chr03 NC_080389.1:48266469-48266478promoter 内 2964-2973 bp - 1028 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 48267506-48270483(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr04G003538 Chr04 NC_080390.1:51732855-51732864promoter 内 2953-2962 bp + 1039 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 51733903-51736035(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 GCTCACGTGA
SmilChr02G004295 Chr02 NC_080388.1:65309388-65309397promoter 内 2949-2958 bp - 1043 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 65310440-65313328(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr04G003376 Chr04 NC_080390.1:50323178-50323187promoter 内 2948-2957 bp - 1044 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 50324231-50325449(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr03G000965 Chr03 NC_080389.1:10879690-10879699promoter 内 2945-2954 bp - 1047 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 10880746-10883586(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr05G002052 Chr05 NC_080391.1:21391699-21391708promoter 内 2927-2936 bp + 1065 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 21387539-21390634(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr01G006068 Chr01 NC_080387.1:76086118-76086127promoter 内 2864-2873 bp - 1128 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 76087255-76090162(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr01G000183 Chr01 NC_080387.1:3142450-3142459promoter 内 2851-2860 bp - 1141 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 3143600-3146417(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr01G004978 Chr01 NC_080387.1:67837185-67837194promoter 内 2787-2796 bp + 1205 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 67838399-67842346(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TGACACGTGA
SmilChr01G002186 Chr01 NC_080387.1:37989485-37989494promoter 内 2708-2717 bp + 1284 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 37987439-37988201(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr02G002129 Chr02 NC_080388.1:38145179-38145188promoter 内 2692-2701 bp - 1300 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 38142935-38143879(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TGACACGTGA
SmilChr03G000892 Chr03 NC_080389.1:10199314-10199323promoter 内 2650-2659 bp - 1342 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 10181406-10197972(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TGACACGTGA
SmilChr04G001302 Chr04 NC_080390.1:20725565-20725574promoter 内 2616-2625 bp - 1376 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 20726950-20729795(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr02G002414 Chr02 NC_080388.1:42119437-42119446promoter 内 2593-2602 bp + 1399 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 42113950-42118038(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr03G000561 Chr03 NC_080389.1:6100414-6100423promoter 内 2519-2528 bp - 1473 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 6101896-6104054(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr05G001433 Chr05 NC_080391.1:13074944-13074953promoter 内 2510-2519 bp + 1482 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 13071265-13073462(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr01G002179 Chr01 NC_080387.1:37888773-37888782promoter 内 2478-2487 bp - 1514 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 37890296-37898608(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr03G002436 Chr03 NC_080389.1:38687458-38687467promoter 内 2429-2438 bp - 1563 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 38684669-38685895(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TGACACGTGA
SmilChr05G000275 Chr05 NC_080391.1:2126286-2126295promoter 内 2348-2357 bp + 1644 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 2127939-2131408(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TGACACGTGA
SmilChr01G004780 Chr01 NC_080387.1:65968054-65968063promoter 内 2290-2299 bp - 1702 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 65969765-65985461(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr05G001033 Chr05 NC_080391.1:8474399-8474408promoter 内 2286-2295 bp - 1706 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 8471070-8472693(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TGACACGTGA
SmilChr02G000386 Chr02 NC_080388.1:4808069-4808078promoter 内 2098-2107 bp - 1894 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 4804307-4806175(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TGACACGTGA
SmilChr01G001774 Chr01 NC_080387.1:32655015-32655024promoter 内 1956-1965 bp - 2036 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 32650047-32652979(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TGACACGTGA
SmilChr03G002294 Chr03 NC_080389.1:36145429-36145438promoter 内 1936-1945 bp - 2056 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 36147494-36149380(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
SmilChr03G003745 Chr03 NC_080389.1:56506856-56506865promoter 内 1921-1930 bp + 2071 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 56501836-56504785(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGTCA
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