转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G003267; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00018221-RA_Salv SmilChr08G003267 MYB XP_057779249.1 MP00406 AAAAAATTAGGTAAA

可能结合的靶基因

9917 个结合位点 7839 个候选靶基因 第 18 / 157 下载 TSV

上一页 18 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000305 Chr03 NC_080389.1:3483568-3483582promoter 内 1150-1164 bp - 2837 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 3475239-3480731(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTTAAATTAGGTAAG
SmilChr01G000494 Chr01 NC_080387.1:10070477-10070491promoter 内 965-979 bp - 3022 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 10073513-10076671(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTTACCTAATTATGA
SmilChr04G000821 Chr04 NC_080390.1:10323950-10323964promoter 内 863-877 bp - 3124 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 10317787-10320826(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GAATTATTAGGTAAG
SmilChr05G000158 Chr05 NC_080391.1:1269663-1269677promoter 内 635-649 bp + 3352 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 1264266-1266311(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CACACCTAATTTTTC
SmilChr04G004123 Chr04 NC_080390.1:56081949-56081963promoter 内 541-555 bp + 3446 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 56085409-56088068(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTAAAATTAGGTAAT
SmilChr05G002206 Chr05 NC_080391.1:23519782-23519796promoter 内 441-455 bp - 3546 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 23523342-23525067(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ACTACCTAATTTTGG
SmilChr02G001280 Chr02 NC_080388.1:23643900-23643914promoter 内 437-451 bp - 3550 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 23639688-23640350(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AAAATATTAGGTATC
SmilChr02G004105 Chr02 NC_080388.1:63348446-63348460promoter 内 218-232 bp + 3769 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 63352229-63361209(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CTATAGTTAGGTAAA
SmilChr03G004416 Chr03 NC_080389.1:62327198-62327212promoter 内 113-127 bp - 3874 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 62320607-62323324(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GAGATGTTAGGTAGA
SmilChr02G002380 Chr02 NC_080388.1:41711609-41711623promoter 内 480-494 bp - 3507 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 3 41706311-41708102(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GGAAAATTAGGTCTA
SmilChr03G000573 Chr03 NC_080389.1:6237296-6237310promoter 内 20-34 bp + 3967 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 3 6232208-6233329(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GATACCTAACATTTT
SmilChr02G004526 Chr02 NC_080388.1:67858027-67858041promoter 内 3606-3620 bp - 381 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 67842087-67857646(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CGAAAATTAGGTACT
SmilChr01G003415 Chr01 NC_080387.1:52791799-52791813promoter 内 2390-2404 bp + 1597 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 52787901-52790202(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTTACCTAATTAACT
SmilChr05G001937 Chr05 NC_080391.1:19722583-19722597promoter 内 2218-2232 bp - 1769 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 19724366-19724698(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TATACCTAACTTCCA
SmilChr04G001149 Chr04 NC_080390.1:16961020-16961034promoter 内 2179-2193 bp + 1808 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 16962842-16969801(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AACAAATTAGGTAAC
SmilChr02G004307 Chr02 NC_080388.1:65451873-65451887promoter 内 2076-2090 bp + 1911 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 65445620-65449962(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AATACCTAATTTTAC
SmilChr01G003480 Chr01 NC_080387.1:53361087-53361101promoter 内 1415-1429 bp + 2572 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 53356289-53358515(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTTACCTAATTAACT
SmilChr02G004308 Chr02 NC_080388.1:65451873-65451887promoter 内 1388-1402 bp + 2599 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 65454486-65460577(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GTAAAATTAGGTATT
SmilChr02G002683 Chr02 NC_080388.1:46482516-46482530promoter 内 792-806 bp + 3195 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 46474207-46479321(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AGTACCTAATTTTCG
SmilChr03G000574 Chr03 NC_080389.1:6237296-6237310promoter 内 359-373 bp + 3628 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 6240938-6243384(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AAAATGTTAGGTATC
SmilChr01G005602 Chr01 NC_080387.1:72597157-72597171promoter 内 3784-3798 bp + 203 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 72596794-72596954(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TCGACCTAATTTATC
SmilChr01G001950 Chr01 NC_080387.1:34720860-34720874promoter 内 3678-3692 bp - 309 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 34721183-34724427(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GATACCTAACATTTT
SmilChr03G000361 Chr03 NC_080389.1:4041804-4041818promoter 内 3672-3686 bp + 315 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 4040456-4041489(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GTTACCTAATTTAAT
SmilChr02G003144 Chr02 NC_080388.1:52448346-52448360promoter 内 2944-2958 bp - 1043 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 52444223-52447303(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AATATATTAGGTATA
SmilChr01G005601 Chr01 NC_080387.1:72597157-72597171promoter 内 2844-2858 bp + 1143 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 72595894-72596014(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TCGACCTAATTTATC
SmilChr05G002217 Chr05 NC_080391.1:23661473-23661487promoter 内 2381-2395 bp + 1606 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 23663093-23664973(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TATTAATTAGGTAAG
SmilChr03G003813 Chr03 NC_080389.1:57170451-57170465promoter 内 2324-2338 bp - 1663 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 57166094-57168788(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CATAAATTAGGTCAA
SmilChr05G000910 Chr05 NC_080391.1:7220723-7220737promoter 内 2313-2327 bp + 1674 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 7222411-7228531(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CCATAATTAGGTAGA
SmilChr04G000621 Chr04 NC_080390.1:7039742-7039756promoter 内 2294-2308 bp + 1693 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 7037654-7038049(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GTCACCTAATTTTTT
SmilChr01G000162 Chr01 NC_080387.1:2699876-2699890promoter 内 2006-2020 bp - 1981 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 2701871-2702522(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AGTACCTAATTTTCG
SmilChr01G004453 Chr01 NC_080387.1:62655324-62655338promoter 内 1946-1960 bp + 2041 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 62657379-62661525(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AAGAAATTAGGTCTG
SmilChr04G001601 Chr04 NC_080390.1:26695406-26695420promoter 内 1649-1663 bp + 2338 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 26688064-26693068(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TATACCTAACATTCC
SmilChr04G003737 Chr04 NC_080390.1:53683642-53683656promoter 内 1558-1572 bp + 2429 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 53674703-53681213(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TATACCTAATATATT
SmilChr02G001181 Chr02 NC_080388.1:21700687-21700701promoter 内 1535-1549 bp - 2452 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 21703153-21705194(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATTACCTAACTTTGA
SmilChr04G001134 Chr04 NC_080390.1:16666690-16666704promoter 内 1456-1470 bp + 2531 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 16662915-16664159(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATTACCTAACTTTGA
SmilChr02G003876 Chr02 NC_080388.1:60816970-60816984promoter 内 1406-1420 bp - 2581 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 60812787-60814389(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ACTAAATTAGGTAAC
SmilChr04G003794 Chr04 NC_080390.1:54130035-54130049promoter 内 1288-1302 bp - 2699 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 54125337-54127336(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AATATATTAGGTATA
SmilChr04G001125 Chr04 NC_080390.1:16314074-16314088promoter 内 1278-1292 bp + 2709 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 16308418-16311365(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATTACCTAACTTTGA
SmilChr03G003262 Chr03 NC_080389.1:50538953-50538967promoter 内 1204-1218 bp - 2783 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 50541750-50544835(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TATACCTAATATATT
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SmilChr01G000444 Chr01 NC_080387.1:9022024-9022038promoter 内 698-712 bp - 3289 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 9018391-9018735(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTAAAGTTAGGTAAT
SmilChr02G005241 Chr02 NC_080388.1:73584427-73584441promoter 内 425-439 bp + 3562 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 73577522-73580865(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TATACCTAATATATT
SmilChr05G000384 Chr05 NC_080391.1:2901861-2901875promoter 内 291-305 bp + 3696 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 2891822-2898165(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TATACCTAATTAATC
SmilChr03G000360 Chr03 NC_080389.1:4041804-4041818promoter 内 126-140 bp + 3861 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 4027312-4037943(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GTTACCTAATTTAAT
SmilChr05G001207 Chr05 NC_080391.1:10150562-10150576promoter 内 3634-3648 bp + 353 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 10150929-10152754(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATATAGTTAGGTATG
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SmilChr01G003803 Chr01 NC_080387.1:56419690-56419704promoter 内 2512-2526 bp - 1475 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 56415007-56418215(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTATAGTTAGGTAAA
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SmilChr02G005163 Chr02 NC_080388.1:72964455-72964469promoter 内 1541-1555 bp + 2446 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 72966915-72976046(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ACAAAATTAGGTGAA
SmilChr02G005280 Chr02 NC_080388.1:73841876-73841890promoter 内 58-72 bp + 3929 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 73845819-73847714(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GATTAATTAGGTATG