转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G005502; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022202-RA_Salv SmilChr02G005502 bHLH XP_057792768.1 MP00082 TCACGTGG

可能结合的靶基因

9435 个结合位点 6784 个候选靶基因 第 131 / 136 下载 TSV

上一页 131 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001712 Chr01 NC_080387.1:31589356-31589363promoter 内 694-701 bp + 3300 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 31592663-31598105(+) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 TCACGTGT
SmilChr05G003924 Chr05 NC_080391.1:53016631-53016638promoter 内 694-701 bp - 3300 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 53002075-53013331(-) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 TCACGTGT
SmilChr06G002535 Chr06 NC_080392.1:36380839-36380846promoter 内 691-698 bp + 3303 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 36384149-36387621(+) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 TCACGTGT
SmilChr03G002196 Chr03 NC_080389.1:34581305-34581312promoter 内 685-692 bp - 3309 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 34577229-34577996(-) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 TCACGTGT
SmilChr06G001065 Chr06 NC_080392.1:10514336-10514343promoter 内 685-692 bp + 3309 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 10517652-10518255(+) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 TCACGTGT
SmilChr07G001677 Chr07 NC_080393.1:14220117-14220124promoter 内 683-690 bp + 3311 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 14216306-14216806(-) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 ACACGTGA
SmilChr05G002096 Chr05 NC_080391.1:21940556-21940563promoter 内 680-687 bp - 3314 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 21943877-21944811(+) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 ACACGTGA
SmilChr04G000991 Chr04 NC_080390.1:13588876-13588883promoter 内 679-686 bp - 3315 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 13584890-13585561(-) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 TCACGTGT
SmilChr02G000508 Chr02 NC_080388.1:6999839-6999846promoter 内 678-685 bp - 3316 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 6995906-6996523(-) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 TCACGTGT
SmilChr07G001372 Chr07 NC_080393.1:10643925-10643932promoter 内 678-685 bp - 3316 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 10639206-10640609(-) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 TCACGTGT
SmilChr02G003778 Chr02 NC_080388.1:59474650-59474657promoter 内 676-683 bp - 3318 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 59468707-59471332(-) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 TCACGTGT
SmilChr08G004494 Chr08 NC_080394.1:54576574-54576581promoter 内 675-682 bp - 3319 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 54572282-54573255(-) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 TCACGTGT
SmilChr04G000452 Chr04 NC_080390.1:4807357-4807364promoter 内 671-678 bp - 3323 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 4800931-4804034(-) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 TCACGTGT
SmilChr08G004948 Chr08 NC_080394.1:58359116-58359123promoter 内 668-675 bp - 3326 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 58352387-58355790(-) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 TCACGTGT
SmilChr02G002488 Chr02 NC_080388.1:43296484-43296491promoter 内 666-673 bp - 3328 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 43299819-43300526(+) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 ACACGTGA
SmilChr06G001801 Chr06 NC_080392.1:21179712-21179719promoter 内 658-665 bp + 3336 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 21183055-21184582(+) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 TCACGTGT
SmilChr05G003137 Chr05 NC_080391.1:39984808-39984815promoter 内 657-664 bp - 3337 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 39988152-39992600(+) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 ACACGTGA
SmilChr03G004224 Chr03 NC_080389.1:60797479-60797486promoter 内 656-663 bp - 3338 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 60791899-60794141(-) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 TCACGTGT
SmilChr05G001098 Chr05 NC_080391.1:9142126-9142133promoter 内 652-659 bp + 3342 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 9145475-9147912(+) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 TCACGTGT
SmilChr02G003305 Chr02 NC_080388.1:54316019-54316026promoter 内 649-656 bp + 3345 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 54311953-54312674(-) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 ACACGTGA
SmilChr02G005341 Chr02 NC_080388.1:74245067-74245074promoter 内 648-655 bp - 3346 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 74248420-74250670(+) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 ACACGTGA
SmilChr04G001040 Chr04 NC_080390.1:14815968-14815975promoter 内 644-651 bp + 3350 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 14811360-14812618(-) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 ACACGTGA
SmilChr03G000717 Chr03 NC_080389.1:7956180-7956187promoter 内 643-650 bp - 3351 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 7959538-7962296(+) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 ACACGTGA
SmilChr04G002905 Chr04 NC_080390.1:45327850-45327857promoter 内 638-645 bp + 3356 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 45323556-45324494(-) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 ACACGTGA
SmilChr06G002460 Chr06 NC_080392.1:35400129-35400136promoter 内 636-643 bp + 3358 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 35403494-35405565(+) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 TCACGTGT
SmilChr06G003149 Chr06 NC_080392.1:44513221-44513228promoter 内 630-637 bp + 3364 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 44505574-44509857(-) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 ACACGTGA
SmilChr06G001057 Chr06 NC_080392.1:10423800-10423807promoter 内 629-636 bp + 3365 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 10427172-10429471(+) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 TCACGTGT
SmilChr01G000858 Chr01 NC_080387.1:18481270-18481277promoter 内 627-634 bp + 3367 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 18484644-18491875(+) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 TCACGTGT
SmilChr08G002688 Chr08 NC_080394.1:26485623-26485630promoter 内 627-634 bp + 3367 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 26488997-26493972(+) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 TCACGTGT
SmilChr02G002857 Chr02 NC_080388.1:48775463-48775470promoter 内 626-633 bp - 3368 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 48768678-48772095(-) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 TCACGTGT
SmilChr07G000473 Chr07 NC_080393.1:3307597-3307604promoter 内 626-633 bp - 3368 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 3310972-3312363(+) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 ACACGTGA
SmilChr06G001238 Chr06 NC_080392.1:12821914-12821921promoter 内 625-632 bp + 3369 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 12766124-12818545(-) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 ACACGTGA
SmilChr06G002514 Chr06 NC_080392.1:36027070-36027077promoter 内 625-632 bp - 3369 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 36030446-36042247(+) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 ACACGTGA
SmilChr03G001820 Chr03 NC_080389.1:24845047-24845054promoter 内 622-629 bp + 3372 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 24848426-24858099(+) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 TCACGTGT
SmilChr04G001833 Chr04 NC_080390.1:29879025-29879032promoter 内 622-629 bp + 3372 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 29882404-29883489(+) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 TCACGTGT
SmilChr07G001364 Chr07 NC_080393.1:10555950-10555957promoter 内 621-628 bp - 3373 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 10551172-10552577(-) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 TCACGTGT
SmilChr06G002356 Chr06 NC_080392.1:34311258-34311265promoter 内 617-624 bp + 3377 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 34306879-34307881(-) SMil_00022202-RA_Salv MP00082 ACACGTGA
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