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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID 家族 基序 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002803; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族蛋白基序共识序列
SMil_00020702-RA_Salv SmilChr07G002803 NAC XP_057777238.1 MP00221 ACACGTAACTT

可能结合的靶基因

9903 个结合位点 7965 个候选靶基因 第 143 / 160 下载 TSV

上一页 143 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF 基序 匹配序列
SmilChr04G000808 Chr04 NC_080390.1:10120154-10120164promoter 内 1427-1437 bp + 2564 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 10114692-10117590(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CCTTTACGTGC
SmilChr03G004502 Chr03 NC_080389.1:63122432-63122442promoter 内 1246-1256 bp + 2745 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 63125187-63126134(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AAACGTAACCA
SmilChr01G001245 Chr01 NC_080387.1:24966953-24966963promoter 内 1223-1233 bp - 2768 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 24963532-24964185(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AAACGTAACCA
SmilChr03G004508 Chr03 NC_080389.1:63178835-63178845promoter 内 1200-1210 bp + 2791 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 63170609-63176044(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TGGTTACGTTT
SmilChr02G001898 Chr02 NC_080388.1:34278457-34278467promoter 内 791-801 bp + 3200 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 34271505-34275257(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GTCTTACGTGC
SmilChr03G003970 Chr03 NC_080389.1:58744373-58744383promoter 内 677-687 bp + 3314 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 58738563-58741059(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CCTTTACGTGC
SmilChr03G004649 Chr03 NC_080389.1:64041441-64041451promoter 内 663-673 bp - 3328 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 64035093-64038113(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AAACGTAACCA
SmilChr02G005204 Chr02 NC_080388.1:73296798-73296808promoter 内 643-653 bp - 3348 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 73290936-73293450(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AAACGTAACCA
SmilChr01G004619 Chr01 NC_080387.1:64202078-64202088promoter 内 595-605 bp - 3396 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 64205484-64206311(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GTCTTACGTGC
SmilChr01G000390 Chr01 NC_080387.1:8043233-8043243promoter 内 439-449 bp + 3552 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 8037282-8039681(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CCTTTACGTGC
SmilChr02G005206 Chr02 NC_080388.1:73296798-73296808promoter 内 232-242 bp - 3759 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 73300567-73302950(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TGGTTACGTTT
SmilChr01G001933 Chr01 NC_080387.1:34488101-34488111promoter 内 181-191 bp + 3810 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 34491921-34493051(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AAACGTAACCA
SmilChr01G004846 Chr01 NC_080387.1:66603447-66603457promoter 内 146-156 bp + 3845 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 66607302-66612035(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AAACGTAACCA
SmilChr05G002579 Chr05 NC_080391.1:29009454-29009464promoter 内 102-112 bp + 3889 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 29013353-29019046(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GCACGTAAAGG
SmilChr02G001719 Chr02 NC_080388.1:31643161-31643171promoter 内 93-103 bp + 3898 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 31638919-31639263(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CCTTTACGTGC
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SmilChr01G002664 Chr01 NC_080387.1:44877070-44877080promoter 内 2987-2997 bp + 1004 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 44872611-44876066(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCAATACGTGT
SmilChr03G003051 Chr03 NC_080389.1:47411609-47411619promoter 内 3923-3933 bp + 68 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 47410249-47411541(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCAATACGTGT
SmilChr05G001315 Chr05 NC_080391.1:11320630-11320640promoter 内 3773-3783 bp + 218 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 11320858-11323001(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATTGA
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SmilChr01G003302 Chr01 NC_080387.1:51703489-51703499promoter 内 3653-3663 bp - 338 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 51701491-51703151(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATTGA
SmilChr04G003951 Chr04 NC_080390.1:55077835-55077845promoter 内 3414-3424 bp + 577 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 55075070-55077258(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCAATACGTGT
SmilChr04G003544 Chr04 NC_080390.1:51801021-51801031promoter 内 3299-3309 bp + 692 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 51798806-51800329(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCAATACGTGT
SmilChr03G002850 Chr03 NC_080389.1:45091649-45091659promoter 内 3079-3089 bp + 912 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 45092571-45093170(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATTGA
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SmilChr02G000492 Chr02 NC_080388.1:6742281-6742291promoter 内 2642-2652 bp - 1349 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 6740582-6740932(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATGGC
SmilChr02G005578 Chr02 NC_080388.1:75628195-75628205promoter 内 2568-2578 bp + 1423 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 75626038-75626772(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCAATACGTGT
SmilChr02G004456 Chr02 NC_080388.1:66974497-66974507promoter 内 2438-2448 bp - 1553 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 66976060-66978911(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCAATACGTGT
SmilChr01G002951 Chr01 NC_080387.1:48396495-48396505promoter 内 2304-2314 bp - 1687 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 48389141-48394808(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATTGA
SmilChr05G002166 Chr05 NC_080391.1:22926023-22926033promoter 内 2237-2247 bp + 1754 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 22923702-22924269(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GCCATACGTGT
SmilChr02G000491 Chr02 NC_080388.1:6742281-6742291promoter 内 2228-2238 bp - 1763 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 6738437-6740518(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATGGC
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SmilChr04G000891 Chr04 NC_080390.1:11430702-11430712promoter 内 587-597 bp + 3404 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 11425226-11427298(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GCATTACGTGG
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SmilChr03G004661 Chr03 NC_080389.1:64088366-64088376promoter 内 349-359 bp - 3642 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 64092018-64096693(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCAATACGTGT
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SmilChr01G005786 Chr01 NC_080387.1:73945877-73945887promoter 内 3558-3568 bp - 433 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 2 73946320-73951969(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CTCATACGTGT
SmilChr01G005270 Chr01 NC_080387.1:70131558-70131568promoter 内 3496-3506 bp - 495 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 2 70132063-70133235(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TATATACGTGT
SmilChr04G003757 Chr04 NC_080390.1:53834507-53834517promoter 内 3037-3047 bp - 954 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 2 53835471-53836402(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TATATACGTGT
SmilChr03G003770 Chr03 NC_080389.1:56845572-56845582promoter 内 2674-2684 bp - 1317 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 2 56836499-56844255(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATATA