转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001518; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023584-RA_Salv SmilChr05G001518 WRKY XP_057765511.1 MP00455 AACGTTGACTATT

可能结合的靶基因

9792 个结合位点 6900 个候选靶基因 第 106 / 138 下载 TSV

上一页 106 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000359 Chr02 NC_080388.1:4631530-4631542promoter 内 201-213 bp + 3788 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 4635330-4640870(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTGTTGACTGAA
SmilChr02G001196 Chr02 NC_080388.1:22003218-22003230promoter 内 195-207 bp - 3794 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 22007024-22012627(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTAGTCAACAAA
SmilChr01G001604 Chr01 NC_080387.1:30208772-30208784promoter 内 138-150 bp - 3851 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 30200381-30204921(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTGTTGACTGAA
SmilChr01G003590 Chr01 NC_080387.1:54443105-54443117promoter 内 104-116 bp + 3885 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 54437545-54439220(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATAGTCAAACAT
SmilChr01G005966 Chr01 NC_080387.1:75368309-75368321promoter 内 104-116 bp + 3885 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 75372206-75373023(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TAAGTTGACTAGA
SmilChr03G004191 Chr03 NC_080389.1:60580305-60580317promoter 内 101-113 bp - 3888 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 60584205-60587429(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAATGCA
SmilChr02G002680 Chr02 NC_080388.1:46390928-46390940promoter 内 80-92 bp + 3909 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 46384041-46387019(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCGAGTCAACTGT
SmilChr03G002894 Chr03 NC_080389.1:45649529-45649541promoter 内 65-77 bp - 3924 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 45653465-45665544(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCGAGTCAACAAA
SmilChr01G000361 Chr01 NC_080387.1:7422307-7422319promoter 内 62-74 bp + 3927 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 7426246-7428349(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTGTTGACTGAA
SmilChr01G004547 Chr01 NC_080387.1:63598153-63598165promoter 内 62-74 bp - 3927 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 63602092-63602163(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTAGTCAAAAGC
SmilChr02G003004 Chr02 NC_080388.1:50694479-50694491promoter 内 59-71 bp - 3930 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 50689365-50690549(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATTTTGACTATT
SmilChr03G002515 Chr03 NC_080389.1:40026822-40026834promoter 内 1320-1332 bp - 2669 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 3 40029503-40030220(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATGAGTCAACAGG
SmilChr01G005811 Chr01 NC_080387.1:74126547-74126559promoter 内 3819-3831 bp + 170 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 74126729-74127211(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTAGTTGACTAGT
SmilChr03G000913 Chr03 NC_080389.1:10455946-10455958promoter 内 3341-3353 bp + 648 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 10456606-10459868(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTAGTTGACTTGT
SmilChr02G001440 Chr02 NC_080388.1:27084401-27084413promoter 内 3173-3185 bp - 816 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 27085229-27088122(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTTAGTCAATGCT
SmilChr01G003917 Chr01 NC_080387.1:57441719-57441731promoter 内 2966-2978 bp - 1023 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 57442754-57447133(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTAGTCAATGCT
SmilChr02G005377 Chr02 NC_080388.1:74446947-74446959promoter 内 2660-2672 bp + 1329 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 74441904-74445618(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAACTAG
SmilChr02G005217 Chr02 NC_080388.1:73379629-73379641promoter 内 2644-2656 bp + 1345 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 73380986-73384217(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCTGTTGACTCAT
SmilChr01G001740 Chr01 NC_080387.1:32039414-32039426promoter 内 1475-1487 bp - 2514 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 32041940-32046946(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTCAGTCAACTTA
SmilChr01G005810 Chr01 NC_080387.1:74126547-74126559promoter 内 1355-1367 bp + 2634 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 74123288-74123913(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACTAGTCAACTAG
SmilChr02G002013 Chr02 NC_080388.1:36274594-36274606promoter 内 1349-1361 bp + 2640 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 36269054-36271954(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTTAGTCAATGCT
SmilChr03G001305 Chr03 NC_080389.1:15284020-15284032promoter 内 1322-1334 bp + 2667 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 15280207-15281353(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAAATCT
SmilChr03G002671 Chr03 NC_080389.1:42434736-42434748promoter 内 1214-1226 bp + 2775 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 42430941-42431961(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTTAGTCAATGCT
SmilChr01G006008 Chr01 NC_080387.1:75640993-75641005promoter 内 919-931 bp + 3070 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 75637045-75637923(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAAAGG
SmilChr03G002665 Chr03 NC_080389.1:42348531-42348543promoter 内 293-305 bp - 3696 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 42352239-42358802(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGAAGTCAACAAC
SmilChr02G001439 Chr02 NC_080388.1:27084401-27084413promoter 内 170-182 bp - 3819 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 27075764-27080582(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGCATTGACTAAG
SmilChr01G004922 Chr01 NC_080387.1:67300049-67300061promoter 内 148-160 bp + 3841 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 67303902-67303973(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGCATTGACTAAG
SmilChr01G003916 Chr01 NC_080387.1:57441719-57441731promoter 内 124-136 bp - 3865 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 57435045-57437854(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGCATTGACTAAT
SmilChr02G000316 Chr02 NC_080388.1:3978973-3978985promoter 内 61-73 bp - 3928 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 3982913-3984679(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAAAGG
SmilChr02G000711 Chr02 NC_080388.1:11453803-11453815promoter 内 32-44 bp + 3957 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 11457772-11472778(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGATTTGACTATT
SmilChr03G003012 Chr03 NC_080389.1:47021161-47021173promoter 内 3947-3959 bp - 42 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 47021215-47022940(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTAAGTCAACTTA
SmilChr02G003828 Chr02 NC_080388.1:59940891-59940903promoter 内 3930-3942 bp - 59 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 59940962-59943265(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACTAGTCAAAAGG
SmilChr02G004426 Chr02 NC_080388.1:66593273-66593285promoter 内 3832-3844 bp - 157 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 66590778-66593116(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTTGTTGACTTCC
SmilChr01G003382 Chr01 NC_080387.1:52511802-52511814promoter 内 3562-3574 bp + 427 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 52512241-52516320(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTGTTGACTAAC
SmilChr02G002681 Chr02 NC_080388.1:46459897-46459909promoter 内 3487-3499 bp - 502 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 46460411-46461282(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAAAGG
SmilChr02G001011 Chr02 NC_080388.1:17863736-17863748promoter 内 3430-3442 bp + 559 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 17864307-17865524(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTAGTTGACTTTG
SmilChr02G005553 Chr02 NC_080388.1:75504030-75504042promoter 内 3313-3325 bp - 676 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 75501085-75503354(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGATTTGACTATG
SmilChr03G001810 Chr03 NC_080389.1:24711702-24711714promoter 内 3301-3313 bp + 688 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 24703512-24711014(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTAGTCAACTTA
SmilChr01G003304 Chr01 NC_080387.1:51730706-51730718promoter 内 3187-3199 bp - 802 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 51731520-51733060(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAAATGT
SmilChr01G003331 Chr01 NC_080387.1:52024098-52024110promoter 内 3145-3157 bp + 844 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 52024954-52026587(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGATTTGACTATG
SmilChr03G001030 Chr03 NC_080389.1:12014228-12014240promoter 内 3128-3140 bp - 861 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 12012932-12013367(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTAGTTGACTCTG
SmilChr03G003907 Chr03 NC_080389.1:58173143-58173155promoter 内 3076-3088 bp + 913 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 58166803-58172230(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAAAAGG
SmilChr02G002279 Chr02 NC_080388.1:40282105-40282117promoter 内 3053-3065 bp + 936 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 40280312-40281169(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACAAGTCAACTAG
SmilChr03G002844 Chr03 NC_080389.1:45003788-45003800promoter 内 2892-2904 bp + 1097 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 44985445-45002691(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTTAGTCAATGGT
SmilChr01G001785 Chr01 NC_080387.1:32730822-32730834promoter 内 2837-2849 bp - 1152 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 32731986-32737720(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCCAGTCAACTTA
SmilChr02G000445 Chr02 NC_080388.1:5833145-5833157promoter 内 2506-2518 bp + 1483 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 5829772-5831662(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACTAGTCAACTAG
SmilChr01G003729 Chr01 NC_080387.1:55596750-55596762promoter 内 2446-2458 bp - 1543 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 55598305-55600228(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGGAGTCAACCTC
SmilChr03G001102 Chr03 NC_080389.1:12676742-12676754promoter 内 2446-2458 bp + 1543 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 12678297-12684786(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTAGTTGACTATT
SmilChr01G000282 Chr01 NC_080387.1:5534981-5534993promoter 内 2276-2288 bp - 1713 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 5531763-5533268(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAGGTTGACTCCA
SmilChr02G005420 Chr02 NC_080388.1:74650435-74650447promoter 内 2274-2286 bp - 1715 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 74652162-74654206(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAAAGG