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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003117; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008316-RA_Salv SmilChr04G003117 C2H2 XP_057809539.1 MP00592 AAGAAAACGACAAAAAA

可能结合的靶基因

9901 个结合位点 8519 个候选靶基因 第 109 / 171 下载 TSV

上一页 109 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G002072 Chr04 NC_080390.1:33476460-33476476promoter 内 311-327 bp + 3674 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 33467828-33472786(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 TATGTTGTCGTTTTAGG
SmilChr03G002701 Chr03 NC_080389.1:42969520-42969536promoter 内 301-317 bp - 3684 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 42973220-42973996(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 TTTTTTGTCTTAATATT
SmilChr07G001282 Chr07 NC_080393.1:9849345-9849361promoter 内 282-298 bp - 3703 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 9853064-9855183(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 TTTTTTGTCTCTTATTT
SmilChr08G001544 Chr08 NC_080394.1:12641549-12641565promoter 内 273-289 bp + 3712 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 12645277-12646839(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 CGTCAAAAGACAAAAAC
SmilChr06G003116 Chr06 NC_080392.1:44004097-44004113promoter 内 266-282 bp + 3719 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 44007832-44009843(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 AGATATAGGACAAAAAT
SmilChr02G004867 Chr02 NC_080388.1:70778951-70778967promoter 内 258-274 bp - 3727 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 70782694-70782767(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 TTTTTTGTCTCTTTACA
SmilChr07G001234 Chr07 NC_080393.1:9448976-9448992promoter 内 251-267 bp - 3734 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 9452726-9452799(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 TTGTTTGTCGTTTATAC
SmilChr04G002242 Chr04 NC_080390.1:36206631-36206647promoter 内 226-242 bp + 3759 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 36210406-36218365(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 CGAGTAAGGACAAAACA
SmilChr07G000736 Chr07 NC_080393.1:5115621-5115637promoter 内 214-230 bp + 3771 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 5119408-5130553(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 GAATAGACGACAAACAG
SmilChr01G003035 Chr01 NC_080387.1:49367815-49367831promoter 内 206-222 bp + 3779 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 49371610-49374044(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 AGCAAAGAGACAAAAGG
SmilChr02G001693 Chr02 NC_080388.1:31225466-31225482promoter 内 201-217 bp - 3784 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 31220803-31221682(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 AGGATCAAGACAAAAAG
SmilChr01G000580 Chr01 NC_080387.1:12146486-12146502promoter 内 187-203 bp + 3798 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 12150300-12153417(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 CCTAAAACGACAACATA
SmilChr08G001120 Chr08 NC_080394.1:8713025-8713041promoter 内 167-183 bp + 3818 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 8716859-8716993(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 CATAAAATGACAAAATG
SmilChr07G002578 Chr07 NC_080393.1:24686036-24686052promoter 内 163-179 bp - 3822 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 24679564-24682214(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 AAACAAAAGACAAAATA
SmilChr04G001128 Chr04 NC_080390.1:16374387-16374403promoter 内 109-125 bp - 3876 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 16369144-16370511(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 AAGAAAAGGACAGAAAC
SmilChr03G000815 Chr03 NC_080389.1:9328093-9328109promoter 内 98-114 bp + 3887 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 9321230-9324206(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 TATGTTGTCGTTTTAGG
SmilChr03G000816 Chr03 NC_080389.1:9335632-9335648promoter 内 98-114 bp + 3887 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 9328780-9331745(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 TATGTTGTCGTTTTAGG
SmilChr08G002605 Chr08 NC_080394.1:25418207-25418223promoter 内 97-113 bp - 3888 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 25422111-25425051(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 TATGTTGTCGTTTTAGG
SmilChr06G002474 Chr06 NC_080392.1:35573843-35573859promoter 内 58-74 bp + 3927 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 35577786-35578736(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 CCTAAAACGACAACATA
SmilChr03G002429 Chr03 NC_080389.1:38574970-38574986promoter 内 55-71 bp - 3930 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 38578916-38581857(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 TATGTTGTCGTTTTAGG
SmilChr02G002396 Chr02 NC_080388.1:41856262-41856278promoter 内 52-68 bp - 3933 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 41860211-41863413(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 GTTTTTGTCTTTTGACG
SmilChr04G004122 Chr04 NC_080390.1:56076054-56076070promoter 内 50-66 bp - 3935 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 56080005-56083512(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 GATTTTGTCTTTTTAAT
SmilChr01G002666 Chr01 NC_080387.1:44888099-44888115promoter 内 12-28 bp - 3973 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 44883300-44884126(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 ACAAATAGGACAAAATA
SmilChr04G001917 Chr04 NC_080390.1:31261045-31261061promoter 内 943-959 bp - 3042 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 31264103-31268908(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 ATTTTTGTCATTTTGAA
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SmilChr08G002233 Chr08 NC_080394.1:20454021-20454037promoter 内 3340-3356 bp - 645 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 20454682-20458435(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 AATTTTGTCTTTTTAAA
SmilChr08G004146 Chr08 NC_080394.1:50560618-50560634promoter 内 3124-3140 bp - 861 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 50557212-50559757(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 TTCAAAATGACAAAAAT
SmilChr05G002285 Chr05 NC_080391.1:24602861-24602877promoter 内 3081-3097 bp + 904 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 24595185-24601957(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 ATTTTTGTCCCTTTTTC
SmilChr03G003767 Chr03 NC_080389.1:56812341-56812357promoter 内 2807-2823 bp - 1178 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 56813535-56818388(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 ATTTTTGTCATTTTGAA
SmilChr02G003677 Chr02 NC_080388.1:58144091-58144107promoter 内 2789-2805 bp + 1196 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 58142824-58142895(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 AATTTTGTCGGTATATG
SmilChr06G003161 Chr06 NC_080392.1:44564816-44564832promoter 内 2680-2696 bp - 1305 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 44566137-44589406(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 TCTTTTGTCTTGTTGAA
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SmilChr01G000108 Chr01 NC_080387.1:1851077-1851093promoter 内 2413-2429 bp - 1572 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 1852665-1854729(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 CGTTTTGTCTTCTCTTT
SmilChr01G002818 Chr01 NC_080387.1:46749565-46749581promoter 内 2289-2305 bp - 1696 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 46751277-46755300(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 TCTTTTGTCTTTAGGTG
SmilChr03G002546 Chr03 NC_080389.1:40631366-40631382promoter 内 1963-1979 bp - 2022 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 40626762-40629344(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 ATCTAAACGACAAACTT
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SmilChr02G004282 Chr02 NC_080388.1:65068177-65068193promoter 内 1619-1635 bp - 2366 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 65055731-65065811(-) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 TAATATCCGACAAAAAA
SmilChr06G001101 Chr06 NC_080392.1:11069817-11069833promoter 内 1593-1609 bp - 2392 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 11072225-11073100(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 GATTTTGTCTTTACCTA
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SmilChr02G003686 Chr02 NC_080388.1:58221529-58221545promoter 内 1046-1062 bp + 2939 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 58224484-58228396(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 GCTTAAAAGACAAAAGA
SmilChr08G000507 Chr08 NC_080394.1:3704393-3704409promoter 内 1024-1040 bp - 2961 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 3707370-3709422(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 TGATTTGTCGTTTAAAG
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SmilChr01G002287 Chr01 NC_080387.1:39667344-39667360promoter 内 647-663 bp + 3338 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 39670698-39674128(+) SMil_00008316-RA_Salv MP00592 ATTTAAAAGACAAAAAT