转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G002503; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027448-RA_Salv SmilChr03G002503 MYB XP_057801356.1 MP00482 AAAATATGACCGTTG

可能结合的靶基因

8940 个结合位点 6899 个候选靶基因 第 20 / 138 下载 TSV

上一页 20 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G000909 Chr04 NC_080390.1:11841151-11841165promoter 内 1043-1057 bp + 2944 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 11844109-11844663(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAAATTTGACCGTTT
SmilChr06G000796 Chr06 NC_080392.1:7473307-7473321promoter 内 990-1004 bp + 2997 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 7476318-7476410(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 ACACTCTGACCGTTG
SmilChr06G002893 Chr06 NC_080392.1:41775171-41775185promoter 内 941-955 bp + 3046 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 41771088-41772125(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTTCGTTTTC
SmilChr02G004487 Chr02 NC_080388.1:67380159-67380173promoter 内 928-942 bp + 3059 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 67375579-67377100(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCCAAAATC
SmilChr07G003806 Chr07 NC_080393.1:46912801-46912815promoter 内 924-938 bp + 3063 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 46906777-46909738(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTAAAAAATG
SmilChr02G001342 Chr02 NC_080388.1:25001252-25001266promoter 内 776-790 bp + 3211 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 24995595-24998041(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAACGGTCAAATTTT
SmilChr01G003357 Chr01 NC_080387.1:52323049-52323063promoter 内 761-775 bp + 3226 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 52318677-52319823(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCACGAGTT
SmilChr01G003642 Chr01 NC_080387.1:54925173-54925187promoter 内 592-606 bp - 3395 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 54919370-54921778(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AATTTGCAACCGTTG
SmilChr01G000028 Chr01 NC_080387.1:545782-545796promoter 内 569-583 bp + 3418 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 541403-542364(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTAATCATTC
SmilChr01G001042 Chr01 NC_080387.1:21652879-21652893promoter 内 473-487 bp - 3514 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 21649024-21649365(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TATTAATGACCGTTA
SmilChr06G000797 Chr06 NC_080392.1:7473307-7473321promoter 内 434-448 bp + 3553 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 7476874-7476964(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 ACACTCTGACCGTTG
SmilChr04G004018 Chr04 NC_080390.1:55438799-55438813promoter 内 401-415 bp + 3586 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 55434285-55435213(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTTAACTATT
SmilChr01G002193 Chr01 NC_080387.1:38097839-38097853promoter 内 389-403 bp + 3598 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 38101451-38103341(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAAATTTGACCGTTT
SmilChr02G005022 Chr02 NC_080388.1:71983621-71983635promoter 内 261-275 bp + 3726 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 71978069-71979895(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCGATTATG
SmilChr01G004189 Chr01 NC_080387.1:60339339-60339353promoter 内 116-130 bp - 3871 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 60343224-60344979(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAACGGTCGGTATTT
SmilChr08G003952 Chr08 NC_080394.1:47312551-47312565promoter 内 96-110 bp - 3891 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 47301100-47308660(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAAACACGACCGTTA
SmilChr03G001094 Chr03 NC_080389.1:12642416-12642430promoter 内 937-951 bp - 3050 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 5 12638388-12639366(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AGTTCTTGACCGTTG
SmilChr07G003735 Chr07 NC_080393.1:45498563-45498577promoter 内 673-687 bp - 3314 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 5 45494054-45495249(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AGTTCTTGACCGTTG
SmilChr05G002546 Chr05 NC_080391.1:28503593-28503607promoter 内 1536-1550 bp - 2451 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 4 28497621-28501142(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAAATCCTACCGTTG
SmilChr05G002556 Chr05 NC_080391.1:28696906-28696920promoter 内 1515-1529 bp - 2472 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 4 28690889-28694434(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAAATCCTACCGTTG
SmilChr01G002667 Chr01 NC_080387.1:44895000-44895014promoter 内 3957-3971 bp - 30 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 44886469-44894970(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TCATGATGACCGTTG
SmilChr03G001334 Chr03 NC_080389.1:15579318-15579332promoter 内 3944-3958 bp - 43 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 15576933-15579275(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AATTCCTGACCGTTA
SmilChr03G000630 Chr03 NC_080389.1:6955804-6955818promoter 内 3152-3166 bp - 835 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 6956653-6960213(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCAAGAACT
SmilChr07G001847 Chr07 NC_080393.1:15992144-15992158promoter 内 618-632 bp - 3369 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 15986068-15988775(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AATATTCAACCGTTG
SmilChr04G000957 Chr04 NC_080390.1:12673635-12673649promoter 内 3035-3049 bp - 952 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 12674601-12675732(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCCGATTGA
SmilChr03G000053 Chr03 NC_080389.1:519326-519340promoter 内 2573-2587 bp + 1414 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 520754-524608(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 GAAAATGGACCGTTA
SmilChr07G004686 Chr07 NC_080393.1:59803042-59803056promoter 内 2553-2567 bp + 1434 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 59804490-59807264(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CTGAATTGACCGTTG
SmilChr04G000920 Chr04 NC_080390.1:11977382-11977396promoter 内 1600-1614 bp - 2387 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 11970954-11974995(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TCAATCGGACCGTTG
SmilChr05G001725 Chr05 NC_080391.1:16557913-16557927promoter 内 726-740 bp - 3261 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 16561188-16563669(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAACGGTCATTTAAC
SmilChr07G000875 Chr07 NC_080393.1:6269504-6269518promoter 内 666-680 bp - 3321 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 6259930-6266183(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAACAGTTACCGTTG
SmilChr04G002777 Chr04 NC_080390.1:43580693-43580707promoter 内 233-247 bp - 3754 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 43575176-43576939(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TCATAATGACCGTTA
SmilChr07G004685 Chr07 NC_080393.1:59803042-59803056promoter 内 3953-3967 bp + 34 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 59798099-59803008(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCAATTCAG
SmilChr01G001137 Chr01 NC_080387.1:23165984-23165998promoter 内 3952-3966 bp - 35 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 23166033-23167776(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCGAAAATG
SmilChr02G002170 Chr02 NC_080388.1:38912800-38912814promoter 内 3820-3834 bp + 167 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 38912981-38915528(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 GAAAATAGACCGTTG
SmilChr01G005676 Chr01 NC_080387.1:73045175-73045189promoter 内 3693-3707 bp - 294 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 73045483-73045929(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTAAATTTGA
SmilChr05G004044 Chr05 NC_080391.1:54408973-54408987promoter 内 3650-3664 bp + 337 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 54407526-54408636(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCATTGTCT
SmilChr02G000730 Chr02 NC_080388.1:11841002-11841016promoter 内 3490-3504 bp - 497 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 11841513-11842947(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTTGATTTTG
SmilChr06G000435 Chr06 NC_080392.1:3570494-3570508promoter 内 3401-3415 bp + 586 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 3566917-3569908(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTTAAGAATT
SmilChr08G003335 Chr08 NC_080394.1:34643079-34643093promoter 内 3111-3125 bp - 876 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 34643969-34645466(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCCGATTGA
SmilChr05G000285 Chr05 NC_080391.1:2205766-2205780promoter 内 3075-3089 bp - 912 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 2202419-2204854(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAAATCGAACCGTTG
SmilChr07G001355 Chr07 NC_080393.1:10505762-10505776promoter 内 2943-2957 bp + 1044 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 10506820-10510239(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CGAAATCGACCGTTG
SmilChr05G000286 Chr05 NC_080391.1:2205766-2205780promoter 内 2886-2900 bp - 1101 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 2206881-2213310(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTTCGATTTA
SmilChr08G003510 Chr08 NC_080394.1:37657179-37657193promoter 内 2675-2689 bp + 1312 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 37658505-37660864(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TGTATATAACCGTTG
SmilChr04G001825 Chr04 NC_080390.1:29793590-29793604promoter 内 2673-2687 bp + 1314 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 29794918-29797030(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAAATCCTACCGTTG
SmilChr08G002642 Chr08 NC_080394.1:25874875-25874889promoter 内 2428-2442 bp + 1559 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 25876448-25877837(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TGAAACTTACCGTTG
SmilChr05G003866 Chr05 NC_080391.1:52262474-52262488promoter 内 2367-2381 bp + 1620 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 52264108-52269980(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CCTTTGTAACCGTTG
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SmilChr05G002103 Chr05 NC_080391.1:22039688-22039702promoter 内 1503-1517 bp - 2484 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 22033520-22037204(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 GTTAAATGACCGTTA