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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID 家族 基序 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G005433; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族蛋白基序共识序列
SMil_00021978-RA_Salv SmilChr02G005433 WRKY XP_057792682.1 MP00209 CGTTGACTTTTTTTAACAT

可能结合的靶基因

9910 个结合位点 8083 个候选靶基因 第 152 / 162 下载 TSV

上一页 152 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF 基序 匹配序列
SmilChr05G003612 Chr05 NC_080391.1:48196363-48196381promoter 内 792-810 bp + 3191 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 48199572-48200633(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTTGCAATAGAAC
SmilChr04G001885 Chr04 NC_080390.1:30792048-30792066promoter 内 789-807 bp - 3194 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 30795260-30796475(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GTCGAGATTATAGTCAACA
SmilChr06G000287 Chr06 NC_080392.1:1972661-1972679promoter 内 789-807 bp + 3194 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 1966480-1969467(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CCCACTTTCAAAGTCAAAG
SmilChr04G003323 Chr04 NC_080390.1:49968600-49968618promoter 内 785-803 bp + 3198 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 49971816-49973336(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTAACGGTGAGAA
SmilChr03G001739 Chr03 NC_080389.1:23479902-23479920promoter 内 780-798 bp - 3203 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 23483123-23487206(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GTTCTATTGCAAGTCAACT
SmilChr04G002376 Chr04 NC_080390.1:38278836-38278854promoter 内 768-786 bp - 3215 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 38263081-38275621(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTAGTGCGCCACG
SmilChr03G003811 Chr03 NC_080389.1:57162566-57162584promoter 内 754-772 bp - 3229 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 57156463-57159337(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CTTTGACTTTTTTTTTTTT
SmilChr05G000163 Chr05 NC_080391.1:1301488-1301506promoter 内 752-770 bp + 3231 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 1295249-1298257(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGGAATGATCAAGTCAAAG
SmilChr05G003684 Chr05 NC_080391.1:49975606-49975624promoter 内 745-763 bp + 3238 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 49972262-49972368(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GCTTGGGACTTAGTCAACA
SmilChr04G000775 Chr04 NC_080390.1:9492766-9492784promoter 内 744-762 bp - 3239 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 9496023-9496129(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GCTTGGGACTTAGTCAACA
SmilChr05G003751 Chr05 NC_080391.1:50643091-50643109promoter 内 744-762 bp + 3239 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 50639746-50639852(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GCTTGGGACTTAGTCAACA
SmilChr02G002412 Chr02 NC_080388.1:42092080-42092098promoter 内 714-732 bp + 3269 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 42088118-42088811(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GAAACTGAAGTAGTCAACA
SmilChr01G003973 Chr01 NC_080387.1:58169996-58170014promoter 内 702-720 bp + 3281 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 58164188-58166715(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TTAATTAAATAAGTCAACT
SmilChr05G004287 Chr05 NC_080391.1:56651931-56651949promoter 内 695-713 bp + 3288 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 56648571-56648643(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 ACAAAAAAAAAAGTCAAAG
SmilChr07G001156 Chr07 NC_080393.1:8668234-8668252promoter 内 673-691 bp - 3310 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 8654472-8664924(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTAACGGTAGCAA
SmilChr01G005600 Chr01 NC_080387.1:72597362-72597380promoter 内 672-690 bp - 3311 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 72593891-72594051(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CTTTGACTTTGAAAGTGGG
SmilChr03G004116 Chr03 NC_080389.1:60052641-60052659promoter 内 671-689 bp + 3312 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 60055971-60059573(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTTGTATGAGAAT
SmilChr02G005031 Chr02 NC_080388.1:72029482-72029500promoter 内 661-679 bp + 3322 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 72032822-72037578(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTCAGCTGAAGAG
SmilChr04G002590 Chr04 NC_080390.1:41327668-41327686promoter 内 661-679 bp - 3322 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 41321268-41324346(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTGATTTCATACA
SmilChr03G001291 Chr03 NC_080389.1:15127990-15128008promoter 内 650-668 bp + 3333 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 15123689-15124657(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TTGCAGAAACAAGTCAAAG
SmilChr05G000643 Chr05 NC_080391.1:4888484-4888502promoter 内 629-647 bp + 3354 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 4884186-4885130(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CCCACTTTCAAAGTCAAAG
SmilChr03G000702 Chr03 NC_080389.1:7836857-7836875promoter 内 627-645 bp - 3356 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 7840231-7841332(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CCCACTTTCAAAGTCAAAG
SmilChr05G000243 Chr05 NC_080391.1:1850264-1850282promoter 内 617-635 bp - 3366 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 1853648-1854834(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGGAATGATCAAGTCAAAG
SmilChr03G001386 Chr03 NC_080389.1:16371505-16371523promoter 内 614-632 bp - 3369 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 16374892-16384279(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CTGAGGAGTGTGGTCAACG
SmilChr01G004315 Chr01 NC_080387.1:61334038-61334056promoter 内 593-611 bp - 3390 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 61326946-61330648(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTACCGCCTTGTT
SmilChr04G001667 Chr04 NC_080390.1:27634894-27634912promoter 内 580-598 bp + 3403 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 27638315-27644091(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTCCCCCGGGGAT
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SmilChr01G005188 Chr01 NC_080387.1:69585748-69585766promoter 内 547-565 bp - 3436 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 69589202-69590147(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CCCACTTTCAAAGTCAAAG
SmilChr02G000592 Chr02 NC_080388.1:8484293-8484311promoter 内 535-553 bp - 3448 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 8471205-8480845(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 AGTTGACTTGCAATAGAAC
SmilChr03G002135 Chr03 NC_080389.1:33236798-33236816promoter 内 526-544 bp + 3457 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 33231916-33233341(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TACGGAAACCTAGTCAACA
SmilChr01G002677 Chr01 NC_080387.1:44986427-44986445promoter 内 524-542 bp + 3459 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 44979716-44982968(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CTATCCAGAAAAGTCAAAG
SmilChr07G001618 Chr07 NC_080393.1:13561137-13561155promoter 内 516-534 bp - 3467 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 13564622-13565894(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TAATAAAAATAAGTCAACA
SmilChr07G004013 Chr07 NC_080393.1:51213519-51213537promoter 内 500-518 bp + 3483 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 51209464-51210036(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TAGAGCTATGCAGTCAACG
SmilChr01G001302 Chr01 NC_080387.1:25937070-25937088promoter 内 478-496 bp + 3505 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 25929596-25933565(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CCCACTTTCAAAGTCAAAG
SmilChr08G000632 Chr08 NC_080394.1:4722080-4722098promoter 内 476-494 bp + 3507 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 4725605-4732200(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTACGGCTTAATG
SmilChr07G004117 Chr07 NC_080393.1:52851320-52851338promoter 内 456-474 bp + 3527 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 52846528-52847793(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TTATTCACATGAGTCAACA
SmilChr01G000758 Chr01 NC_080387.1:16645954-16645972promoter 内 455-473 bp - 3528 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 16649500-16652729(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGGTTTGCCAAAGTCAAAA
SmilChr01G003220 Chr01 NC_080387.1:50967890-50967908promoter 内 426-444 bp - 3557 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 50971465-50972430(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 CTCCAATTCAGAGTCAACA
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SmilChr02G004195 Chr02 NC_080388.1:64285250-64285268promoter 内 402-420 bp + 3581 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 64288849-64296311(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GGTTGACTTCTGCATCTTT
SmilChr06G002423 Chr06 NC_080392.1:34979362-34979380promoter 内 388-406 bp - 3595 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 34971203-34975767(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TGTTGACTTTTCTTTCTGT
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SmilChr03G001247 Chr03 NC_080389.1:14376092-14376110promoter 内 296-314 bp + 3687 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 14370154-14372405(-) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 GTTTCTAGCGCAGTCAACA
SmilChr04G000058 Chr04 NC_080390.1:522429-522447promoter 内 292-310 bp - 3691 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 526138-528555(+) SMil_00021978-RA_Salv MP00209 TCTGTTTGACCGGTCAACG