转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 12 / 143 下载 TSV

上一页 12 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004699 Chr01 NC_080387.1:65099043-65099054promoter 内 827-838 bp - 3163 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 65094038-65095880(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGAA
SmilChr05G002005 Chr05 NC_080391.1:20748575-20748586promoter 内 689-700 bp + 3301 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 20751887-20755958(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGGG
SmilChr07G001767 Chr07 NC_080393.1:14958681-14958692promoter 内 661-672 bp + 3329 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 14962021-14964492(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGAA
SmilChr03G003929 Chr03 NC_080389.1:58372394-58372405promoter 内 3185-3196 bp + 805 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 3 58367108-58371589(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCAG
SmilChr02G004369 Chr02 NC_080388.1:66015384-66015395promoter 内 828-839 bp + 3162 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 3 66010727-66012222(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTCAG
SmilChr02G004373 Chr02 NC_080388.1:66082103-66082114promoter 内 821-832 bp + 3169 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 3 66077448-66078934(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTCAG
SmilChr04G001965 Chr04 NC_080390.1:31878960-31878971promoter 内 3864-3875 bp + 126 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 31879097-31880597(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTGGA
SmilChr02G002256 Chr02 NC_080388.1:39995457-39995468promoter 内 3312-3323 bp - 678 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 39996146-40004715(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCGT
SmilChr02G003161 Chr02 NC_080388.1:52652430-52652441promoter 内 1722-1733 bp + 2268 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 52654709-52656442(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTGGA
SmilChr02G003025 Chr02 NC_080388.1:50927271-50927282promoter 内 1687-1698 bp - 2303 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 50923187-50924968(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTGGA
SmilChr08G000769 Chr08 NC_080394.1:5679982-5679993promoter 内 1670-1681 bp - 2320 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 5676045-5677662(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTGGA
SmilChr01G003897 Chr01 NC_080387.1:57254331-57254342promoter 内 1385-1396 bp - 2605 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 57247544-57251726(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTGTA
SmilChr01G003913 Chr01 NC_080387.1:57405683-57405694promoter 内 1166-1177 bp - 2824 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 57398203-57402859(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTGTA
SmilChr07G000296 Chr07 NC_080393.1:1950590-1950601promoter 内 408-419 bp + 3582 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 1954183-1954790(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTGTG
SmilChr01G005956 Chr01 NC_080387.1:75251435-75251446promoter 内 3719-3730 bp - 271 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 75251717-75253499(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTCAG
SmilChr02G001369 Chr02 NC_080388.1:25809407-25809418promoter 内 3240-3251 bp + 750 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 25810168-25810274(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTGTG
SmilChr02G003751 Chr02 NC_080388.1:59153462-59153473promoter 内 810-821 bp - 3180 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 59156653-59157317(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTCAG
SmilChr06G002721 Chr06 NC_080392.1:39297980-39297991promoter 内 604-615 bp - 3386 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 39301377-39307397(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTCGC
SmilChr01G000471 Chr01 NC_080387.1:9612439-9612450promoter 内 173-184 bp + 3817 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 9606995-9608622(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTCGC
SmilChr07G001460 Chr07 NC_080393.1:11439748-11439759promoter 内 2702-2713 bp + 1288 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 11435569-11438460(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCGC
SmilChr08G000515 Chr08 NC_080394.1:3752484-3752495promoter 内 1010-1021 bp - 2980 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 3755475-3756114(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCGC
SmilChr05G003691 Chr05 NC_080391.1:50041541-50041552promoter 内 3555-3566 bp - 435 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 50033387-50041106(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGTT
SmilChr01G000315 Chr01 NC_080387.1:6072044-6072055promoter 内 3435-3446 bp + 555 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 6069699-6071489(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCAG
SmilChr01G001720 Chr01 NC_080387.1:31678878-31678889promoter 内 3314-3325 bp - 676 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 31669833-31678202(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGTT
SmilChr03G000912 Chr03 NC_080389.1:10435877-10435888promoter 内 2885-2896 bp + 1105 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 10436993-10445143(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAA
SmilChr02G001418 Chr02 NC_080388.1:26808592-26808603promoter 内 2829-2840 bp - 1161 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 26809764-26810826(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCGT
SmilChr05G003660 Chr05 NC_080391.1:49328981-49328992promoter 内 2588-2599 bp + 1402 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 49314170-49327579(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCGC
SmilChr05G001642 Chr05 NC_080391.1:15372965-15372976promoter 内 2551-2562 bp + 1439 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 15374415-15379375(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGAG
SmilChr03G000353 Chr03 NC_080389.1:3958045-3958056promoter 内 2484-2495 bp + 1506 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 3953502-3956539(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTCGA
SmilChr01G006097 Chr01 NC_080387.1:76439550-76439561promoter 内 2425-2436 bp + 1565 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 76441126-76445290(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGTT
SmilChr04G001403 Chr04 NC_080390.1:22837990-22838001promoter 内 2125-2136 bp + 1865 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 22839866-22841266(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTGGG
SmilChr06G002301 Chr06 NC_080392.1:33246430-33246441promoter 内 1726-1737 bp - 2264 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 33241591-33244166(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGTT
SmilChr05G003548 Chr05 NC_080391.1:47405343-47405354promoter 内 1688-1699 bp + 2302 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 47400519-47403041(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCGC
SmilChr04G001310 Chr04 NC_080390.1:20962871-20962882promoter 内 1086-1097 bp + 2904 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 20958065-20959967(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCGC
SmilChr08G000483 Chr08 NC_080394.1:3466248-3466259promoter 内 826-837 bp - 3164 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 3460001-3463084(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTGGT
SmilChr02G000422 Chr02 NC_080388.1:5415539-5415550promoter 内 459-470 bp + 3531 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 5410858-5412008(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCAC
SmilChr05G001770 Chr05 NC_080391.1:17409931-17409942promoter 内 455-466 bp - 3535 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 17404387-17406396(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTGTT
SmilChr02G001746 Chr02 NC_080388.1:32049437-32049448promoter 内 138-149 bp + 3852 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 32044164-32045585(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTCGC
SmilChr05G003549 Chr05 NC_080391.1:47405343-47405354promoter 内 85-96 bp + 3905 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 47409259-47409825(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTGTT
SmilChr05G004154 Chr05 NC_080391.1:55464124-55464135promoter 内 3913-3924 bp - 77 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 55462250-55464047(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAA
SmilChr08G001468 Chr08 NC_080394.1:11829476-11829487promoter 内 3813-3824 bp - 177 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 11829664-11830447(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCAC
SmilChr01G000165 Chr01 NC_080387.1:2733127-2733138promoter 内 3349-3360 bp + 641 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 2733779-2735810(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAA
SmilChr02G004876 Chr02 NC_080388.1:70842957-70842968promoter 内 3218-3229 bp - 772 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 70840325-70842185(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAA
SmilChr03G004712 Chr03 NC_080389.1:64375736-64375747promoter 内 3204-3215 bp + 786 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 64372608-64374950(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCAC
SmilChr02G002416 Chr02 NC_080388.1:42150838-42150849promoter 内 3142-3153 bp - 848 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 42149232-42149990(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAA
SmilChr03G002334 Chr03 NC_080389.1:36820164-36820175promoter 内 3115-3126 bp - 875 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 36817041-36819289(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAA
SmilChr01G000900 Chr01 NC_080387.1:19062092-19062103promoter 内 3086-3097 bp + 904 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 19063007-19063716(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTGGG
SmilChr03G004456 Chr03 NC_080389.1:62659816-62659827promoter 内 2884-2895 bp + 1106 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 62660933-62664423(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGAG
SmilChr01G005204 Chr01 NC_080387.1:69714151-69714162promoter 内 2822-2833 bp + 1168 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 69712303-69712983(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAA
SmilChr01G005213 Chr01 NC_080387.1:69741530-69741541promoter 内 2773-2784 bp + 1217 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 69742758-69744892(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGAA