转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因,每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 127 / 149 下载 TSV

上一页 127 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002179 Chr02 NC_080388.1:39014556-39014566promoter 内 3712-3722 bp + 279 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 39013190-39014277(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGTG
SmilChr01G002452 Chr01 NC_080387.1:42123741-42123751promoter 内 3710-3720 bp - 281 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 42122634-42123460(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATAGCTGTCT
SmilChr06G001331 Chr06 NC_080392.1:13816042-13816052promoter 内 3705-3715 bp + 286 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 13809811-13815756(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGGCAGCTGGG
SmilChr07G001270 Chr07 NC_080393.1:9757682-9757692promoter 内 3695-3705 bp + 296 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 9757988-9759086(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAT
SmilChr05G003094 Chr05 NC_080391.1:39266666-39266676promoter 内 3592-3602 bp - 399 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 39264198-39266267(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCC
SmilChr07G002303 Chr07 NC_080393.1:21324536-21324546promoter 内 3277-3287 bp + 714 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 21325260-21326419(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTAC
SmilChr04G002613 Chr04 NC_080390.1:41546740-41546750promoter 内 3242-3252 bp - 749 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 41547499-41550623(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCGGGT
SmilChr04G001431 Chr04 NC_080390.1:23345842-23345852promoter 内 3174-3184 bp + 817 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 23343883-23345025(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGGA
SmilChr03G001911 Chr03 NC_080389.1:26735944-26735954promoter 内 3016-3026 bp + 975 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 26736929-26737921(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCC
SmilChr06G000080 Chr06 NC_080392.1:593184-593194promoter 内 2997-3007 bp - 994 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 594188-600122(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGGCAGCTGGG
SmilChr06G002151 Chr06 NC_080392.1:29227040-29227050promoter 内 2997-3007 bp + 994 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 29228044-29229294(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCC
SmilChr04G001376 Chr04 NC_080390.1:22368116-22368126promoter 内 2899-2909 bp - 1092 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 22365800-22367024(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCC
SmilChr02G001456 Chr02 NC_080388.1:27239690-27239700promoter 内 2740-2750 bp - 1251 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 27237585-27238439(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCC
SmilChr05G001115 Chr05 NC_080391.1:9298832-9298842promoter 内 2656-2666 bp - 1335 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 9291872-9297497(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATAGCTGTCT
SmilChr02G004839 Chr02 NC_080388.1:70502558-70502568promoter 内 2598-2608 bp + 1393 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 70499630-70501165(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGGCAGCTGGG
SmilChr05G003055 Chr05 NC_080391.1:38348014-38348024promoter 内 2565-2575 bp + 1426 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 38349450-38350808(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCC
SmilChr01G004703 Chr01 NC_080387.1:65139557-65139567promoter 内 2471-2481 bp - 1520 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 65141087-65142196(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTATG
SmilChr07G000905 Chr07 NC_080393.1:6473510-6473520promoter 内 2452-2462 bp + 1539 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 6471899-6471971(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGGCAGCTGGG
SmilChr07G000904 Chr07 NC_080393.1:6473510-6473520promoter 内 2385-2395 bp + 1606 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 6469444-6471904(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGGCAGCTGGG
SmilChr03G001791 Chr03 NC_080389.1:24445741-24445751promoter 内 2383-2393 bp + 1608 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 24447359-24450249(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTAC
SmilChr01G005678 Chr01 NC_080387.1:73060535-73060545promoter 内 2341-2351 bp - 1650 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 73055593-73058885(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAT
SmilChr01G000456 Chr01 NC_080387.1:9329364-9329374promoter 内 2300-2310 bp - 1691 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 9331065-9334016(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGTG
SmilChr04G003975 Chr04 NC_080390.1:55224804-55224814promoter 内 2210-2220 bp + 1781 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 55221383-55223023(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGGCAGCTGGG
SmilChr03G002032 Chr03 NC_080389.1:30465131-30465141promoter 内 2118-2128 bp + 1873 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 30459959-30463258(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGTG
SmilChr07G002848 Chr07 NC_080393.1:28594245-28594255promoter 内 2046-2056 bp - 1945 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 28596200-28597471(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGGA
SmilChr07G002447 Chr07 NC_080393.1:23010183-23010193promoter 内 1947-1957 bp + 2044 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 23012237-23013514(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCC
SmilChr04G003631 Chr04 NC_080390.1:52816752-52816762promoter 内 1835-1845 bp + 2156 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 52818918-52822519(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATAGCTGTCT
SmilChr05G002900 Chr05 NC_080391.1:34837650-34837660promoter 内 1768-1778 bp - 2223 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 34839883-34840674(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCGGGT
SmilChr03G003232 Chr03 NC_080389.1:50132682-50132692promoter 内 1681-1691 bp - 2310 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 50127451-50130372(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCC
SmilChr01G005179 Chr01 NC_080387.1:69515750-69515760promoter 内 1554-1564 bp - 2437 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 69518197-69522787(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGGCAGCTGGG
SmilChr06G002071 Chr06 NC_080392.1:27321509-27321519promoter 内 1524-1534 bp + 2467 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 27323986-27327025(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCC
SmilChr01G000100 Chr01 NC_080387.1:1811558-1811568promoter 内 1435-1445 bp - 2556 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 1806014-1809002(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCC
SmilChr01G000099 Chr01 NC_080387.1:1802808-1802818promoter 内 1434-1444 bp - 2557 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 1797263-1800251(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCC
SmilChr05G001269 Chr05 NC_080391.1:10833601-10833611promoter 内 1430-1440 bp + 2561 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 10836172-10840484(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTAC
SmilChr01G004645 Chr01 NC_080387.1:64506386-64506396promoter 内 1333-1343 bp - 2658 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 64509054-64510628(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGTG
SmilChr06G000602 Chr06 NC_080392.1:5212571-5212581promoter 内 1189-1199 bp - 2802 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 5208694-5209769(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATAGCTGTCT
SmilChr07G001235 Chr07 NC_080393.1:9460712-9460722promoter 内 1164-1174 bp - 2827 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 9453819-9457885(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCCGCTGTCA
SmilChr01G001517 Chr01 NC_080387.1:29046146-29046156promoter 内 1153-1163 bp + 2838 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 29048994-29051927(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAT
SmilChr04G003474 Chr04 NC_080390.1:51199318-51199328promoter 内 1103-1113 bp - 2888 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 51192356-51196430(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTAC
SmilChr04G000916 Chr04 NC_080390.1:11921290-11921300promoter 内 1068-1078 bp + 2923 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 11914037-11918367(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGTG
SmilChr07G002301 Chr07 NC_080393.1:21324536-21324546promoter 内 1067-1077 bp + 2924 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 21319650-21321612(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGTG
SmilChr06G000755 Chr06 NC_080392.1:6997255-6997265promoter 内 1066-1076 bp - 2925 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 6990271-6994330(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCC
SmilChr07G001917 Chr07 NC_080393.1:16577080-16577090promoter 内 1062-1072 bp + 2929 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 16580019-16580101(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCCGCTGTCA
SmilChr06G000810 Chr06 NC_080392.1:7595753-7595763promoter 内 832-842 bp + 3159 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 7598922-7610826(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAT
SmilChr04G001144 Chr04 NC_080390.1:16857743-16857753promoter 内 779-789 bp - 3212 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 16860965-16865244(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGGA
SmilChr02G000401 Chr02 NC_080388.1:4951391-4951401promoter 内 774-784 bp + 3217 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 4954618-4957897(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCC
SmilChr06G002207 Chr06 NC_080392.1:30661854-30661864promoter 内 752-762 bp - 3239 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 30657473-30658615(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTAC
SmilChr05G000041 Chr05 NC_080391.1:193971-193981promoter 内 664-674 bp + 3327 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 197308-201104(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCC
SmilChr06G000982 Chr06 NC_080392.1:9592646-9592656promoter 内 659-669 bp + 3332 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 9595988-9599731(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTAC
SmilChr07G002513 Chr07 NC_080393.1:23819964-23819974promoter 内 654-664 bp + 3337 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 23812511-23816627(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGGA