转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 124 / 143 下载 TSV

上一页 124 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G000832 Chr06 NC_080392.1:7832858-7832869promoter 内 3831-3842 bp + 159 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 7833028-7842373(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAAAGCTGTA
SmilChr05G000263 Chr05 NC_080391.1:2007675-2007686promoter 内 3739-3750 bp + 251 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 2004175-2007424(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTTAA
SmilChr04G000883 Chr04 NC_080390.1:11265630-11265641promoter 内 3706-3717 bp + 284 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 11265925-11267310(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGTACAGCTGAT
SmilChr08G001583 Chr08 NC_080394.1:13082102-13082113promoter 内 3534-3545 bp - 456 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 13077532-13081646(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGAA
SmilChr07G002673 Chr07 NC_080393.1:26041964-26041975promoter 内 3530-3541 bp - 460 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 26037301-26041504(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCGA
SmilChr05G000739 Chr05 NC_080391.1:5637622-5637633promoter 内 3427-3438 bp - 563 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 5633526-5637059(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTGCG
SmilChr06G000833 Chr06 NC_080392.1:7832858-7832869promoter 内 3344-3355 bp + 646 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 7833515-7835643(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAAAGCTGTA
SmilChr02G003242 Chr02 NC_080388.1:53698993-53699004promoter 内 3292-3303 bp - 698 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 53699702-53702986(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCCG
SmilChr01G003112 Chr01 NC_080387.1:49925969-49925980promoter 内 3172-3183 bp + 818 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 49926798-49930025(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGAA
SmilChr01G000605 Chr01 NC_080387.1:13319207-13319218promoter 内 3068-3079 bp + 922 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 13320140-13320246(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGAA
SmilChr04G001881 Chr04 NC_080390.1:30715901-30715912promoter 内 3068-3079 bp + 922 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 30716834-30716940(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGAA
SmilChr04G001882 Chr04 NC_080390.1:30726620-30726631promoter 内 3068-3079 bp + 922 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 30727553-30727659(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGAA
SmilChr04G001889 Chr04 NC_080390.1:30841788-30841799promoter 内 3068-3079 bp + 922 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 30842721-30842827(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGAA
SmilChr04G001890 Chr04 NC_080390.1:30852836-30852847promoter 内 3068-3079 bp + 922 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 30853769-30853875(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGAA
SmilChr08G002597 Chr08 NC_080394.1:25303994-25304005promoter 内 3068-3079 bp + 922 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 25304927-25305033(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGAA
SmilChr05G000264 Chr05 NC_080391.1:2007675-2007686promoter 内 2921-2932 bp + 1069 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 2008755-2009910(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGAA
SmilChr01G001274 Chr01 NC_080387.1:25428464-25428475promoter 内 2890-2901 bp - 1100 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 25429575-25430228(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACCTGTCAA
SmilChr07G002924 Chr07 NC_080393.1:29626102-29626113promoter 内 2758-2769 bp - 1232 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 29621922-29624870(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCGA
SmilChr07G003470 Chr07 NC_080393.1:38831060-38831071promoter 内 2729-2740 bp - 1261 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 38829228-38829799(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTGCG
SmilChr01G001318 Chr01 NC_080387.1:26217657-26217668promoter 内 2725-2736 bp - 1265 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 26215736-26216392(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGAA
SmilChr06G001642 Chr06 NC_080392.1:18562485-18562496promoter 内 2690-2701 bp - 1300 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 18563796-18570273(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTTAA
SmilChr02G004561 Chr02 NC_080388.1:68121952-68121963promoter 内 2687-2698 bp - 1303 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 68123266-68124433(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTTAA
SmilChr05G003812 Chr05 NC_080391.1:51405423-51405434promoter 内 2668-2679 bp - 1322 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 51406756-51414878(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTTAA
SmilChr02G002486 Chr02 NC_080388.1:43281224-43281235promoter 内 2577-2588 bp - 1413 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 43282648-43284698(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACCTGTCAA
SmilChr02G003823 Chr02 NC_080388.1:59886428-59886439promoter 内 2539-2550 bp - 1451 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 59887890-59889453(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTTAA
SmilChr07G002244 Chr07 NC_080393.1:20597583-20597594promoter 内 2507-2518 bp - 1483 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 20599077-20601135(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTTAA
SmilChr02G005339 Chr02 NC_080388.1:74238817-74238828promoter 内 2447-2458 bp + 1543 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 74240371-74242892(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTAAT
SmilChr07G001342 Chr07 NC_080393.1:10378224-10378235promoter 内 2417-2428 bp - 1573 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 10379808-10384568(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTTAA
SmilChr08G002828 Chr08 NC_080394.1:28129402-28129413promoter 内 2396-2407 bp - 1594 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 28131007-28136192(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAACTGTCAA
SmilChr03G004129 Chr03 NC_080389.1:60126243-60126254promoter 内 2331-2342 bp - 1659 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 60127913-60132164(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCCT
SmilChr03G003195 Chr03 NC_080389.1:49448926-49448937promoter 内 2219-2230 bp - 1771 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 49447084-49447155(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTAACAGCTGAG
SmilChr05G002568 Chr05 NC_080391.1:28852892-28852903promoter 内 2092-2103 bp - 1898 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 28849769-28850994(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGAA
SmilChr04G001217 Chr04 NC_080390.1:19000683-19000694promoter 内 2027-2038 bp + 1963 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 18996105-18998720(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCGA
SmilChr07G001913 Chr07 NC_080393.1:16537861-16537872promoter 内 1988-1999 bp + 2002 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 16530812-16535859(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCCG
SmilChr03G003492 Chr03 NC_080389.1:53491556-53491567promoter 内 1929-1940 bp + 2061 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 53484523-53489495(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCGA
SmilChr01G003051 Chr01 NC_080387.1:49464562-49464573promoter 内 1806-1817 bp + 2184 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 49466757-49476130(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCAACAGCTGTT
SmilChr03G000151 Chr03 NC_080389.1:1633349-1633360promoter 内 1802-1813 bp + 2188 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 1635548-1637076(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCGA
SmilChr03G001824 Chr03 NC_080389.1:24982230-24982241promoter 内 1768-1779 bp - 2222 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 24984463-24988402(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTTGA
SmilChr07G004612 Chr07 NC_080393.1:58929046-58929057promoter 内 1736-1747 bp - 2254 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 58931311-58935241(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGCAGCTGTCGT
SmilChr05G003811 Chr05 NC_080391.1:51405423-51405434promoter 内 1711-1722 bp - 2279 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 51400181-51403144(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGAA
SmilChr08G003497 Chr08 NC_080394.1:37553115-37553126promoter 内 1677-1688 bp - 2313 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 37549233-37550802(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCGA
SmilChr08G003379 Chr08 NC_080394.1:35436304-35436315promoter 内 1620-1631 bp - 2370 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 35438685-35442221(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTACG
SmilChr05G004224 Chr05 NC_080391.1:56082436-56082447promoter 内 1566-1577 bp + 2424 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 56078659-56080012(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAACTGTCAA
SmilChr01G003283 Chr01 NC_080387.1:51523047-51523058promoter 内 1321-1332 bp + 2669 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 51525727-51528253(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGAA
SmilChr08G002779 Chr08 NC_080394.1:27491503-27491514promoter 内 1294-1305 bp - 2696 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 27494210-27497392(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTTAA
SmilChr06G000013 Chr06 NC_080392.1:216947-216958promoter 内 1282-1293 bp - 2708 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 219666-234840(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCCG
SmilChr01G002692 Chr01 NC_080387.1:45166075-45166086promoter 内 1275-1286 bp + 2715 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 45162758-45163360(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTTGC
SmilChr01G001044 Chr01 NC_080387.1:21689770-21689781promoter 内 1165-1176 bp + 2825 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 21684371-21686945(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACCTGTCAA
SmilChr07G001914 Chr07 NC_080393.1:16537861-16537872promoter 内 1144-1155 bp + 2846 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 16540718-16543809(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGGACAGCTCAT
SmilChr04G002628 Chr04 NC_080390.1:41688991-41689002promoter 内 1123-1134 bp + 2867 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 41691869-41691942(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGAA