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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G002885; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022980-RA_Salv SmilChr01G002885 ERF XP_057767601.1 MP00151 ATGGACGGTGGAGG

可能结合的靶基因

9976 个结合位点 6907 个候选靶基因 第 17 / 139 下载 TSV

上一页 17 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001418 Chr03 NC_080389.1:16814412-16814425promoter 内 2710-2723 bp - 1278 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 16815703-16820610(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCACCACCGTCCTG
SmilChr01G003440 Chr01 NC_080387.1:52992920-52992933promoter 内 2467-2480 bp - 1521 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 52988922-52991399(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CAGGACGGTGGTGG
SmilChr02G003818 Chr02 NC_080388.1:59809160-59809173promoter 内 1679-1692 bp + 2309 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 59811482-59814508(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGGCGGTGGAAG
SmilChr01G003441 Chr01 NC_080387.1:52992920-52992933promoter 内 1152-1165 bp - 2836 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 52995769-52998000(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCACCACCGTCCTG
SmilChr03G001419 Chr03 NC_080389.1:16814412-16814425promoter 内 1126-1139 bp - 2862 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 16817287-16817412(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCACCACCGTCCTG
SmilChr02G001720 Chr02 NC_080388.1:31648414-31648427promoter 内 1103-1116 bp + 2885 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 31651312-31654382(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACGGTCGGTGGAGG
SmilChr02G000481 Chr02 NC_080388.1:6592159-6592172promoter 内 851-864 bp + 3137 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 6587847-6589022(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCGTCGCCGTCCAA
SmilChr02G004706 Chr02 NC_080388.1:69356571-69356584promoter 内 559-572 bp + 3429 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 69351219-69353142(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CTTCCACCGCCCAC
SmilChr06G001107 Chr06 NC_080392.1:11181614-11181627promoter 内 478-491 bp + 3510 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 11173743-11178104(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCACCACCGTCCTT
SmilChr06G003101 Chr06 NC_080392.1:43861814-43861827promoter 内 3540-3553 bp - 448 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 43862275-43864791(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCTCCACCGGCCTC
SmilChr01G001464 Chr01 NC_080387.1:28441178-28441191promoter 内 3432-3445 bp - 556 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 28438186-28440622(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TTGGACGGCGACGC
SmilChr05G002653 Chr05 NC_080391.1:30023786-30023799promoter 内 3413-3426 bp + 575 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 30024374-30025526(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCGGACGGTGGAGC
SmilChr05G004111 Chr05 NC_080391.1:54958781-54958794promoter 内 3350-3363 bp + 638 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 54956469-54958143(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCGTCACCGTCAAC
SmilChr05G001840 Chr05 NC_080391.1:18461468-18461481promoter 内 3104-3117 bp - 884 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 18462365-18467725(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCGTCGCCGTCCAA
SmilChr05G004395 Chr05 NC_080391.1:57373368-57373381promoter 内 2995-3008 bp - 993 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 57374374-57374445(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCGACGCCGTCCAC
SmilChr04G002694 Chr04 NC_080390.1:42379334-42379347promoter 内 2893-2906 bp + 1095 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 42376747-42378239(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CTCCCACCGTCCTC
SmilChr06G001924 Chr06 NC_080392.1:23323033-23323046promoter 内 2754-2767 bp + 1234 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 23318666-23321799(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCTCCACCGTCCGC
SmilChr05G001734 Chr05 NC_080391.1:16748676-16748689promoter 内 2468-2481 bp - 1520 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 16750209-16751354(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCTCCTCCGTCCAT
SmilChr03G004101 Chr03 NC_080389.1:59903593-59903606promoter 内 2440-2453 bp + 1548 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 59905154-59908956(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGGCGGTGGAAG
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SmilChr04G003371 Chr04 NC_080390.1:50280972-50280985promoter 内 2185-2198 bp - 1803 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 50276014-50279169(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CAGGACGGTGGTGG
SmilChr04G001503 Chr04 NC_080390.1:24642791-24642804promoter 内 2099-2112 bp - 1889 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 24644693-24647729(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCTCCTCCGTCCAT
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SmilChr03G000471 Chr03 NC_080389.1:5030727-5030740promoter 内 1803-1816 bp + 2185 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 5025100-5028542(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCTCCACCGTCCGC
SmilChr06G003232 Chr06 NC_080392.1:45042621-45042634promoter 内 1477-1490 bp + 2511 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 45045145-45046190(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGCGGTTC
SmilChr05G000811 Chr05 NC_080391.1:6337292-6337305promoter 内 1286-1299 bp - 2702 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 6334518-6334590(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGCGTCGA
SmilChr02G005467 Chr02 NC_080388.1:74964470-74964483promoter 内 1224-1237 bp - 2764 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 74959871-74961706(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGCGTCGA
SmilChr03G003082 Chr03 NC_080389.1:47872137-47872150promoter 内 776-789 bp - 3212 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 47867970-47868925(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGCGGTTC
SmilChr01G001061 Chr01 NC_080387.1:21921037-21921050promoter 内 290-303 bp - 3698 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 21924748-21926213(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GAACCGCCGTCCAC
SmilChr04G003372 Chr04 NC_080390.1:50280972-50280985promoter 内 188-201 bp - 3800 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 50284785-50286515(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCACCACCGTCCTG
SmilChr06G003102 Chr06 NC_080392.1:43861814-43861827promoter 内 177-190 bp - 3811 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 43865638-43871940(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCTCCACCGGCCTC
SmilChr07G001004 Chr07 NC_080393.1:7311325-7311338promoter 内 62-75 bp + 3926 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 7315264-7319318(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GAGGACGGTGGGAG
SmilChr02G001342 Chr02 NC_080388.1:24999138-24999151promoter 内 2891-2904 bp - 1097 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 24995595-24998041(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GGGGCCGGTGGAGA
SmilChr02G001343 Chr02 NC_080388.1:24999138-24999151promoter 内 1705-1718 bp - 2283 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 25001434-25004211(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCTCCACCGGCCCC
SmilChr06G002301 Chr06 NC_080392.1:33244379-33244392promoter 内 3775-3788 bp + 213 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 33241591-33244166(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CGGCCGCCGTCCAG
SmilChr03G001401 Chr03 NC_080389.1:16613222-16613235promoter 内 2991-3004 bp - 997 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 16611364-16612225(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCGGACGGTGGCTG
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SmilChr03G002822 Chr03 NC_080389.1:44713347-44713360promoter 内 1574-1587 bp - 2414 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 44709761-44710933(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCGGACGGTGGCTG
SmilChr01G000766 Chr01 NC_080387.1:16794861-16794874promoter 内 1359-1372 bp - 2629 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 16797503-16798633(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CGGCCGCCGTCCAG
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SmilChr02G005231 Chr02 NC_080388.1:73511721-73511734promoter 内 542-555 bp + 3446 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 73504800-73508275(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACTCCACCGCCCAC
SmilChr03G000452 Chr03 NC_080389.1:4839530-4839543promoter 内 443-456 bp + 3545 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 4831555-4835985(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCGCCACCGTCAAG
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SmilChr01G003213 Chr01 NC_080387.1:50911142-50911155promoter 内 3744-3757 bp - 244 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 50903496-50910898(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGGCGGTGGAGC
SmilChr03G002057 Chr03 NC_080389.1:31331965-31331978promoter 内 3270-3283 bp - 718 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 31332696-31333860(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CGGGCGCCGTCCAC
SmilChr01G003992 Chr01 NC_080387.1:58350010-58350023promoter 内 2697-2710 bp - 1291 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 58345415-58348719(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGGCGGTGGAGC
SmilChr01G000648 Chr01 NC_080387.1:14469588-14469601promoter 内 2680-2693 bp - 1308 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 14465091-14468280(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGCGCCCG
SmilChr02G004400 Chr02 NC_080388.1:66346022-66346035promoter 内 2350-2363 bp + 1638 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 66341746-66344384(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCTCCACCGCCCAT