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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 114 / 139 下载 TSV

上一页 114 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000189 Chr03 NC_080389.1:2104755-2104766promoter 内 2507-2518 bp - 1483 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 2106249-2109378(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCATCA
SmilChr01G004391 Chr01 NC_080387.1:62085834-62085845promoter 内 2444-2455 bp + 1546 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 62087391-62090905(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTA
SmilChr02G004128 Chr02 NC_080388.1:63520998-63521009promoter 内 2404-2415 bp - 1586 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 63522595-63526785(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCACGTCACGG
SmilChr01G002391 Chr01 NC_080387.1:41174477-41174488promoter 内 2308-2319 bp - 1682 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 41176170-41179598(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCATCA
SmilChr02G004312 Chr02 NC_080388.1:65469591-65469602promoter 内 2300-2311 bp + 1690 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 65471292-65472692(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGTGACGTGAA
SmilChr01G005555 Chr01 NC_080387.1:72371964-72371975promoter 内 2248-2259 bp - 1742 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 72373717-72376075(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCAACA
SmilChr04G002245 Chr04 NC_080390.1:36239823-36239834promoter 内 2248-2259 bp + 1742 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 36233631-36238081(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCATCA
SmilChr01G002985 Chr01 NC_080387.1:48781967-48781978promoter 内 2244-2255 bp - 1746 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 48783724-48784464(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCACAA
SmilChr03G002294 Chr03 NC_080389.1:36145736-36145747promoter 内 2243-2254 bp + 1747 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 36147494-36149380(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr01G005525 Chr01 NC_080387.1:72123440-72123451promoter 内 2234-2245 bp - 1756 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 72125207-72127564(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCAACA
SmilChr03G003745 Chr03 NC_080389.1:56506547-56506558promoter 内 2228-2239 bp - 1762 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 56501836-56504785(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr03G003744 Chr03 NC_080389.1:56495256-56495267promoter 内 2227-2238 bp - 1763 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 56490544-56493493(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr01G001325 Chr01 NC_080387.1:26325343-26325354promoter 内 2208-2219 bp - 1782 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 26327136-26330135(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCAACA
SmilChr02G005367 Chr02 NC_080388.1:74367435-74367446promoter 内 2170-2181 bp + 1820 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 74359181-74365615(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACACGTCATCA
SmilChr02G000936 Chr02 NC_080388.1:16342120-16342131promoter 内 2153-2164 bp - 1837 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 16337052-16340283(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr04G001143 Chr04 NC_080390.1:16832039-16832050promoter 内 2122-2133 bp + 1868 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 16833918-16835681(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr01G000453 Chr01 NC_080387.1:9205357-9205368promoter 内 2087-2098 bp - 1903 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 9199944-9203454(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGAC
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SmilChr02G000188 Chr02 NC_080388.1:2353451-2353462promoter 内 2055-2066 bp + 1935 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 2351430-2351516(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCATGA
SmilChr02G003287 Chr02 NC_080388.1:54155512-54155523promoter 内 2048-2059 bp - 1942 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 54152305-54153570(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCATGACGTGAC
SmilChr01G000454 Chr01 NC_080387.1:9205357-9205368promoter 内 2035-2046 bp - 1955 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 9207323-9209472(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCACAA
SmilChr03G000122 Chr03 NC_080389.1:1321723-1321734promoter 内 2034-2045 bp - 1956 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 1323690-1324707(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCATCA
SmilChr03G001545 Chr03 NC_080389.1:19387197-19387208promoter 内 1995-2006 bp - 1995 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 19383634-19385202(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr03G000245 Chr03 NC_080389.1:2915215-2915226promoter 内 1947-1958 bp + 2043 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 2909013-2913172(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCACAA
SmilChr03G000183 Chr03 NC_080389.1:1958758-1958769promoter 内 1801-1812 bp + 2189 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 1946613-1956569(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCATCA
SmilChr02G001097 Chr02 NC_080388.1:19777678-19777689promoter 内 1746-1757 bp + 2244 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 19779933-19782733(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr01G001026 Chr01 NC_080387.1:21414786-21414797promoter 内 1693-1704 bp + 2297 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 21412190-21412489(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCATCA
SmilChr02G000505 Chr02 NC_080388.1:6962591-6962602promoter 内 1646-1657 bp - 2344 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 6957928-6960247(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTTGACGTGTT
SmilChr04G001938 Chr04 NC_080390.1:31502604-31502615promoter 内 1606-1617 bp - 2384 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 31498037-31500220(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGTGACGTGCA
SmilChr01G004301 Chr01 NC_080387.1:61184399-61184410promoter 内 1600-1611 bp + 2390 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 61186800-61187971(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr01G004302 Chr01 NC_080387.1:61194140-61194151promoter 内 1600-1611 bp + 2390 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 61196541-61197712(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr04G000377 Chr04 NC_080390.1:3792837-3792848promoter 内 1537-1548 bp + 2453 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 3795301-3796462(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr04G000361 Chr04 NC_080390.1:3592448-3592459promoter 内 1470-1481 bp + 2520 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 3594979-3596101(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr01G000983 Chr01 NC_080387.1:20839418-20839429promoter 内 1464-1475 bp - 2526 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 20841955-20843842(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCATCA
SmilChr02G001931 Chr02 NC_080388.1:34714339-34714350promoter 内 1394-1405 bp + 2596 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 34716946-34717989(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr01G006072 Chr01 NC_080387.1:76161329-76161340promoter 内 1370-1381 bp - 2620 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 76157690-76158709(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTT
SmilChr01G000738 Chr01 NC_080387.1:16364026-16364037promoter 内 1337-1348 bp + 2653 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 16360156-16361373(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCACGTCATGG
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SmilChr02G001216 Chr02 NC_080388.1:22372087-22372098promoter 内 1159-1170 bp - 2831 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 22368393-22369256(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGTTGACGTGAA
SmilChr03G001571 Chr03 NC_080389.1:19839094-19839105promoter 内 1129-1140 bp + 2861 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 19841966-19849617(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGTTGACGTGAA
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SmilChr04G001174 Chr04 NC_080390.1:17557605-17557616promoter 内 996-1007 bp - 2994 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 17560610-17564629(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCATCA
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SmilChr01G004501 Chr01 NC_080387.1:63115763-63115774promoter 内 905-916 bp - 3085 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 63118859-63119747(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCACGTCATCC
SmilChr04G000580 Chr04 NC_080390.1:6465421-6465432promoter 内 887-898 bp - 3103 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 6451186-6462318(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGATGACGTGAA